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SSR分子標(biāo)記在梨屬植物遺傳多樣性和群體結(jié)構(gòu)研究中的應(yīng)用

發(fā)布時(shí)間:2024-07-05 17:34
  梨是世界上最重要的溫帶果樹(shù)之一,其種質(zhì)資源豐富,分布范圍較廣。但是由于種間的雜交親和性造成了梨品種資源間復(fù)雜的遺傳組成關(guān)系,難以通過(guò)有限的表觀性狀對(duì)資源進(jìn)行合理評(píng)價(jià)和利用,因此本研究利用覆蓋梨全基因組的核心SSR標(biāo)記對(duì)不同栽培種的梨屬植物以及砂梨種質(zhì)資源進(jìn)行了遺傳多樣性和群體結(jié)構(gòu)分析,研究結(jié)果對(duì)梨品種資源的保存和利用具有重要的指導(dǎo)意義。1.研究基于134對(duì)核心SSR標(biāo)記對(duì)分屬于5個(gè)系統(tǒng)的385份梨資源進(jìn)行遺傳多樣性分析,結(jié)果表明梨屬植物具有較高的多樣性。聚類分析把所有品種分成3大類,其中西洋梨與東方梨的遺傳距離較遠(yuǎn);在東方梨中,秋子梨的遺傳距離較白梨和砂梨的遺傳距離遠(yuǎn)。群體結(jié)構(gòu)分析了K值為2-8時(shí)的群體結(jié)構(gòu)組成,結(jié)果表明新疆梨是東西方梨的雜交后代,白梨和砂梨擁有共同的野生梨祖先;群體結(jié)構(gòu)成分的不同也揭示了南北方梨由于環(huán)境和地理的不同造成的差異;在分類上有爭(zhēng)議的品種’蘋果梨’和’朝鮮洋梨,分別被歸類到白梨和西洋梨中;核心種質(zhì)篩選了 88個(gè)品種,包含了所有的稀有位點(diǎn)和遺傳位點(diǎn)的95.54%。2.研究利用SSR引物對(duì)470份砂梨資源進(jìn)行系統(tǒng)評(píng)價(jià),所有引物均表現(xiàn)出較高的多態(tài)性;觀測(cè)雜合度、期望...

【文章頁(yè)數(shù)】:108 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

圖2-1?385個(gè)梨屬品種的聚類關(guān)系

圖2-1?385個(gè)梨屬品種的聚類關(guān)系

2.2梨品種資源的群體結(jié)構(gòu)特征??利用MEGA4.0軟件,根據(jù)引物在不同品種的擴(kuò)增情況,構(gòu)建了?385個(gè)品種的聚??類圖(圖2-1),所有品種可以分為兩大類:東方梨和西洋梨。東方梨進(jìn)而再劃分為秋??子梨、白梨和砂梨。??Clusterl包含69個(gè)品種,其中有61個(gè)西洋梨、2個(gè)新疆....


圖2-2?385個(gè)品種在K=2-8的群體結(jié)構(gòu)??Fig?2.?Population?structure?of?385?accessions?with?K?of?2?to?8.??

圖2-2?385個(gè)品種在K=2-8的群體結(jié)構(gòu)??Fig?2.?Population?structure?of?385?accessions?with?K?of?2?to?8.??

2.4梨品種資源的主成分分析??利用PCA作圖對(duì)梨的遺傳關(guān)系和群體結(jié)構(gòu)進(jìn)行了分析,所有品種被分為三大類:??白梨和砂梨、秋子梨。西洋梨(圖2-3)。P1?(黃色圓)主要為白梨和砂梨;P2?(紅色??圓)主要為秋子梨;P3?(藍(lán)色圓)主要為西洋梨。同時(shí)有少量的品種分布在兩個(gè)類群??....


圖3-1最大似然值和K值的折線圖??Fig?3-1?The?values?of?K?and?the?maximum?likelihood?and?the?K??

圖3-1最大似然值和K值的折線圖??Fig?3-1?The?values?of?K?and?the?maximum?likelihood?and?the?K??

最大似然值的平均值確定K。利用STRUCTURE?2.0軟件(Pritchard等,2000)構(gòu)建??砂梨的群體結(jié)構(gòu)并對(duì)其結(jié)果進(jìn)行分析。根據(jù)最大似然值的平均值確定K值,本研究中,??K=4時(shí)存在明顯的拐點(diǎn)(圖3-1),因此確定K=4。根據(jù)K值,把所有品種分成4大??類(圖3-2)....


圖3-2?470個(gè)砂梨的群體結(jié)構(gòu)??

圖3-2?470個(gè)砂梨的群體結(jié)構(gòu)??

2.3砂梨的群體遺傳分化關(guān)系??根據(jù)群體結(jié)構(gòu)和PCA的分類結(jié)果,我們比較j'?4個(gè)群體中叫兩之叫Fst的仉,從??而來(lái)分析不同群體的分化程度。比較結(jié)果如圖3-4,每個(gè)比較結(jié)果由-種顏色表示,??有圖可知,不同顏色的峰值橫坐標(biāo)基本處在N—點(diǎn),表明砂梨不M辟體的分化柷度M??本一致。....



本文編號(hào):4001288

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