蘋果免疫基因MdFLS2的克隆與擬南芥轉(zhuǎn)化功能鑒定
【學(xué)位單位】:山東農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位年份】:2017
【中圖分類】:S661.1;Q943.2
【部分圖文】:
圖 1.植物和動物受體蛋白激酶的共同反應(yīng)模式Fig.1. Common themes in plant and animal receptor protein kinases.(Shin-Han Shiu et al, 2001)體樣蛋白激酶的功能在生長過程中總會接觸許多的外界信號,作為受體激酶,RLKs 參與植發(fā)育,激素信號轉(zhuǎn)導(dǎo)和植物中的生物和非生物脅迫的應(yīng)對機制(Li et al為透徹的 LRR-RLK 為例,在擬南芥中,EMS1(excess microsporocy 和小肽 TPD1(tapetum determinant1)在花藥細(xì)胞的分化中起著重要作用。變體的擬南芥花藥缺乏絨氈層細(xì)胞,但產(chǎn)生額外的微孢子體細(xì)胞,雖它的工作原理,但是影響擬南芥的花藥分化是毋庸質(zhì)疑的。(Zhao et al., 2003, Canales C et al., 2002, Wang et al., 2012)。BRI1(brasinosteroid ins菜素誘導(dǎo)途徑中重要的受體蛋白。參與了 BR 信號的感知和早期的信號植物細(xì)胞壁的生物合成(Xu et al,2008),GSO 和 RPK1 參與植物胚to R et al., 2008),OsGIRL1 與水稻的鹽脅迫,熱脅迫等緊密相關(guān)(Park
圖 2 FLS2 信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑Fig.2 FLS2 signalling pathway (Silke Robatzek et al., 2012)1.3.3 FLS2 表達(dá)的空間和空間上的差異性植物不同于動物,由于植物缺乏像動物一樣;拿庖呒(xì)胞,每一個單獨的植物細(xì)胞都應(yīng)該具有識別和發(fā)現(xiàn)病原體并且將這個信號傳導(dǎo)出去的能力,這就需要FLS2在植物組織中的組成型表達(dá),最近,在植物的各個組分,包括幼苗,葉子,和根中都發(fā)現(xiàn)了flg22引發(fā)的防御反應(yīng)現(xiàn)象(Zipfel et al., 2004; Millet et al., 2010; Jacobs et al., 2011),這些都表明flg22受體在幾乎所有組織中表達(dá),這與mRNA表達(dá)鑒定的結(jié)果和FLS2-綠色熒光蛋白(GFP)(Gomez-Gomez,Boller, 2000; Robatzek et al., 2006)的發(fā)現(xiàn)一致。在擬南芥中,F(xiàn)LS2的表達(dá)水平在植物組織中有明顯的空間性(Faulkner and Robatzek, 2012),一個非常顯著的例子,在擬南芥的根系中FLS2的表達(dá)量會顯著低于它在葉片中的表達(dá)量,具體來說,植物的根能被flg22激活,并且引發(fā)典型的防御反應(yīng)(Millet et al., 2010; Jacobset al., 2011);但是在主根中基本檢測不到FLS2的活性,只限于生長的側(cè)根等。而在葉片中的氣孔和創(chuàng)
3.1 MdFLS2 的基因的生物信息學(xué)分析3.1.1 MdFLS2 的蛋白質(zhì)性質(zhì)和進化樹分析在GDR上使用MdFLS2的蛋白序列BLAST得到其GDR登錄號為MDP0000254122,序列測定和分析表明,MdFLS2 存在于蘋果的第 5 條染色體上,CDS 序列包含兩個外顯子和一段內(nèi)含子,其開放閱讀框為 3473 bp,預(yù)測其完整的蛋白大小為 12.7 kD,共編碼1157 個氨基酸,預(yù)計等電點為 6.22。使用 MdFLS2 和 AtFLS2 的蛋白質(zhì)序列在 NCBI(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)上進行 Blast,與之將相似度高的 17 個不同物種植物的 FLS2 蛋白序列使用 MEGA5 軟件構(gòu)建相應(yīng)的進化樹(圖 3),圖中的比例尺 0.05 代表每 20 個氨基酸中有 1 個不同,從圖中可以看出 AtFLS2 和 MdFLS2 分別位于進化樹兩個不同的樹枝上,氨基酸序列上有一定的差別,因此研究 MdFLS2 在轉(zhuǎn)基因擬南芥中的功能和 AtFLS2 的功能是否具有相似性,它們的相關(guān)程度如何,這對研究 MdFLS2 的功能具有積極意義。
【參考文獻(xiàn)】
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