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甘藍型油菜三系骨干親本的遺傳多樣性分析

發(fā)布時間:2020-11-04 16:24
   甘藍型油菜是我國種植面積最大的油料作物,其雜種優(yōu)勢顯著。甘藍型油菜是油菜的主要栽培種之一,與蕓薹屬其他物種相比,其遺傳基礎(chǔ)相對狹窄,可利用資源匱乏。植物育種水平的提升需要不斷創(chuàng)制利用新的遺傳資源、導(dǎo)入和聚合不同的優(yōu)良性狀。遺傳多樣性研究是種質(zhì)資源評價和雜種優(yōu)勢利用的重要基礎(chǔ)。在一定范圍內(nèi),親本的遺傳差異越大,雜種優(yōu)勢則越顯著。因此,充分了解親本材料的遺傳多樣性,將親本材料劃分為不同的雜種優(yōu)勢群,有助于指導(dǎo)強優(yōu)勢雜交組合的選配,從而更為有效地利用雜種優(yōu)勢。本研究選擇30份油菜三系骨干親本,對其主要農(nóng)藝性狀進行觀察;利用SSR(Simple Sequence Repeats,簡單序列重復(fù))和SRAP(Sequence-related Amplified Polymorphism,相關(guān)序列擴增多態(tài)性)標記對上述30份材料(另外包括1份芥菜型油菜和1份白菜型油菜為參照種)進行遺傳多樣性評價,為油菜雜種優(yōu)勢育種提供參考。所得研究結(jié)果如下:1.通過對30份親本材料進行農(nóng)藝性狀和品質(zhì)性狀等11個性狀的AMOVA分析表明,供試材料在區(qū)組間的變異程度達到極顯著水平。聚類分析及主成分分析表明,大部分保持系和恢復(fù)系材料被分開。方差分析顯示,品種間變異系數(shù)為86.40%,保持系和恢復(fù)系材料間僅為13.60%;保持系和恢復(fù)系材料內(nèi)部差異大于它們之間的差異。結(jié)果說明,參試恢復(fù)系和保持系材料間存在一定的遺傳差異。2.從43對SRAP引物組合中篩選到12對多態(tài)性高、條帶清晰的引物,用于32個參試材料的擴增,共檢測到多態(tài)性條帶77個,平均每對引物組合檢測到6.4個多態(tài)性條帶,平均多態(tài)性比率為98.72%。每對引物可擴增出4~9個多態(tài)性位點。其中引物組合Em5+Me22、Em5+Me23擴增的多態(tài)性條帶最多(9),引物組合Em5+Me30及Em12+Me18僅擴增出4個多態(tài)性位點。SRAP引物組合PIC(Polymorphism Information Content,多態(tài)性信息含量)值在0.47(Em14+Me20)~0.78(Em14+Me22)之間,平均為0.59。3.從36對SSR引物中篩選出8對擴增結(jié)果穩(wěn)定的多態(tài)性引物,用于32份參試材料的擴增分析。結(jié)果共擴增得到51個位點,其中多態(tài)性位點49個,平均多態(tài)性位點6.13個,平均多態(tài)性比率為96.08%。每對引物可擴增出3~8個多態(tài)性位點,其中引物BrgMS343擴增出8個多態(tài)性位點,引物BrgMS629擴增出3個多態(tài)性位點。SSR引物組合PIC值介于0.22(BrgMS90)~0.65(BrgMS629)之間,平均為0.43。4.利用SSR和SRAP標記對32份供試油菜材料進行分子聚類分析,結(jié)果顯示,在遺傳相似系數(shù)0.65處,參試材料被分為三大類。第I類包括19個材料,其中14個為恢復(fù)系,如Q10C、Sh11、Q7C、S11R、Z821R等;5個為保持系,Zhong 4、CZ49、ZY18、2010B7和New B1。第II類包括10個材料,除1個為恢復(fù)系(Y6)外,其余9個為保持系。第III類包括ZY72、芥菜型油菜(No.31)和白菜型油菜(No.32)3個材料。分子主成分分析、群體結(jié)構(gòu)分析與聚類結(jié)果基本一致。分子方差分析顯示,保持系和恢復(fù)系群體內(nèi)方差分量為95.46%,群體間為4.54%;保持系內(nèi)(44.02%)與恢復(fù)系內(nèi)(41.20%)差異基本一致,保持系與恢復(fù)系材料間差異最小(2.03%)。
【學(xué)位單位】:西北農(nóng)林科技大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位年份】:2018
【中圖分類】:S565.4
【部分圖文】:

矩陣圖,油菜籽,保持系,最小方差


油菜三系骨干親本的分子遺傳多樣性分析類分析據(jù) 11 個農(nóng)藝性狀的原始數(shù)據(jù),利用 ward’s 最小方差方法對 30 份油菜供試材分析,并構(gòu)建聚類圖(圖 3-1)。當遺傳距離的臨界值為 39.73 時,將 30 份為三大類(Cluster I~III):Cluster I 包括 16 個材料,其中 12 個為恢復(fù)系,QY211R、Z821R、S11R、QSC 等;4 個為保持系,2010B7、New B1、Zhng 9。Cluster II 包括 10 個材料,其中 7 個為保持系,如 2012B1、H15、Zh為恢復(fù)系,HYZ01R、2000-5R 和 D1526。Cluster III 包括 4 個材料,ZY72、18 和 CZ49,均為保持系。結(jié)果說明,參試恢復(fù)系和保持系材料間存在一定。

農(nóng)藝性狀,坐標圖,油菜,主成分


91011PC2=0.3015X1+0.4600X2+0.3322X3+0.3259X4-0.2079X5+0.1214X6+0.3622X7-0.3294X9-0.2587X10+0.0730X11X1-X11的含義如表 3-1 所示。結(jié)果表明,PC1 與主花序有效長度(X4)、主花序有效角果數(shù)(X5)、單株角)、角果長度(X7)、千粒重(X9)、單株產(chǎn)量(X10)和含油量(X11)呈顯,與株高(X1)和一次有效分枝數(shù)(X3)呈顯著負相關(guān);PC2 與株高(X1)、(X2)、一次有效分枝數(shù)(X3)、主花序有效長度(X4)和角果長度(X7),與主花序有效角果數(shù)(X5)、每角粒數(shù)(X8)、千粒重(X9)和單株產(chǎn)量相關(guān)。主成分分析(PCA)結(jié)果與聚類分析結(jié)果相似。從 PCA 分析結(jié)果(圖 3-2)中,30 份材料主要被劃分為 3 大類。除 Zhong 5(No.17)、2010B1(No.21)o.22)與 2010B7(No.24)4 個材料外,其余 11 個恢復(fù)系材料都被劃為一起,分析結(jié)果(Cluster I)基本一致;大部分保持系材料也被劃在一起;Q10C(Ng 9 III(No.19)和 CZ49(No.29)3 個材料在聚類分析中歸為第三類。

示意圖,引物,株系,遺傳多樣性


油菜三系骨干親本的分子遺傳多樣性分析第四章 SRAP 及 SSR 標記結(jié)果與分析1 SRAP 和 SSR 標記的篩選從 43 對 SRAP 引物中篩選出 12 對遺傳多樣性明顯穩(wěn)定的引物,并將這 12 對于 32 個株系擴增獲得多樣性條帶。從 36 對 SSR 引物中篩選出 8 對遺傳多樣性定的引物,并將這 8 對引物用于 32 個株系擴增獲得多樣性條帶。SRAP 引物參照 Zhang 等(2017)中的引物,由楊凌尚吾科教器材公司合成上游引物和 43 條下游引物一一對應(yīng)成 43 對引物組合,用于隨機選擇的 5 個株系篩選出 12 對擴增條帶豐富、清晰、可重復(fù)的引物組合用于株系擴增。圖 4-1 為的理想的多態(tài)性引物示意圖。
【參考文獻】

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本文編號:2870327

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