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橋山古側(cè)柏群的遺傳多樣性分析及黃帝手植柏DNA指紋圖譜的構建

發(fā)布時間:2020-11-14 22:09
   側(cè)柏是我國重要的造林樹種,具有水土保持、防風固沙、園林綠化等作用。黃帝陵所在的橋山古側(cè)柏群體存在豐富的基因資源,探討該古側(cè)柏群體的遺傳多樣性,制定合適的基因資源保護策略,對于側(cè)柏基因資源的保護和利用具有重要意義。黃帝手植柏位于黃帝陵軒轅廟的院內(nèi),相傳它為軒轅黃帝親手栽植,被認為是世界上最古老的側(cè)柏,具有重要的科學和文化價值。但是,利用表型性狀對黃帝手植柏的克隆植株進行鑒定較為困難。本文將利用SRAP分子標記技術對橋山的古側(cè)柏群及黃帝手植柏進行分析,探討該古側(cè)柏群的遺傳多樣性,構建黃帝手植柏DNA指紋圖譜,為黃帝陵古側(cè)柏群基因資源保護與黃帝手植柏及其克隆植株的分子鑒定提供依據(jù)。主要研究結果如下:(1)22對引物組合共擴增出272個條帶,其中多態(tài)性條帶188個,多態(tài)性比率為69.12%;引物組合Me3Em15和Me4Em9的多態(tài)性比率高達100%,多態(tài)性比率最小的為引物組合Me4Em10,為52.94%;每個引物組合平均擴增出多態(tài)性條帶8個。在相似系數(shù)為0.68處,可以將古側(cè)柏分為5類,黃帝手植柏自成一類,第二類包括17株,第三類包括6株,第四類包括4株,第五類包括2株。(2)找到黃帝手植柏特異標記6個,分別為:Me4Em9-150、Me4Em9-1600、Me4Em9-1700、Me10Em4-80、Me10Em4-90、Me10Em4-120。利用這6個標記同時對黃帝手植柏進行鑒定,發(fā)生錯誤的概率為5.4×10~(-8)%,正確的概率為99.9999999%。說明這6個標記可以作為黃帝手植柏的DNA指紋圖譜,對黃帝手植柏進行分子鑒定。
【學位單位】:西北農(nóng)林科技大學
【學位級別】:碩士
【學位年份】:2018
【中圖分類】:S718.5
【部分圖文】:

引物組合,橋山,相似系數(shù),黃帝


圖3-1 引物組合Me3Em4的擴增結果Figure 3-1 Fingerprint of primer combination Me3Em4注:泳道1為Marker,泳道2為黃帝手植柏,其它泳道為采自橋山的古側(cè)柏。Note: Lane 1 is molecular weight marker. Lane 2 is DNA fingerprint of the old Chinese arborvitae plantedby Huang Di. The rest lanes are DNA fingerprints of old trees from the Qiao mountain.3.1.2 聚類分析利用 SRAP 數(shù)據(jù)計算了橋山古側(cè)柏群體內(nèi)各植株之間的相似系數(shù)(表 3-2),相似系數(shù)的范圍為 0.48~0.85。圖 3-2 是聚類分析的結果,在相似系數(shù)為 0.68 處,可以將古側(cè)柏分為 5 類,黃帝手植柏自成一類,第二類包括 17 株,第三類包括 6 株

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圖3-2 古側(cè)柏植株的聚類分析圖Figure 3-2 Dendrogram showing genetic relationships among the old trees.注:編號1為黃帝手植柏,其它為采自橋山的古側(cè)柏。Note: No. 1 is the old Chinese arborvitae planted by Huang Di. The rest are old trees from the Qiaomountain.3.2 黃帝手植柏 DNA 指紋圖譜的構建利用篩選出的 22 對引物組合對采自橋山的 30 株古側(cè)柏及黃帝手植柏進行了分析,找到黃帝手植柏特異標記 6 個,分別為:Me4Em9-150、Me4Em9-1600、Me4Em9-1700、Me10Em4-80、Me10Em4-90、Me10Em4-120(圖 3-3、圖 3-4)。14

引物組合,黃帝,橋山,特異標記


圖3-3 引物組合Me4Em9的擴增結果Figure 3-3 Fingerprint of primer combination Me4Em9注:泳道9為Marker,泳道10為黃帝手植柏,其它泳道為采自橋山的古側(cè)柏。箭頭所示為黃帝手植柏特異標記Me4Em9-150、Me4Em9-1600、 Me4Em9-1700。Note: Lane 9 is molecular weight marker. Lane 10 is DNA fingerprint of the old Chinese arborvitae plantedby Huang Di. The rest lanes are DNA fingerprints of old trees from the Qiao mountain. The arrows indicatethe rare DNA fragments of the old Chinese arborvitae planted by Huang Di (Me4Em9-150, Me4Em9-1600,Me4Em9-1700).圖3-4 引物組合Me10Em4的擴增結果Figure 3-4 Fingerprint of primer combination Me10Em4注:泳道5為Marker,泳道6為黃帝手植柏,其它泳道為采自橋山的古側(cè)柏。箭頭所示為黃帝手植柏的特異標記Me10Em4-80、Me10Em4-90、Me10Em4-120。Note: Lane 5 is molecular weight marker. Lane 6 is DNA fingerprint of the old Chinese arborvitae plantedby Huang Di. The rest lanes are DNA fingerprints of old trees from the Qiao mountain. The arrows indicatethe rare DNA fragments of the old Chinese arborvitae planted by Huang Di (Me10Em4-80, Me10Em4-90,Me10Em4-120).
【參考文獻】

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本文編號:2884002

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