跨膜型肽聚糖識別蛋白RfPGRP-L1在紅棕象甲與其腸道菌群共生關(guān)系維持中的作用解析
發(fā)布時間:2020-12-02 15:51
紅棕象甲Rhynchophorus ferrugineus Olivier是一種對我國城市綠化和海岸生態(tài)環(huán)境安全帶來嚴重威脅的害蟲。已經(jīng)有研究證實,在該害蟲的腸道中存在著大量的細菌,這些細菌在紅棕象甲的營養(yǎng)代謝中有十分重要的作用。紅棕象甲幼蟲的生活環(huán)境中既有有害微生物也有有益微生物,其高效的免疫防御策略能夠在保護自身不受環(huán)境中有害微生物的侵害,同時又能利用環(huán)境中的有益微生物。因此,紅棕象甲需要精確的識別有害微生物并且消滅它們來維持自身腸道菌群的動態(tài)平衡。肽聚糖識別蛋白(PGRPs,peptidoglycan recognition proteins)能夠識別由病原細菌產(chǎn)生并且釋放的肽聚糖(PGN,peptidoglycan),然后激活昆蟲免疫反應(yīng)。因此,PGRPs可能在宿主昆蟲腸道菌群穩(wěn)態(tài)的維持中扮演著重要的角色。本文研究發(fā)現(xiàn),紅棕象甲的肽聚糖識別蛋白RfPGRP-L1是一種不具有酰胺酶活性的長型跨膜肽聚糖識別蛋白。隨后,我們使用RT-qPCR、RNA干擾和細菌16S rRNA測序等多種技術(shù)手段研究了該蛋白在紅棕象甲腸道菌群穩(wěn)態(tài)維持中的作用。經(jīng)RT-qPCR檢測發(fā)現(xiàn),RfPGRP-L1...
【文章來源】:福建農(nóng)林大學福建省
【文章頁數(shù)】:65 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
黑腹果蠅腸道免疫對病原菌和共生微生物的差異調(diào)節(jié)模型(Leeetal.,2013)
162-1 紅棕象甲 RfPGRP-L1 編碼的氨基酸序列保守結(jié)構(gòu)域分析(A)及結(jié)構(gòu)域展示圖(Figure 2-1 Amino acid sequence analysis (A) and PGRP domain (B) of RfPGRP-L1.紅色字體的是起始密碼子和終止密碼子,黑色下劃線表示跨膜結(jié)構(gòu)域,紅色方框的RHIM motif,灰色底色表示 PGRP 結(jié)構(gòu)域,藍色字體表示 Ami_2 結(jié)構(gòu)域)e start and stop codon are in red. The transmembrane region is underlined. The RHIM moin red frame. The PGRP domain is in gray. The Ami_2 domain is in blue.
圖 2-2 紅棕象甲 RfPGRP-L1 與其他昆蟲 PGRPs 氨基酸序列多重比對gure 2-2 Multiple alignment and secondary structure prediction of RfPGRP形“●”表示酰胺酶活性所需的氨基酸,黃色方塊“■”表示 DmPGRP需的氨基酸)和二級結(jié)構(gòu)預測(藍色粗實線“▃”表示 -螺旋,黑色粗實表示 β-折疊)en circle (●) means the amino acid residues are required for amidase activity. Ts (■) indicated the amino acid residues are required for DmPGRP-LCx bindinglue thick solid line (▃) indicates the -helix. The black thick solid line (▃) indiβ-fold.RPs GenBank 登錄號:Ha-B (Helicoverpa armigera-B,AFP23116); Ha-C (Hera-C, AFP23117); Tc-SC2 (Tribolium castaneum-SC2, XP_008193407.1); CqPx quinquefasciatus-LC, XP_001867002.1); DmPGRP-LE (Drosophila melanoga32064.1); DmPGRP-LCx (Drosophila melanogaster-LCx, ACZ94668.1); DmPGsophila melanogaster-SD, CAD89197.1); DmPGRP-SA (Drosophila melanogas89125.1); DmPGRP-SC2 (Drosophila melanogaster-SC2, CAD89178.1); AaPGAedes aegypti-LB, XP_001654275.2); DmPGRP-LB (Drosophila melanogaster-AF207537_1).RPs from GenBank: Ha-B (Helicoverpa armigera-B, AFP23116); Ha-C (Helicoera-C, AFP23117); Tc-SC2 (Tribolium castaneum-SC2, XP_008193407.1); CqP
【參考文獻】:
期刊論文
[1]肽聚糖識別蛋白AaPGRP-LC參與埃及伊蚊的抗細菌免疫反應(yīng)[J]. 楊青泰,趙莉藺,鄒振,王燕紅,馬瑞燕. 昆蟲學報. 2018(01)
[2]室內(nèi)飼養(yǎng)紅棕象甲的行為觀察[J]. 李磊,覃偉權(quán),黃山春,魏娟,馬子龍. 昆蟲知識. 2009(06)
[3]紅棕象甲在中國的風險性分析[J]. 覃偉權(quán),李朝緒,黃山春. 江西農(nóng)業(yè)學報. 2009(09)
[4]銹色棕櫚象生活習性與防治試驗[J]. 張岳峰,唐國良,王玲,裴正偉,唐連鋒. 中國森林病蟲. 2008(03)
[5]警惕外來危險性害蟲紅棕象甲入侵為害[J]. 童四和,曾珉,溫小遂,施明清. 江西植保. 2007(03)
[6]紅棕象甲、雙鉤異翅長蠹二種有害生物在貴州的風險分析[J]. 張金海. 貴州林業(yè)科技. 2007(02)
[7]紅棕象甲在中國擴散的風險分析[J]. 李偉豐,姚衛(wèi)民. 熱帶作物學報. 2006(04)
[8]警惕外來危險害蟲紅棕象甲的擴散[J]. 鞠瑞亭,李躍忠,杜予州,池杏珍,嚴巍,徐穎. 昆蟲知識. 2006(02)
碩士論文
[1]肽聚糖識別蛋白RfPGRP-S1在紅棕象甲腸道菌群穩(wěn)態(tài)維持過程中的作用機理[D]. 王興紅.福建農(nóng)林大學 2018
本文編號:2895534
【文章來源】:福建農(nóng)林大學福建省
【文章頁數(shù)】:65 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
黑腹果蠅腸道免疫對病原菌和共生微生物的差異調(diào)節(jié)模型(Leeetal.,2013)
162-1 紅棕象甲 RfPGRP-L1 編碼的氨基酸序列保守結(jié)構(gòu)域分析(A)及結(jié)構(gòu)域展示圖(Figure 2-1 Amino acid sequence analysis (A) and PGRP domain (B) of RfPGRP-L1.紅色字體的是起始密碼子和終止密碼子,黑色下劃線表示跨膜結(jié)構(gòu)域,紅色方框的RHIM motif,灰色底色表示 PGRP 結(jié)構(gòu)域,藍色字體表示 Ami_2 結(jié)構(gòu)域)e start and stop codon are in red. The transmembrane region is underlined. The RHIM moin red frame. The PGRP domain is in gray. The Ami_2 domain is in blue.
圖 2-2 紅棕象甲 RfPGRP-L1 與其他昆蟲 PGRPs 氨基酸序列多重比對gure 2-2 Multiple alignment and secondary structure prediction of RfPGRP形“●”表示酰胺酶活性所需的氨基酸,黃色方塊“■”表示 DmPGRP需的氨基酸)和二級結(jié)構(gòu)預測(藍色粗實線“▃”表示 -螺旋,黑色粗實表示 β-折疊)en circle (●) means the amino acid residues are required for amidase activity. Ts (■) indicated the amino acid residues are required for DmPGRP-LCx bindinglue thick solid line (▃) indicates the -helix. The black thick solid line (▃) indiβ-fold.RPs GenBank 登錄號:Ha-B (Helicoverpa armigera-B,AFP23116); Ha-C (Hera-C, AFP23117); Tc-SC2 (Tribolium castaneum-SC2, XP_008193407.1); CqPx quinquefasciatus-LC, XP_001867002.1); DmPGRP-LE (Drosophila melanoga32064.1); DmPGRP-LCx (Drosophila melanogaster-LCx, ACZ94668.1); DmPGsophila melanogaster-SD, CAD89197.1); DmPGRP-SA (Drosophila melanogas89125.1); DmPGRP-SC2 (Drosophila melanogaster-SC2, CAD89178.1); AaPGAedes aegypti-LB, XP_001654275.2); DmPGRP-LB (Drosophila melanogaster-AF207537_1).RPs from GenBank: Ha-B (Helicoverpa armigera-B, AFP23116); Ha-C (Helicoera-C, AFP23117); Tc-SC2 (Tribolium castaneum-SC2, XP_008193407.1); CqP
【參考文獻】:
期刊論文
[1]肽聚糖識別蛋白AaPGRP-LC參與埃及伊蚊的抗細菌免疫反應(yīng)[J]. 楊青泰,趙莉藺,鄒振,王燕紅,馬瑞燕. 昆蟲學報. 2018(01)
[2]室內(nèi)飼養(yǎng)紅棕象甲的行為觀察[J]. 李磊,覃偉權(quán),黃山春,魏娟,馬子龍. 昆蟲知識. 2009(06)
[3]紅棕象甲在中國的風險性分析[J]. 覃偉權(quán),李朝緒,黃山春. 江西農(nóng)業(yè)學報. 2009(09)
[4]銹色棕櫚象生活習性與防治試驗[J]. 張岳峰,唐國良,王玲,裴正偉,唐連鋒. 中國森林病蟲. 2008(03)
[5]警惕外來危險性害蟲紅棕象甲入侵為害[J]. 童四和,曾珉,溫小遂,施明清. 江西植保. 2007(03)
[6]紅棕象甲、雙鉤異翅長蠹二種有害生物在貴州的風險分析[J]. 張金海. 貴州林業(yè)科技. 2007(02)
[7]紅棕象甲在中國擴散的風險分析[J]. 李偉豐,姚衛(wèi)民. 熱帶作物學報. 2006(04)
[8]警惕外來危險害蟲紅棕象甲的擴散[J]. 鞠瑞亭,李躍忠,杜予州,池杏珍,嚴巍,徐穎. 昆蟲知識. 2006(02)
碩士論文
[1]肽聚糖識別蛋白RfPGRP-S1在紅棕象甲腸道菌群穩(wěn)態(tài)維持過程中的作用機理[D]. 王興紅.福建農(nóng)林大學 2018
本文編號:2895534
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