中心體蛋白Nlp相關(guān)長(zhǎng)鏈非編碼RNA的鑒定及生物學(xué)功能研究
發(fā)布時(shí)間:2020-12-10 11:23
長(zhǎng)鏈非編碼 RNA(Longnon-coding RNAs,LncRNAs)是一大類長(zhǎng)度超過(guò) 200 nt的非編碼RNA,它們利用自身RNA分子參與分子間相互作用而發(fā)揮功能。這種籠統(tǒng)的分類方法使lncRNAs在大小、結(jié)構(gòu)、功能上存在多樣性和復(fù)雜性,LncRNAs主要的生物學(xué)功能涵蓋了順式/反式調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄、DNA修飾、RNA剪接、蛋白質(zhì)支架、蛋白質(zhì)修飾、miRNA海綿等。LncRNAs廣泛地與DNA、RNA和蛋白質(zhì)發(fā)生著復(fù)雜多樣的相互作用。胚胎發(fā)育、心血管疾病、腫瘤發(fā)生發(fā)展過(guò)程中發(fā)現(xiàn)不少具有重要角色的lncRNAs。目前對(duì)lncRNAs的了解僅僅是冰上一隅,鑒于此我們開(kāi)展了針對(duì)lncRNAs-蛋白質(zhì)互作的研究,旨在探究lncRNAs-蛋白質(zhì)相互作用在腫瘤細(xì)胞中的生物學(xué)功能。Nlp(Ninein like protein)是中心體γ-Tubulin環(huán)狀復(fù)合物的重要成員,Nlp結(jié)合到γ-Tubulin定位到中心體上,參與了中心體復(fù)制、中心體成熟、微管錨定、有絲分裂紡錘體形成等眾多細(xì)胞周期事件并發(fā)揮重要作用,Nlp表達(dá)的異常通常會(huì)引起中心體結(jié)構(gòu)和數(shù)量的異常,導(dǎo)致單極或多極有絲分裂和核分裂細(xì)胞...
【文章來(lái)源】:北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院北京市 211工程院校 985工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:145 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
圖1-?1?LncRNAs在基因組上位置??
?Gene?B??Genomic?Organization?of?IncRNAs??圖1-?1?LncRNAs在基因組上位置??圖?1-1?The?Gene?location?of?LncRNAs??and?Johnson?et?al.,?2012)。基因IncRNA則進(jìn)一步被細(xì)分為與蛋白編碼基因基因座正??向或反向(sense?and?antisense)重疊,以及與蛋白編碼基因的外顯子或內(nèi)含子重疊??等類型(如圖?1-1?所示)(Zhang?and?Liu?etal.,2006;?Jia?and?Osak?etal.?,2010)。??因此,LncRNAs最常見(jiàn)的命名原則即是基于它們的基因組位置和位置最近蛋白??編碼基因的信息。人類基因組組織(HumanGenomeOrganization)下屬的基因命名??委員會(huì)(The?HUGO?Gene?Nomenclature?Committee,?HGNC)是唯一被授權(quán)對(duì)人類基??14??
分是缺乏傳統(tǒng)的RBDs的(Garcia-Moreno?and?Jarvelin?et?al.,2018)。目前為止研究得??十分清楚的?RBDs?主要有?RRM?(RNArecognition?motif)、KH?(hnRNPK?homology??domain)、DEAD?box?helicase?domain三大類(圖1-3A),我們將包含這些結(jié)構(gòu)域的??RNA結(jié)合蛋白與RNA的結(jié)合稱作傳統(tǒng)的結(jié)合方式,而大量組學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)中新鑒定出??的沒(méi)有己知RDBs的RNA結(jié)合蛋白與RNA的結(jié)合方式稱為非經(jīng)典結(jié)合。查閱相關(guān)??文獻(xiàn)對(duì)這兩類RNA和蛋白質(zhì)間結(jié)合方式做簡(jiǎn)要介紹。??4.1經(jīng)典的RNA結(jié)合蛋白與RNA結(jié)合模式??(1)包含經(jīng)典的RRM結(jié)構(gòu)的RNA結(jié)合蛋白通常會(huì)結(jié)合到擁有頸環(huán)結(jié)構(gòu)的??RNA上,這種結(jié)合對(duì)RNA的作用是對(duì)RNA進(jìn)行加工、改變其亞細(xì)胞定位、穩(wěn)定??RNA的結(jié)構(gòu)以及調(diào)控mRNA的翻譯(LundeandMooreetal.,2007:)。(2)真核生物翻??譯起始因子?4F?(eukaryotic?translation?initiation?factor?4F,?eIF4F)與帽子結(jié)構(gòu)結(jié)合蛋??白eIF4E、eIF4G以及解旋酶eIF4A組成的復(fù)合物特異地與mRNA?5‘端帽子結(jié)構(gòu)結(jié)??合起始蛋白質(zhì)翻譯過(guò)程(Prevot?and?Darlix?et?al.,2003)。(?3)外顯子結(jié)合點(diǎn)復(fù)合物(Exon??junction?complex,?EJC)通過(guò)與結(jié)合在外顯子-外顯子結(jié)合點(diǎn)上游20個(gè)核苷酸位置處??的拼接因子CWC22的結(jié)合
【參考文獻(xiàn)】:
博士論文
[1]細(xì)胞周期調(diào)控蛋白Nip在DNA損傷修復(fù)中的生物學(xué)功能和分子機(jī)制研究[D]. 馬小娟.北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院 2015
[2]Aurora B對(duì)Bacp/Nlp的磷酸化調(diào)控及其參與胞質(zhì)分裂的機(jī)制研究[D]. 晏杰.北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院 2009
[3]中心體蛋白Bacp/Nlp與乳腺癌紫杉醇化療敏感性的相關(guān)性研究[D]. 趙衛(wèi)紅.中國(guó)協(xié)和醫(yī)科大學(xué) 2007
[4]BACP在細(xì)胞基因組穩(wěn)定性中的作用研究[D]. 高華.中國(guó)協(xié)和醫(yī)科大學(xué) 2006
本文編號(hào):2908610
【文章來(lái)源】:北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院北京市 211工程院校 985工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:145 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
圖1-?1?LncRNAs在基因組上位置??
?Gene?B??Genomic?Organization?of?IncRNAs??圖1-?1?LncRNAs在基因組上位置??圖?1-1?The?Gene?location?of?LncRNAs??and?Johnson?et?al.,?2012)。基因IncRNA則進(jìn)一步被細(xì)分為與蛋白編碼基因基因座正??向或反向(sense?and?antisense)重疊,以及與蛋白編碼基因的外顯子或內(nèi)含子重疊??等類型(如圖?1-1?所示)(Zhang?and?Liu?etal.,2006;?Jia?and?Osak?etal.?,2010)。??因此,LncRNAs最常見(jiàn)的命名原則即是基于它們的基因組位置和位置最近蛋白??編碼基因的信息。人類基因組組織(HumanGenomeOrganization)下屬的基因命名??委員會(huì)(The?HUGO?Gene?Nomenclature?Committee,?HGNC)是唯一被授權(quán)對(duì)人類基??14??
分是缺乏傳統(tǒng)的RBDs的(Garcia-Moreno?and?Jarvelin?et?al.,2018)。目前為止研究得??十分清楚的?RBDs?主要有?RRM?(RNArecognition?motif)、KH?(hnRNPK?homology??domain)、DEAD?box?helicase?domain三大類(圖1-3A),我們將包含這些結(jié)構(gòu)域的??RNA結(jié)合蛋白與RNA的結(jié)合稱作傳統(tǒng)的結(jié)合方式,而大量組學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)中新鑒定出??的沒(méi)有己知RDBs的RNA結(jié)合蛋白與RNA的結(jié)合方式稱為非經(jīng)典結(jié)合。查閱相關(guān)??文獻(xiàn)對(duì)這兩類RNA和蛋白質(zhì)間結(jié)合方式做簡(jiǎn)要介紹。??4.1經(jīng)典的RNA結(jié)合蛋白與RNA結(jié)合模式??(1)包含經(jīng)典的RRM結(jié)構(gòu)的RNA結(jié)合蛋白通常會(huì)結(jié)合到擁有頸環(huán)結(jié)構(gòu)的??RNA上,這種結(jié)合對(duì)RNA的作用是對(duì)RNA進(jìn)行加工、改變其亞細(xì)胞定位、穩(wěn)定??RNA的結(jié)構(gòu)以及調(diào)控mRNA的翻譯(LundeandMooreetal.,2007:)。(2)真核生物翻??譯起始因子?4F?(eukaryotic?translation?initiation?factor?4F,?eIF4F)與帽子結(jié)構(gòu)結(jié)合蛋??白eIF4E、eIF4G以及解旋酶eIF4A組成的復(fù)合物特異地與mRNA?5‘端帽子結(jié)構(gòu)結(jié)??合起始蛋白質(zhì)翻譯過(guò)程(Prevot?and?Darlix?et?al.,2003)。(?3)外顯子結(jié)合點(diǎn)復(fù)合物(Exon??junction?complex,?EJC)通過(guò)與結(jié)合在外顯子-外顯子結(jié)合點(diǎn)上游20個(gè)核苷酸位置處??的拼接因子CWC22的結(jié)合
【參考文獻(xiàn)】:
博士論文
[1]細(xì)胞周期調(diào)控蛋白Nip在DNA損傷修復(fù)中的生物學(xué)功能和分子機(jī)制研究[D]. 馬小娟.北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院 2015
[2]Aurora B對(duì)Bacp/Nlp的磷酸化調(diào)控及其參與胞質(zhì)分裂的機(jī)制研究[D]. 晏杰.北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院 2009
[3]中心體蛋白Bacp/Nlp與乳腺癌紫杉醇化療敏感性的相關(guān)性研究[D]. 趙衛(wèi)紅.中國(guó)協(xié)和醫(yī)科大學(xué) 2007
[4]BACP在細(xì)胞基因組穩(wěn)定性中的作用研究[D]. 高華.中國(guó)協(xié)和醫(yī)科大學(xué) 2006
本文編號(hào):2908610
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