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我國不同地區(qū)辣椒疫霉群體遺傳結構和抗藥性分析

發(fā)布時間:2024-05-20 05:44
  由辣椒疫霉(Phytophthora capsici Leonian)引起的植物疫病是毀滅性的植物病害,嚴重影響著全世界蔬菜等農作物的產量和品質。辣椒疫霉群體遺傳結構和對殺菌劑的敏感性變化直接影響著病害的發(fā)生與流行。為有效防治植物疫病,本論文對來自全國6大地區(qū)(華東、華北、西南、西北、東北和華南)以及美國(1個)的55個辣椒疫霉菌株進行了遺傳多樣性和對殺菌劑當家品種的抗性分析,獲得如下的研究結果:1、利用直接配對法測定了55個辣椒疫霉菌株的交配型。結果顯示,我國不同地區(qū)菌株交配型為A1或A2,這兩種交配型在我國各地區(qū)都有分布。除華南地區(qū)只有A2交配型以外,其他地區(qū)A1和A2交配型的比例接近1:1。2、利用7對SSR引物(Pcap1、Pcap3、Pcap、Pcap5、Pcap6、Pcap7和 Pcap8)分析了辣椒疫霉群體的遺傳多樣性。①首先建立了SSR擴增產物檢測過程中一種基于熒光測序技術的高通量低成本分析技術TP-M13-SSR。②基于該技術,利用這7對SSR引物檢測出21個等位基因,平均每個位點檢測出3個等位基因,每個位點至少可以檢測出2個等位基因。χ2卡方檢驗表明在7個SSR位點...

【文章頁數】:62 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

圖1?TP-IVn3-SSR技術的原理??A,5’端帶有尾己序列的上游引物,即TP-M13引物;B,下游引物;C,帶有巧光標記的馬己引物

圖1?TP-IVn3-SSR技術的原理??A,5’端帶有尾己序列的上游引物,即TP-M13引物;B,下游引物;C,帶有巧光標記的馬己引物

最終實現了?SS民技術與巧光自動檢測技術的完美結合,形成了一套低成本的基于巧??光測序技術的TP-M13-SSR檢測體系。與常規(guī)PCR體系不同,TP-M13-SS民在PC民擴增??中需要3條引物,其原理見圖1。PC艮反應時,引物A和B首先與DNA模板結合進行特??異性擴增,獲得含....


圖4本研究中辣椒疫霉苗襪交酷型分布情況??

圖4本研究中辣椒疫霉苗襪交酷型分布情況??

圖3代表性茜株SDl的ITS和YPT基因序列及化對結果??3交配型??交配型的測定結果(表1,圖4)表明,被測的54個辣椒疫霉菌中,30株為A1交配型,??發(fā)生頻率為54.55%;?25株為A2交配型,發(fā)生頻率為45.45%。除華南地區(qū)只有一個茵株??用于分析外(A2交配型),其....


圖5代表性苗株基因絕DNA電泳結果

圖5代表性苗株基因絕DNA電泳結果

4.1提取的基因組DNA??利用卵茜快速提取DNA的方法(106)獲得了所有供試菌株的基因組DNA,通過瓊脂糖??凝膠電泳檢測DNA的質量和濃度。結果表明(圖5),獲得的所有菌株的DNA電泳條帶清??晰,只有1條帶,條帶亮度都在150?ngW上,說明提取的DNA質好量足,可W用于....


圖6凝膠電泳和TP-M13-SSR檢測SSR位點《態(tài)性的比較??A,Pcap3引物對菌揉PC700902擴增后的結果檢測;B,Pcap4引物對幽株LN1擴增后的結果檢測

圖6凝膠電泳和TP-M13-SSR檢測SSR位點《態(tài)性的比較??A,Pcap3引物對菌揉PC700902擴增后的結果檢測;B,Pcap4引物對幽株LN1擴增后的結果檢測

利用7對SSR引物對5S個辣椒疫霉菌株進行擴增,可獲得不同材料在不同位點的基??因片段大小。本研究利用巧光標巧PCR盧物和測序儀讀取片段太小,建立了替代瓊脂鱗凝??膠電泳的TP-M13-SSR方法。通過比較傳統(tǒng)的DNA電泳與TP-M13-SS民的結果(圖6),??我們發(fā)現利巧TP....



本文編號:3979038

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