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芒果GGPPS基因的克隆及其與果肉類胡蘿卜素合成相關性的研究

發(fā)布時間:2020-11-20 22:14
   芒果果肉中含有類胡蘿卜素、葉綠素等烯萜類物質,它們賦予了芒果豐富的營養(yǎng)價值和果實顏色。香葉基香葉基焦磷酸合成酶(GGPPS)是類胡蘿卜素等烯萜類物質代謝的關鍵限速酶,其產物GGPP(geranylgeranyl pyrophosphate)是類胡蘿卜素等下游代謝物質的共同前體。本研究以金煌、貴妃、椰香、紅玉和臺農的果肉為研究材料,采用生理學、生物化學、分子生物學的相關技術,研究GGPPS基因對后熟過程中果肉類胡蘿卜素積累的調控機制。取得以下研究結果。1.采用RACE技術,從芒果果肉中克隆了 GGPPS基因,其cDNA理論全長為1247 bp,開放閱讀框全長為1113bp,編碼369個氨基酸。該基因與薔薇GGPPS(AAM21639.1)氨基酸序列同源性為78%,氨基酸序列分析表明該序列含有兩個DDx(2-4)D保守基元(FARM和SARM)和一個CxxxC基元,聚類結果表明此基因與其它物種的GGPPS大亞基聚在一起,故推測其在芒果中編碼GGPPS大亞基,因此命名為MinGGPPSlsu;蚪Y構分析表明,MinGGPPSlsu沒有內含子。構建亞細胞定位質粒瞬時轉化煙草葉片,通過實時共聚焦顯微鏡觀察該基因定位于葉綠體。采用RACE技術,從芒果果肉中克隆了GGPP 基因,其cDNA理論全長為1298bp,開放閱讀框全長為1005bp,編碼333個氨基酸。與近緣物種印楝GGPPSssu(KM108317)氨基酸序列同源性為83%,該基因氨基酸序列含有一個DDx(2-4)D保守基元和一個CxxxC基元,聚類時此基因與其它物種的GGPPS小亞基聚在一個顯著的獨立枝,故推測其在芒果中編碼GGPPS小亞基,因此命名為MinGGPPSssu;蚪Y構分析表明,MinGGPPSssu有515bp的內含子。構建亞細胞定位質粒瞬時轉化煙草葉片,通過實時共聚焦顯微鏡觀察該基因定位于葉綠體。2.選擇金煌、貴妃、椰香、紅玉和臺農的未熟果和成熟果為材料,通過基因表達量和總類胡蘿卜素的測定,結果表明這5個品種的成熟果果肉中MinGGPPSlsu的表達量和總類胡蘿卜素的含量均遠遠高于未熟果果肉。以成熟果果肉顏色差異較大的紅玉和椰香的成熟過程的6個階段的果肉為實驗材料,通過基因表達量和類胡蘿卜素的測定與相關性分析,結果表明兩個品種的6個階段的MinGGPPSlsu的表達量與總類胡蘿卜素的含量顯著正相關,MinGGPPSssu的表達量與類胡蘿卜素的含量不相關。暗示MinGGPPSlsu在果肉后熟過程中參與類胡蘿卜素的合成,其作用機理有待于進一步研究。3.椰香果實成熟過程中果肉顏色由白轉橙,紅玉果實成熟過程中果肉顏色由白轉黃。通過高效液相色譜法對β-胡蘿卜素和番茄紅素檢測,結果如下:椰香和紅玉果實成熟過程的六個階段果肉中的β-胡蘿卜素均呈上升趨勢且與MinGGPPSlsu表達量正相關,同階段椰香果肉中的β-胡蘿卜素普遍高于紅玉;椰香在階段5和6檢測到番茄紅素,紅玉中沒有檢測到番茄紅素。本研究初步揭示了 GGPPS基因對后熟過程中果肉類胡蘿卜素積累的影響。通過對芒果GGPPS的研究為果肉類胡蘿卜素的積累提供實驗支持,并為生產上芒果果實成熟期與類胡蘿卜素等烯萜類物質的調控提供理論依據(jù)。
【學位單位】:海南大學
【學位級別】:碩士
【學位年份】:2017
【中圖分類】:S667.7
【部分圖文】:

引物,片段,粘性末端,互補序列


圖2-4:設計片段擴增引物??Fig2-4:?Design?of?fragment?amplification?primers??注:5’端的N代表任意堿基。方框里為任意選擇的粘性末端。紅字為gRNA片段的反向互補序列。??3’末端小寫字母為退火gRNA正向引物或者tRNA反向引物。??Note:?The?t'vo?5’-terminal?bases?(shown?in?lowercase)?are?randomly?added?nucleotides?to?enhance?Bsal??digestion?of?PCR?products.?The?red?color?indicates?the?reverse?complementary?sequence?to?the?spacer.??The?lowercase?letters?at?the?3’ ̄end?indicate?bases?that?anneal?to?gRNA?(Forward?primer)?or?tRNA??

示意圖,靶點,基因,示意圖


圖2-3:?GGP/5基因編輯靶點示意圖??Fig2-3:?Diagram?of?GGPPS?gene?editing?target??表外顯子,細線代表內含子序列,剪刀符號為所選靶點依次為1-8??tliick?line?represents?exons,?and?tlie?thin?line?represents?intron.?and?the?scissors?lie?selected?target?from?1?to?8??

標準曲線,胡蘿卜素,線性回歸方程,標準曲線


為30°C;進液量為2〇nL;梯度洗脫條件為0mm30°/。流動相B,?10min30%,?20min90%流動相?B,?25min30%流動相?B。??(3)標準曲線??取10mg的卩-胡蘿卜素標準品用丙酮定容到100mL,配成100|xg/mL的母液。的番茄紅素標準品用乙酸乙酯定容到20mL,配成2〇ng/mL的母液。使用MT標準品。以濃度為橫坐標,峰面積為縱坐標繪制標準曲線(如圖2-1和2-2所示范圍、相關系數(shù)、回歸方程和檢出限如表1所示。??表1番茄紅素和P-胡蘿卜素的線性范圍、相關系數(shù)、回歸方程、檢出限??Table?1?Linear,?correlation,?coefficient,?Detection?limit?of?lycopene?and?((-carotene??線性范圍?相關系數(shù)?檢出限??類胡蘿卜素?回歸方程?竹人1?乂?T/.??(^g/inL)?(R2)?(jig/mL)??P-胡蘿卜素?9-73?y?=?228.61x?+87.458?0.9996?0.01??番茄紅素?1-20?y?=?247.22x+?10.555?0.9991?0.02??
【參考文獻】

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本文編號:2892065

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