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賈第蟲(chóng)病毒microRNA克隆及功能研究

發(fā)布時(shí)間:2017-12-10 05:23

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【摘要】:賈第蟲(chóng)是一個(gè)原始的真核生物,同時(shí)也是一個(gè)重要的人獸共患病病原,具有重要的進(jìn)化生物學(xué)研究?jī)r(jià)值,賈第蟲(chóng)作為模式生物仍然有很多問(wèn)題需要解決。賈第蟲(chóng)病毒是由一個(gè)線形的末端開(kāi)放的7.0 Kb ds RNA和100 KDa的衣殼蛋白組成。microRNA是由內(nèi)含子或編碼基因間隔區(qū)的RNA基因編碼的,長(zhǎng)度大小為18-24個(gè)堿基的小分子RNA,能通過(guò)與靶m RNA特異性的堿基配對(duì)引起靶m RNA的降解或抑制其翻譯,從而對(duì)基因進(jìn)行轉(zhuǎn)錄后的表達(dá)調(diào)控。但對(duì)于賈第蟲(chóng)病毒是否存在microRNA尚不清楚。本研究通過(guò)Solexa高通量測(cè)序及生物信息學(xué)分析結(jié)合VMIR軟件預(yù)測(cè),初步確定5條賈第蟲(chóng)病毒候選非編碼小RNA,利用RT-PCR、Northern雜交、Dicer酶切割、熒光定量PCR等方法驗(yàn)證賈第蟲(chóng)病毒一條小RNA為賈第蟲(chóng)病毒的microRNA,命名為GLV microRNA1,其大小為22nt,尤為重要的是其位于pol蛋白編碼區(qū),這也是目前所發(fā)現(xiàn)的第一條原蟲(chóng)病毒的microRNA。熒光原位雜交試驗(yàn)顯示賈第蟲(chóng)病毒GLV microRNA1確實(shí)存在,且定位在細(xì)胞質(zhì)中,符合經(jīng)典的microRNA定位。賈第蟲(chóng)病毒microRNA功能研究通過(guò)knock-down GLV MicroRNA1,熒光定量PCR檢測(cè)發(fā)現(xiàn)抑制GLV microRNA1后,賈第蟲(chóng)病毒拷貝數(shù)增長(zhǎng)30%左右,表明GLV microRNA1能有效控制賈第蟲(chóng)病毒的拷貝數(shù)。流式細(xì)胞術(shù)和激光共聚焦顯微鏡激光掃描共聚焦顯微鏡也顯示,轉(zhuǎn)染GLV microRNA1組賈第蟲(chóng)滋養(yǎng)體的數(shù)量及亮度均明顯下降,而轉(zhuǎn)染反義GLV microRNA1組賈第蟲(chóng)滋養(yǎng)體的數(shù)量及亮度均明顯上升。但GLV microRNA1對(duì)賈第蟲(chóng)形態(tài)和生長(zhǎng)曲線等尚未發(fā)現(xiàn)有明顯的影響。雙熒光素酶報(bào)告試驗(yàn)測(cè)定表明GLV microRNA1的靶標(biāo)gag-pol的3'UTR發(fā)揮重要作用,同時(shí)其作用方式為切割靶序列。GLV microRNA1是目前發(fā)現(xiàn)的第一條位于基因的編碼區(qū)域的microRNA。該發(fā)現(xiàn)可能進(jìn)一步拓寬了人們對(duì)非編碼RNA的生成方式認(rèn)知,即m RNA可能需要在編碼小RNA和翻譯蛋白質(zhì)之間有一個(gè)平衡,這種平衡可能是基因表達(dá)調(diào)控的一種新方式。
【學(xué)位授予單位】:吉林大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號(hào)】:S852.7

【相似文獻(xiàn)】

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