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不結球白菜遺傳連鎖圖譜構建及其株型表型性狀的鑒定

發(fā)布時間:2020-11-14 22:55
   不結球白萊(Brassica campestris ssp.chinensis Makino)作為一類中國南方種類非常豐富的綠葉類蔬菜,能給人們供給日常所需的多種營養(yǎng)素。影響不結球白菜產量和商品性的許多表型性狀多為數量性狀,容易被環(huán)境所干擾,遺傳機制的研究也是一個難題。通過創(chuàng)建其分子連鎖圖并進行各性狀的QTL分析對基因組研究和遺傳改良工作具有一定的參考價值。在本研究中以不結球白菜的RILs群體作材料構建分子遺傳圖譜,還對幾個表型作遺傳及QTL的分析,以下為研究結果:1.通過對不結球白萊'馬耳頭'和'蘇州青'構建的RILs群體進行進行變異分析,相關性分析以及主成分分析,所得結論闡明:研究所調查的8個表型皆是數量性狀,變異系數在20.60%-41.10%之間;在相關性分析中可以得知株高同其他幾個性狀均呈現(xiàn)極顯著正相關,其中開展度長和開展度寬的相關系數r最大,為0.868。葉柄寬與開展度寬和葉片數相關性不顯著,分蘗數則與葉柄寬和葉片寬沒有顯著的相關關系;主成分分析結果是對第一主成分影響較大的是開展度長,開展度寬、葉片數和分藥數,對第二主成分影響大的是葉柄寬和葉片寬,該群體可以作為遺傳變異研究的材料用于進一步分析。2.以不結球白菜'馬耳頭'和'蘇州青'構建的RILs群體為作圖群體,用SSR作標記,經QTLIciMapping V4.1軟件分析獲得一張不結球白菜的分子連鎖圖,其含有SSR標記65個,圖譜中有連鎖群共10個,染色體個數同連鎖群個數一樣。其中有16個偏分離標記,占24.62%。圖譜的全長971.05cM,所有連鎖群的長度都在24-172.5 cM之內,標記的平均間距14.94cM,每個連鎖群所含標記個數最多為10,最少是3,該連鎖圖可用于數量性狀定位。3.采用'馬耳頭'和'蘇州青'作親本所得的RILs群體,在已得到的圖譜上應用完備復合區(qū)間作圖法對群體的8個表型作QTL分析。最終在A02,A04兩個連鎖群上得到2個QTL位點,分別是1個調控葉柄寬的QTL和1個調控分蘗數的QTL,單個QTL的貢獻率分別為10.31%和3.57%,這些QTL可以作為表型性狀分子標記育種的理論參考。
【學位單位】:南京農業(yè)大學
【學位級別】:碩士
【學位年份】:2017
【中圖分類】:S634.3
【部分圖文】:

示意圖,試驗材料,指標,表型性狀


2.1不結球白菜表型性狀統(tǒng)計分析及相關性分析??本研宄中根據植株田間生長情況共測定了?RILs群體的166個株系,從衣2-2和??圖2-2可以看到,8個表型性狀在雙親間表現(xiàn)差異較為明顯,在群體中各性狀總休介??19??

載荷系數,碎石,主成分分析,主成分


程度上體現(xiàn)各樣本的差別,是最好的概括指標差異信息的線性函數[72]。??本試驗綜合Kaiser準則(特征值入>1)并考慮碎石圖及累計方差貢獻率(表??2-4和圖2-3)確定主成分數目。圖2_3顯示結果是第一個和第二兩個主成分特征值比??較大,其連線更為陡峭,說明這兩個主成分對這些變量的解釋有最大貢獻。由表2-4??可得知,特征值X大于1的有第一和第二主成分,因此提取2個主成分比較合適,雖??然它們累積方差的貢獻率為72.077%,并未達到常用的閾值,但綜合變異的大部分信??息,因此認為提取結果合理。??22??

瓊脂糖凝膠電泳,賦值


加入800?mL?ddH20+12?g?NaOH+7?mL甲醛溶液的顯色液,在搖床上慢慢搖晃到清晰??顯現(xiàn)出條帶,然后迅速用蒸餾水洗膠1-2?min后取出用保鮮膜包好,拍照保存。??1.5數據處理及圖譜構建??將原始標記數據規(guī)范化處理后錄入Excel表格中,同父本蘇州青一樣的帶型賦值??〇,同母本馬耳頭一樣的帶型賦值2,?FiS型賦值1,由于各種原因導致帶型缺失或者??模糊的賦值-1。應用QTLIciMappingV4.1來分析,通過輸入數值計算并繪制圖譜。??2結果與分析??2.1基因組DNA提取??用DNA試劑盒提。娓改副,F,代及RILs群體126個株系的基因組DNA,圖??3-1是電泳檢驗后所得結果,能看出K?質量良好,條帶較清晰,稀釋后可供后續(xù)PCR??擴增及PAGE凝膠電泳使用。??
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本文編號:2884042

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