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星星草(Puccinellia tenuiflora)DREPPs基因克隆及功能解析

發(fā)布時(shí)間:2020-11-20 19:02
   發(fā)育調(diào)節(jié)質(zhì)膜多肽(DREPP)是一類與質(zhì)膜相關(guān)的植物特異性蛋白,具有結(jié)合磷脂酰肌醇磷酸鹽(PtdInsPs)、Ca2+/鈣調(diào)蛋白(CaM)、微管和微絲等功能,在植物生長發(fā)育與逆境應(yīng)答過程中發(fā)揮了重要作用。DREPP應(yīng)答低溫、干旱等逆境的分子機(jī)制已有研究,但是其鹽堿應(yīng)答分子機(jī)理尚未見報(bào)道。本研究以星星草(Puccinellia tenuiflora 為實(shí)驗(yàn)材料,在全基因組范圍內(nèi)分析了 PutDREPP家族組成,并克隆了PutDREPP1和PutDREPP2基因。進(jìn)而利用生物化學(xué)和分子遺傳學(xué)策略分析了PutDREPP1和PutDREPP2基因表達(dá)特性、蛋白質(zhì)亞細(xì)胞定位,及其與Ca2+/CaM的結(jié)合能力,并通過分析PutDREPP1過表達(dá)擬南芥植株初步解析了其在逆境應(yīng)答過程中的生物學(xué)功能。我們利用新近獲得的星星草全基因組數(shù)據(jù)庫,分析了PutDREPP基因家族組成,包括PutDREPP1和PutDREPP2,并克隆到PutDREPP1和PutDREPP2基因。生物信息學(xué)分析表明,PutDREPP1 ORF區(qū)域長度為609 bp,編碼202個(gè)氨基酸;PutDREPP2 ORF區(qū)域長度為651 bp,編碼216個(gè)氨基酸。PutDREPP1和PutDREPP2均具有DREPP家族蛋白功能結(jié)構(gòu)域。星星草PutDREPP1和PutDREPP2分別與水稻(Oryza sativa)的OsDREPP1和OsDREPP2同源性最高。我們利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)檢測到PutDREPP1與PutDREPP2在星星草的根、莖、葉、花、葉鞘、花穗、花柄以及種子中均有表達(dá)。PutDREPP1在根中表達(dá)量最高,花穗中表達(dá)量最低。PutDREPP2在種子中表達(dá)量最高,葉中表達(dá)量最低;在75 mmol/L Na2CO3、100 mmol/L NaHCO3、200 mmo1/L NaCl、10 mmol/L H2O2、160 μmol/L CdCl2 以及 4℃脅迫時(shí),除了根中的PutDREPP1在低溫脅迫時(shí)受抑制表達(dá),其余脅迫條件下葉和根中的PutDREPP1都受誘導(dǎo)表達(dá)。而根和葉中的PutDREPP2在100 mmol/LNaHCO3、200 mmol/L NaCl、160μmol/L CdCl2以及4℃時(shí)都受抑制表達(dá)。這暗示著PutDREPPs可能參與了鹽堿、重金屬、過氧化氫以及低溫等脅迫的應(yīng)答過程。通過構(gòu)建pBI121-PutDREPP1-GFP和pBI121-PutDREPP2-GFP載體,并分別導(dǎo)入煙草(Nicotiana tabacum)葉片細(xì)胞和洋蔥(Allium cepa)表皮細(xì)胞中進(jìn)行瞬時(shí)表達(dá),亞細(xì)胞定位結(jié)果表明,正常條件下PutDREPP1和PutDREPP2主要定位于質(zhì)膜。通過PutDREPPs基因原核表達(dá)體系,誘導(dǎo)并純化到His-PutDREPP1和His-PutDREPP2融合蛋白,經(jīng)蛋白免疫印跡法驗(yàn)證了蛋白質(zhì)純度,并利用Ca2+/CaM結(jié)合實(shí)驗(yàn)初步證實(shí)了 PutDREPPs具有Ca2+/CaM結(jié)合能力。通過構(gòu)建過表達(dá)PutDREPP1和PutDREPP2基因植物載體,并利用農(nóng)桿菌侵染法分別獲得過表達(dá)PutDREPP1和PuuDREPP2基因擬南芥植株。對過表達(dá)PutDREPP1基因擬南芥植株的耐鹽性進(jìn)行分析。在100 mmol/L和125 mmol/LNaCl脅迫下,過表達(dá)PutDREPP1基因擬南芥的根長和鮮重都優(yōu)于野生型擬南芥。這表明PutDREPP1可能對鹽應(yīng)答具有正調(diào)控作用。我們的研究結(jié)果為深入認(rèn)識DREPPs調(diào)控逆境應(yīng)答的分子機(jī)制,以及進(jìn)一步研究星星草等鹽生植物鹽堿應(yīng)答分子機(jī)理提供了新的信息。
【學(xué)位單位】:東北林業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位年份】:2019
【中圖分類】:Q943.2
【部分圖文】:

星星草,電泳圖,葉片,條帶


?基因的克隆與表達(dá)特性分析??3.1.1?PutDREPPl?^(\?PutDREPP2??利用RNA提取試劑盒提取星星草根和葉片的總RNA,電泳檢測目的條帶(圖3-1)。??如圖所示,28S?rRNA和18S?rRNA均有清晰條帶,且28S?rRNA條帶亮度大致為18S??rRNA的2倍,表明所提RNA質(zhì)量良好,可進(jìn)行接下來的實(shí)驗(yàn)。??1?2??圖3-1星星草總RNA提取電泳圖??1:根中的RNA;?2:葉片中的RNA??Fig.?3-1?Electrophoresis?of?total?RNA?of?Puccinellia?tenuiflora??1:?Root?of?RNA;?2:?Leaf?of?RNA??將提取到的星星草根和葉片的總RNA,利用反轉(zhuǎn)錄試劑盒反轉(zhuǎn)錄成cDNA。以葉片??的cDNA為模板,基因特異性引物,進(jìn)行PCR擴(kuò)增,電泳檢測到在700?bp左右有目的??性特異條帶(圖3-2)。將目的條帶膠回收,連接到pEASY-Blunt載體上,轉(zhuǎn)至大腸桿菌??.IM109上,挑取單克隆搖菌,送公司測序。序列正確的菌液提取質(zhì)粒,進(jìn)行雙酶切鑒定??(圖3-3),條帶與基因大小相符,分別命名為pEASY-B

星星草,基因,花穗,花柄


時(shí)期的不同器官,提取總RNA反轉(zhuǎn)錄成cDNA為模板,以為內(nèi)參基因,采用實(shí)時(shí)??熒光定量PCR技術(shù)分析尸w/Z)狀PP/、在星星草不同器官中的表達(dá)特性。??如圖3-8所示,在星星草根、花、種子中的表達(dá)量較高,而在花穗和花??柄中的表達(dá)量較低,但表達(dá)量差異不大。在星星草種子中的表達(dá)量約是葉中??表達(dá)量的18倍,其表達(dá)量最高,其次是在莖中,在葉中的表達(dá)量最低。??a?>-5?b?40??35.??3.0?■????10?丄?丨?室??s?i?1?-e2-5?■??SI?,,?丄「1?Sho?.??si?丄?f?上?n?..?2.s?x.??=i〇,?.?[ti?ri?[^1?v?wr.???T?丄??T?A由?i〇?-n?丄i內(nèi)m??1?內(nèi)人...??0.0? ̄L—^ ̄*—l—1 ̄■—*—1 ̄1 ̄ ̄ ̄ ̄L-*—J ̄00??m?莖?葉珀花穗花柄?花種子?根莖葉?鞀?花穗花柄花?擰子??脅迫時(shí)間?脅迫時(shí)間??Stress?time?Stress?time??圖3-8?Pw/Z)/?五/VV和/基因在星星草不同器官中的表達(dá)特性分析??a:?PutDREPPl;?b:?PutDREPP2??Fig.?3-8?Expression?analysis?of?PutDREPPl?and?Pu(DREPP2?in?different?organ?of?the?Puccinellia??tenuiflora??a:?PutDREPPl;?b:?PutDREPP2??3.2?PutDREPPs的亞細(xì)胞定位??為觀察PutDREPPl和PutDREPP2的亞細(xì)胞定位

酶切鑒定,重組質(zhì)粒


??圖3-10?pBim-Z^/^EP/^-GFP重組質(zhì)粒的酶切鑒定??M:?DL15000;?1:?pBim-Pw/Di^W-GFP?的酶切鑒定?C%aI/&7/I);?2:?pBim-Pw/D/efP尸2-GFP??的酶切鑒定CWaI/&cI)??Fig.?3-10?Emzymes?digestion?of?pBl\2l-PutDREPP2-G¥P?recombinant?plasmid??M:?DL15000;?1:?pBIl?2?l-/>w/D7^£,/>P2-GFP?digested?by?enzymes?(Xba?\/Sal\);?2:?pB\\2\-PufDREPP2-GF???digested?by?enzymes?(Xba?MSac?I)??30??
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本文編號:2891852

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