土壤中干巴菌菌絲體測定及分析
【學(xué)位單位】:云南大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位年份】:2019
【中圖分類】:S646
【部分圖文】:
2.1.3瓊脂糖凝膠電泳及測序??。玻蓿蹋校茫耶a(chǎn)物在2%瓊脂糖凝膠上電泳,GeneFinderTM染色,紫外透??射儀檢測見圖2。將有單一條帶的PCR產(chǎn)物送到昆明碩擎生物科技有限公司測??序,測序均未獲得有效序列,見圖2。??應(yīng)用上述物種的單拷貝基因引物,均未成功擴增出干巴菌的相應(yīng)基因片段。??15??
Figure?4?Sequencing?map?of?partial?primer?amplification?results?of?single?copy?gene?of??Thelephora?ganbajun?Zang??2.2.3干巴菌單拷貝基因的驗證??割膠回收:準(zhǔn)備A6、A14、A28、A45、A50和A51這6對引物擴增的PCR產(chǎn)??物,。玻颠玻校茫覕U增產(chǎn)物和5卟Unloading?buffer混勻,2%的瓊脂糖凝膠電??泳,PCR產(chǎn)物回收時做割膠回收。具體回收具體步驟按照從云南晨綠生物科技??有限公司購買的天根DNA純化回收試劑盒(貨號為:DP214)操作,把回收的??DNA放到-20°C保存?zhèn)溆谩??DNA片段兩端連接腺嘌呤:由于PCR試劑金牌MIX擴增的基因片段兩端沒有??連接腺嘌呤,回收的DNA片段兩端需要加入腺嘌呤。反應(yīng)體系為:回收產(chǎn)物??22??
?云南大學(xué)碩士畢業(yè)論文???的甘油溶液(按照1:?5的比例加入),固定在搖床上180轉(zhuǎn)37°C培養(yǎng)1?h,然??后放置于-20"C的冰箱中保存。??測序結(jié)果用seqMan和BioEdit軟件進行比對,30個插入載體中單克隆的序??列進行比對并與之前PCR擴增序列及從基因組中挑選出來的原單拷貝基因序??列比對,序列完全相同的有:引物A6、A28、A50和引物A51擴增的基因片段,??分別見圖5、圖6、圖7和圖8。因此引物A6、A28、A50和引物A51均為干??巴菌單拷貝基因特異性引物。??*e-1?G:::.?:?:?:?rarC/^.--GrA?■?:GG^r3*CGA:?;?.?:?rTCC:C.?;?.?T?:?A?久;《〇〇:.二〇;:-.|1*。簭V----:s:?/GG:1:??A4-2?a.-.?C?.3.?;;G5-..-3;.t5C;.??-?.:?G?:.?:?.?::■:.?.?.-3;.?.?.?S33;.?ACC?.?J--?CA?;?:r〇.?.?C?.?3?.?.Ci.:??--***-'?■ ̄-'
【參考文獻】
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