蠟梅花芽分化及發(fā)育過程中的轉(zhuǎn)錄組特征分析
發(fā)布時(shí)間:2020-12-05 17:27
蠟梅(Chimonanthus praecox(L.)Link),屬于蠟梅科蠟梅屬植物,原產(chǎn)中國,是我國傳統(tǒng)的名貴觀賞花木,在中國有近1000年的栽培歷史。與大多數(shù)木本植物在春夏開花不同,蠟梅盛開于寒冷的冬季,花色淡黃,花香四溢,因此具有極高的觀賞價(jià)值和經(jīng)濟(jì)價(jià)值。但其盛開在冬季的具體的原因暫未有人報(bào)導(dǎo)。目前,對(duì)蠟梅花期的相關(guān)研究僅僅停留在對(duì)其花芽發(fā)育不同階段的石蠟切片觀察上,缺少這種變化相關(guān)分子機(jī)理的研究。本文在前人對(duì)蠟梅花芽發(fā)育過程中花芽石蠟切片形態(tài)學(xué)研究的基礎(chǔ)上,對(duì)蠟梅的花芽連續(xù)采樣并進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序,得到了蠟梅花芽從開始分化直至開花全階段的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),并結(jié)合切片觀察數(shù)據(jù)對(duì)發(fā)育重點(diǎn)階段的轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行差異表達(dá)基因分析。獲得的主要結(jié)果如下:1、通過對(duì)蠟梅花芽樣品的連續(xù)采樣,提取RNA并測序,得到了未分化期,分化過渡期,花被片原基形成期,雄蕊原基形成期,雌蕊原基形成期,花芽發(fā)育期,花芽緩慢發(fā)育期,子房及胚珠發(fā)育期,花粉粒發(fā)育期,初花期等10個(gè)時(shí)期的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫。結(jié)合切片觀察結(jié)果,以及測序數(shù)據(jù)的相關(guān)性及PCA分析,將這10個(gè)階段劃分為3個(gè)關(guān)鍵過程:花芽分化期(未分化期-雌蕊原基分化期);花器官...
【文章來源】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:104 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
蠟梅花芽分化各時(shí)期樣品形態(tài)
各時(shí)期測序原始數(shù)據(jù)占比Fig.2Class近口tionofraw沈adsineach‘ta譽(yù)圖中字母代表時(shí)期:幾u(yù)D.b.皿衛(wèi)已TPD,
25圖 3 10 個(gè)時(shí)期共 30 個(gè)樣品測序數(shù)據(jù)之間的相關(guān)性比較Fig.3 Correlation between sequence data of 30 samples in all ten stages本次采樣共 10 個(gè)時(shí)期,每個(gè)時(shí)期設(shè)有 3 個(gè)生物學(xué)重復(fù),生物學(xué)重復(fù)間樣品的差異過大會(huì)影響到后續(xù)的所有分析。為了奠定可靠的分析基礎(chǔ),進(jìn)行生物學(xué)重復(fù)間的相關(guān)性比較十分的有必要。本實(shí)驗(yàn)通過皮爾遜相關(guān)系數(shù)來統(tǒng)計(jì)各生物學(xué)樣品間的差異以及不同時(shí)期之間的差異。原則上,相同時(shí)期的生物學(xué)重復(fù)間的相關(guān)性應(yīng)大于80%。通過圖 3 可以發(fā)現(xiàn),所有時(shí)期的生物學(xué)重復(fù)間的相關(guān)系數(shù)均大于 90,說明這些生物學(xué)重復(fù)是可靠的,可以進(jìn)行后續(xù)分析。通過該圖還能發(fā)現(xiàn), EFP 階段的 3 個(gè)生物學(xué)重復(fù)整體上與其他 9 個(gè)時(shí)期有較大差異,相關(guān)性較低,平均為 60%,這說明該階段相比與開花前的幾個(gè)階段,基因表達(dá)出現(xiàn)了較大差異。在相關(guān)性分析的基礎(chǔ)上,本實(shí)驗(yàn)還對(duì)總共 30 個(gè)樣品進(jìn)行了 PCA 主成分分析分
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]植物WRKY轉(zhuǎn)錄因子的研究進(jìn)展[J]. 梁濱,董冬. 生物學(xué)通報(bào). 2018(06)
[2]3種木蘭屬植物花芽分化時(shí)期及形態(tài)變化[J]. 范李節(jié),陳夢倩,王寧杭,申亞梅,張壽洲. 東北林業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2018(01)
[3]高等植物成花誘導(dǎo)的分子機(jī)理研究進(jìn)展[J]. 周琴,張思思,包滿珠,劉國鋒. 分子植物育種. 2018(11)
[4]桂花花芽分化和花開放研究進(jìn)展[J]. 王英,張超,付建新,趙宏波. 浙江農(nóng)林大學(xué)學(xué)報(bào). 2016(02)
[5]植物芽休眠調(diào)控分子機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 丁安琪,馮瑩,潘騰飛,郭志雄,潘東明. 分子植物育種. 2015(09)
[6]玉米小分子熱激蛋白ZmHSP17.7基因的克隆與功能分析[J]. 孫愛清,葛淑娟,董偉,單曉笛,董樹亭,張杰道. 作物學(xué)報(bào). 2015(03)
[7]梅花成花及其調(diào)控研究進(jìn)展[J]. 江波,方仲相,方佳,何勇清,鄭炳松. 科技通報(bào). 2014(03)
[8]蠟梅花被片表層形態(tài)觀察及其意義[J]. 方子義,趙凱歌,陳龍清. 廣西植物. 2013(04)
[9]花器官發(fā)育的分子機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 唐璐璐,宋云澎,李交昆. 西北植物學(xué)報(bào). 2013(05)
[10]植物熱激蛋白70的分子作用機(jī)理及其利用研究進(jìn)展[J]. 齊妍,徐兆師,李盼松,陳明,李連城,馬有志. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2013(03)
碩士論文
[1]蠟梅科四種植物花芽分化及花發(fā)育的形態(tài)學(xué)比較研究[D]. 李來.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[2]蠟梅抗寒相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子CpICE1a、CpICE1b和CpDREB1的克隆及功能初探[D]. 張倩.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[3]蠟梅類黃酮3’-羥化酶基因(CpF3’H)及其啟動(dòng)子功能初探[D]. 俞美麗.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[4]蠟梅科植物基因組大小預(yù)測與核型分析[D]. 董雷.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
本文編號(hào):2899819
【文章來源】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:104 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
蠟梅花芽分化各時(shí)期樣品形態(tài)
各時(shí)期測序原始數(shù)據(jù)占比Fig.2Class近口tionofraw沈adsineach‘ta譽(yù)圖中字母代表時(shí)期:幾u(yù)D.b.皿衛(wèi)已TPD,
25圖 3 10 個(gè)時(shí)期共 30 個(gè)樣品測序數(shù)據(jù)之間的相關(guān)性比較Fig.3 Correlation between sequence data of 30 samples in all ten stages本次采樣共 10 個(gè)時(shí)期,每個(gè)時(shí)期設(shè)有 3 個(gè)生物學(xué)重復(fù),生物學(xué)重復(fù)間樣品的差異過大會(huì)影響到后續(xù)的所有分析。為了奠定可靠的分析基礎(chǔ),進(jìn)行生物學(xué)重復(fù)間的相關(guān)性比較十分的有必要。本實(shí)驗(yàn)通過皮爾遜相關(guān)系數(shù)來統(tǒng)計(jì)各生物學(xué)樣品間的差異以及不同時(shí)期之間的差異。原則上,相同時(shí)期的生物學(xué)重復(fù)間的相關(guān)性應(yīng)大于80%。通過圖 3 可以發(fā)現(xiàn),所有時(shí)期的生物學(xué)重復(fù)間的相關(guān)系數(shù)均大于 90,說明這些生物學(xué)重復(fù)是可靠的,可以進(jìn)行后續(xù)分析。通過該圖還能發(fā)現(xiàn), EFP 階段的 3 個(gè)生物學(xué)重復(fù)整體上與其他 9 個(gè)時(shí)期有較大差異,相關(guān)性較低,平均為 60%,這說明該階段相比與開花前的幾個(gè)階段,基因表達(dá)出現(xiàn)了較大差異。在相關(guān)性分析的基礎(chǔ)上,本實(shí)驗(yàn)還對(duì)總共 30 個(gè)樣品進(jìn)行了 PCA 主成分分析分
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]植物WRKY轉(zhuǎn)錄因子的研究進(jìn)展[J]. 梁濱,董冬. 生物學(xué)通報(bào). 2018(06)
[2]3種木蘭屬植物花芽分化時(shí)期及形態(tài)變化[J]. 范李節(jié),陳夢倩,王寧杭,申亞梅,張壽洲. 東北林業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2018(01)
[3]高等植物成花誘導(dǎo)的分子機(jī)理研究進(jìn)展[J]. 周琴,張思思,包滿珠,劉國鋒. 分子植物育種. 2018(11)
[4]桂花花芽分化和花開放研究進(jìn)展[J]. 王英,張超,付建新,趙宏波. 浙江農(nóng)林大學(xué)學(xué)報(bào). 2016(02)
[5]植物芽休眠調(diào)控分子機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 丁安琪,馮瑩,潘騰飛,郭志雄,潘東明. 分子植物育種. 2015(09)
[6]玉米小分子熱激蛋白ZmHSP17.7基因的克隆與功能分析[J]. 孫愛清,葛淑娟,董偉,單曉笛,董樹亭,張杰道. 作物學(xué)報(bào). 2015(03)
[7]梅花成花及其調(diào)控研究進(jìn)展[J]. 江波,方仲相,方佳,何勇清,鄭炳松. 科技通報(bào). 2014(03)
[8]蠟梅花被片表層形態(tài)觀察及其意義[J]. 方子義,趙凱歌,陳龍清. 廣西植物. 2013(04)
[9]花器官發(fā)育的分子機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 唐璐璐,宋云澎,李交昆. 西北植物學(xué)報(bào). 2013(05)
[10]植物熱激蛋白70的分子作用機(jī)理及其利用研究進(jìn)展[J]. 齊妍,徐兆師,李盼松,陳明,李連城,馬有志. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2013(03)
碩士論文
[1]蠟梅科四種植物花芽分化及花發(fā)育的形態(tài)學(xué)比較研究[D]. 李來.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[2]蠟梅抗寒相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子CpICE1a、CpICE1b和CpDREB1的克隆及功能初探[D]. 張倩.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[3]蠟梅類黃酮3’-羥化酶基因(CpF3’H)及其啟動(dòng)子功能初探[D]. 俞美麗.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[4]蠟梅科植物基因組大小預(yù)測與核型分析[D]. 董雷.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
本文編號(hào):2899819
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