梨高密度遺傳連鎖圖譜構(gòu)建與石細(xì)胞性狀定位
【學(xué)位單位】:南京農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位年份】:2017
【中圖分類】:S661.2
【部分圖文】:
0.800;?17:>0.800 ̄0.850;?18:>0.850 ̄0.900;?19:>0.900 ̄0.950;20:>0.950—?1.000;21>1.000??2.2不同品種的石細(xì)胞含量的聚類分析??梨果實中總石細(xì)胞含量的變化范圍是從0.032?g到1.024g?(圖1-3),平均值是??0.227?g,變異系數(shù)為76%。根據(jù)聚類分析結(jié)果(圖1-2),可將所有的梨品種分為兩??大類群。??第一大類分為砂梨、白梨兩大品系,其根據(jù)石細(xì)胞含量又細(xì)分為不同的亞群,即??砂梨I、砂梨II、砂梨III、砂梨IV和白梨I、白梨II、白梨III。砂梨品種共37個,??石細(xì)胞含量的平均值為0.224?g,變化范圍為0.046-1.024?g?(圖1-3),變異系數(shù)為??86.85%;其中白梨品種共18個,石細(xì)胞含量的平均值為0.249?g,變化范圍為??0.032 ̄0.561g?(圖?1-3),變異系數(shù)為?66.16g。??砂梨品系I的石細(xì)胞含量區(qū)間為0.046?0.065?g,共5個,如‘龍泉19’,‘豐水’、??‘黃金梨’等;砂梨品系II的石細(xì)胞含量區(qū)間為0.101?0.143?g
的典型分布。通過果實石細(xì)胞含量的變異系數(shù)(0.705)可知被調(diào)査的群體個體間存在??著明顯的分離,均存在一定數(shù)量的超親類型,性狀在親本間具有一定的差異。??果實石細(xì)胞含量在群體中頻率分布見圖2-2所示,作圖頻率分布基本接近正態(tài)分??布,表明被調(diào)查的性狀受多基因控制,是典型的數(shù)量性狀,因而用此雙親構(gòu)建群體有??可能獲得控制梨果實相關(guān)性狀的QTL。??表2-2果實石細(xì)胞含量正態(tài)分布檢測??Table?4-1?Test?of?normal?distribution?for?stone?cell?content?in?mapping?population??mi?ii?標(biāo)準(zhǔn)差?變異系數(shù)?5ii??Trait?Mean?SD?CV?(%)?Kurtosis?Skewness??石細(xì)胞含量?0.152?0A01?0.705?9.982?2.433??Mb??3(^??〇?i??將s??遐?I?J??r?\??1?1?1?1?M?1?Ir^LJ—.—.??〇〇〇?〇?|〇?0?20?O?iO?040?0?50?0.60?0?70?080??石細(xì)胞含量范圍?Range?of?stone?cell?content??圖2-2?FI后代石細(xì)胞含量在群體中的頻率分布??Fig.2-2?The?frequency?distribution?of?stone?cell?content?of?FI?in?p
1.2.2測序?qū)嶒??用干冰將提取的DNA運輸至深圳華大基因科技服務(wù)有限公司,采用??IlluminaHiSea2000儀進行測序工作。具體建庫流程如圖4-1所示:首先將提取的DNA??進行檢測,質(zhì)量合格的進行樣品、barcode及接頭的準(zhǔn)備及干燥;之后利用限制性酶??(RestrictEnzyme,RE)?ApeKI?(GCWGC)消化?DNA;消化后的?DNA?片段兩端加接??頭(adapter),其中一端的接頭含有barcode序列,另一端的接頭不含有barcode序列;??然后進行Pooling和純化;純化后進行PCR擴增,只有兩端接頭種類不同的片段以及??片段長度在170-350?bp之間的可被選擇性擴增;最后純化PCR產(chǎn)物并將構(gòu)建好的文??庫質(zhì)檢合格后進行測序。??4.?Pool?DNAs?&?Clean?up??6.?Clean?up?PCR??1.?Plate?DNA?&??adapterplf?f?\??M?5.?Perform?fel??,??2.?Digest?DNA?with?ApeKI?7.?Evaluate??3.?Ligate
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