河南省玉米斑病菌群體遺傳結(jié)構(gòu)、交配型與抗藥性分析
【學(xué)位單位】:河南科技大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位年份】:2019
【中圖分類】:S435.131.4
【部分圖文】:
圖 2-1 48 株玉米大斑病菌的 UPGMA 聚類分析Fig. 2-1 UPGMA dendrogram of 48 Exserhilum turcicum isolates2.2.6 各群體間的遺傳關(guān)系分析8 個地理群體遺傳一致度和遺傳距離見表 2-5。表 2-5 玉米大斑病菌群體間的遺傳一致度和遺傳距離Table2-5 Genetic distance and genetic identity among populations群體 平頂山 洛陽 南陽 安陽 焦作 新鄉(xiāng) 三門峽 周口平頂山 **** 0.7356 0.8365 0.6285 0.6991 0.4959 0.5079 0.5026洛陽 0.3071 **** 0.7808 0.4316 0.6591 0.4202 0.6329 0.5714南陽 0.1785 0.2474 **** 0.7007 0.7890 0.5503 0.5812 0.5025安陽 0.4645 0.8402 0.3557 **** 0.7597 0.5060 0.4471 0.3980焦作 0.3579 0.4169 0.2370 0.2749 **** 0.6306 0.6140 0.5386新鄉(xiāng) 0.7014 0.8670 0.5974 0.6813 0.4611 **** 0.6979 0.6763三門峽 0.6775 0.4574 0.5426 0.8049 0.4877 0.3597 **** 0.8532
構(gòu)分析e 軟件處理分析結(jié)果可以得到 K=2 時的 DeltaK南省玉米大斑病菌群體來自 2 個理論祖先亞群傳結(jié)構(gòu)圖(圖 2-3),從圖中可以看出,河南、亞群Ⅱ所占比例分別為 54.48%和 45.52%。比例不同可將河南省玉米大斑病菌劃分為 C1)和 C2(單個菌株中亞群Ⅱ占比 50%以上)2,C2 類群包括 22 個菌株。類群 C1 中 J2、49、41、74、J7、J24、72、78、J53、79、2群Ⅰ所占比例達(dá)到了 90%以上;類群 C2 中 、7、J55、J42、42、6、J41、J16、71、50、2比例達(dá)到了 90%以上。這些結(jié)果說明大多數(shù)菌2 個亞群菌株間遺傳物質(zhì)交流很少。
注:紅色色塊為亞群 I;綠色色塊為亞群 IINote: Red represented subpopulation I; Green represented subpopulation II圖 2-3 基于混合模型的河南省玉米大斑病菌群體遺傳結(jié)構(gòu)(K=2)Fig. 2-3 The genetic structure of E.turcicum population from Henan based on a mixed mode(K=2)2.2.8 主成分分析使用 Ntsys pc2.0 軟件對 48 株玉米大斑病菌 SSR 標(biāo)記的數(shù)據(jù)矩陣進(jìn)行主成分分析,第 1 和第 2 主坐標(biāo)的貢獻(xiàn)率分別為 30.2%和 12.5%,進(jìn)一步繪制第 1 和第 2 主坐標(biāo)二維圖(圖 2-4),從圖中可以看出,遺傳相似系數(shù)為 1 的菌株重疊為一個點。UPGMA 聚類中類群Ⅰ的 38 個菌株聚在一起,類群Ⅱ的 10 個菌株聚在一起。以上結(jié)果可以看出主成分分析結(jié)果和 UPGMA 聚類分析結(jié)果完全一致。
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