發(fā)布時(shí)間：2024-06-14 21:06

　　線粒體是真核生物所不可或缺的雙層膜結(jié)構(gòu)的細(xì)胞器,動(dòng)物線粒體DNA (mitochondrial DNA)具有進(jìn)化速度快,嚴(yán)格母系遺傳,不存在基因重組等特征,因此是基因功能研究和物種遺傳進(jìn)化研究的好材料。 北方須鰍(Barbatula toni)隸屬于鯉形目、鰍科、條鰍亞科、須鰍屬,本研究通過參考北方須鰍的近緣物種須鰍的線粒體基因組全序列,共計(jì)設(shè)計(jì)了26對引物,采用溫度梯度PCR技術(shù)擴(kuò)增出了北方須鰍線粒體基因組的全序列,然后運(yùn)用相關(guān)軟件對其進(jìn)行分析研究,結(jié)合NCBI中已公布的鰍科魚類的線粒體基因組信息,構(gòu)建鰍科魚類系統(tǒng)發(fā)育樹,研究結(jié)論如下： 1.北方須鰍線粒體基因組全長16619bp,其中4721個(gè)堿基A,占28.4%,2978個(gè)堿基G,占17.9%,4399個(gè)堿基T,占26.5%,4521個(gè)堿基C,占27.2%,A+T含量為54.9%,明顯大于G+C含量,其中D-loop區(qū)A+T的含量最高,達(dá)到67.3%。 2.北方須鰍線粒體基因組總共編碼37個(gè)基因,即13個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因(PCGs),2個(gè)rRNA基因,22個(gè)tRNA基因與1個(gè)控制區(qū)序列。其中Gln、 Pro、 Ala、 Cys、 A...

【文章頁數(shù)】：64 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
縮略語表
第一章 前言
    1.1 線粒體概述
        1.1.1 線粒體簡介
        1.1.2 線粒體基因組的大小和組成
    1.2 線粒體基因組的特征
        1.2.1 線粒體基因組的結(jié)構(gòu)特征
        1.2.2 線粒體基因組的遺傳特征
        1.2.3 線粒體基因組的進(jìn)化特征
    1.3 線粒體基因組的研究方法
        1.3.1 線粒體DNA的提取和擴(kuò)增
        1.3.2 線粒體DNA的序列測定
        1.3.3 線粒體DNA的拼接和注釋
    1.4 魚類線粒體基因組研究進(jìn)展
        1.4.1 線粒體DNA多態(tài)性在魚類分子遺傳學(xué)中的研究進(jìn)展
        1.4.2 線粒體DNA在魚類分子系統(tǒng)學(xué)上的研究進(jìn)展
    1.5 研究的目的與意義
        1.5.1 鰍科簡介及分類概況
        1.5.2 研究物種介紹
        1.5.3 本研究的目的與意義
第二章 材料和方法
    2.1 實(shí)驗(yàn)材料及用具
        2.1.1 生物樣品的采集與鑒定
        2.1.2 實(shí)驗(yàn)儀器
        2.1.3 實(shí)驗(yàn)試劑
        2.1.4 生物信息學(xué)分析軟件
    2.2 實(shí)驗(yàn)方法
        2.2.1 總DNA的提取
        2.2.2 總DNA的檢測
        2.2.3 PCR的引物設(shè)計(jì)
        2.2.4 PCR的擴(kuò)增和檢測
        2.2.5 PCR產(chǎn)物測序
    2.3 數(shù)據(jù)處理和分析
        2.3.1 線粒體基因組序列的拼接和注釋
        2.3.2 線粒體基因組分析
    2.4 鰍科魚類的系統(tǒng)發(fā)育分析
        2.4.1 數(shù)據(jù)的收集
        2.4.2 系統(tǒng)進(jìn)化樹的建立
第三章 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與討論
    3.1 總DNA提取結(jié)果
    3.2 PCR擴(kuò)增結(jié)果
    3.3 北方須鰍線粒體基因組全序列結(jié)果分析
        3.3.1 北方須鰍線粒體基因組結(jié)構(gòu)
        3.3.2 北方須鰍核苷酸組成
        3.3.3 北方須鰍線粒體基因組蛋白質(zhì)編碼基因分析
        3.3.4 北方須鰍線粒體基因組tRNA基因和rRNA基因的結(jié)構(gòu)分析
        3.3.5 北方須鰍線粒體基因組控制區(qū)(D-loop區(qū))
    3.4 鰍科魚類系統(tǒng)發(fā)育分析
        3.4.1 根據(jù)12SrRNA和16SrRNA基因的鰍科魚類系統(tǒng)發(fā)育分析
第四章 討論
    4.1 PCR實(shí)驗(yàn)條件優(yōu)化
    4.2 北方須鰍線粒體基因組和其他魚類線粒體基因組比較
    4.3 鰍科魚類的系統(tǒng)發(fā)育
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝



本文編號：3994421