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對比PCR-SSCP與目標(biāo)序列捕獲二代測序在TSC-RAML診斷中的應(yīng)用價值

發(fā)布時間:2020-11-14 06:30
   V目的通過分析結(jié)節(jié)性硬化癥相關(guān)的腎血管平滑肌脂肪瘤(Tuberous Sclerosis Complex-Renal Angiomyolipoma,TSC-RAML)患者的聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)-單鏈構(gòu)象多態(tài)性(Polymerase Chain Reaction-Single-Strand Conformation Polymorphism,PCRSSCP)和二代測序(Next-generation Sequencing,NGS)的檢測結(jié)果,及不同基因型患者臨床表型的特點(diǎn),探討兩種檢測方法在TSC-RAML基因診斷中的應(yīng)用價值,為今后臨床決策和研究提供參考。方法同時使用PCR-SSCP和目標(biāo)序列捕獲NGS檢測25例TSC-RAML患者的致病性基因TSC1和TSC2,對比PCR-SSCP和NGS對TSC-RAML基因診斷的準(zhǔn)確率。根據(jù)準(zhǔn)確度較高檢測方法的檢測結(jié)果將患者分組,對比各組患者一般情況與臨床表型的差異,驗證臨床表型與基因型是否相符。結(jié)果(1)24例患者,PCR-SSCP檢測出18例有突變,NGS檢測出9例有突變,PCR-SSCP突變檢出率明顯高于NGS,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P0.05)。PCR-SSCP和NGS檢測結(jié)果一致的有3例,其比例明顯低于不一致的21例患者,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P0.05)。PCR-SSCP檢測有突變的18例患者的NGS突變檢出率反而低于PCR-SSCP檢測無突變的6例患者(33.3%與66.6%),但差異無統(tǒng)計學(xué)意義。所有NGS檢測出的突變均進(jìn)行Sanger測序驗證,二者結(jié)果完全一致(2)TSC1/2突變組與非TSC1/2突變組,在年齡與性別分布情況的差異均無統(tǒng)計學(xué)意義(P0.05)。TSC1/2突變組面部血管纖維腺瘤或前額斑塊、色素脫失斑的出現(xiàn)頻率均明顯高于非TSC1/2突變組,差異均有統(tǒng)計學(xué)意義(均P0.05)。兩組患者牙釉質(zhì)點(diǎn)狀凹陷、指(趾)甲纖維瘤和骨骼病變的出現(xiàn)頻率,TSC1/2突變組均高于非TSC1/2突變組,但差異無統(tǒng)計學(xué)意義(均P0.05)。兩組患者鯊革斑、皮質(zhì)結(jié)節(jié)、室管膜下結(jié)節(jié)(Subependymal Nodules,SEN)、室管膜下巨細(xì)胞星形細(xì)胞瘤(Subependymal Giant cell Astrocytoma,SEGA)、非腎臟錯構(gòu)瘤或多發(fā)性腎囊腫的出現(xiàn)頻率,均無統(tǒng)計學(xué)差異(均P0.05)。兩組患者RAML相關(guān)癥狀和體征,TSC1/2突變組出現(xiàn)頻率明顯高于非TSC1/2突變組,出現(xiàn)時年齡TSC1/2突變組也明顯較非TSC1/2突變組年輕,差異均有統(tǒng)計學(xué)意義(均P0.05)。TSC1/2突變組患者的最大體積RAML直徑顯著大于非TSC1/2突變組,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P0.05)。TSC1/2突變組患者RAML分級大于3級的比例明顯高于非TSC1/2突變組,RAML分級不超過3級的比例明顯低于非TSC1/2突變組,差異均有統(tǒng)計學(xué)意義(均P0.05)。兩組患者RAML破裂大出血發(fā)生率在隨訪期間無統(tǒng)計學(xué)差異(P0.05)。結(jié)論(1)PCR-SSCP檢測TSC-RAML患者的的致病性基因TSC1和TSC2不可靠,而且PCR-SSCP篩查也不能提高NGS的突變檢出率,不建議臨床推廣使用。(2)NGS檢測TSC-RAML患者的致病性基因TSC1和TSC2準(zhǔn)確可靠,TSC-RAML患者的臨床表型也基本符合NGS檢測出的基因型。(3)NGS未檢測出突變的TSC-RAML患者一般臨床表現(xiàn)相對較輕,部分患者可能具有遺傳鑲嵌現(xiàn)象,有待于進(jìn)一步研究。
【學(xué)位單位】:西安醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位年份】:2019
【中圖分類】:R596;R737.11
【部分圖文】:

示意圖,信號傳導(dǎo)通路,示意圖,腎細(xì)胞癌


西安醫(yī)學(xué)院臨床醫(yī)學(xué)碩士專業(yè)學(xué)位論文其加重。目前,類似研究已證明包括 TSC-RAML、TSC 相關(guān)的腎細(xì)胞癌(Renalell Carcinoma, RCC)和淋巴管平滑肌瘤。↙ymphangioleiomyomatosis, LAM)都需SC1 或 TSC2 基因的野生型等位基因經(jīng)歷“二次打擊”[11],但這幾類腫瘤發(fā)病的誘因素尚不清楚,無法進(jìn)行提前預(yù)防。

橫紋肌瘤,產(chǎn)前診斷,胎兒


心臟橫紋肌瘤MRI

室管膜下巨細(xì)胞星形細(xì)胞瘤,側(cè)腦室


2.4.2 SENSEN 是 TSC 患者第二常見的器質(zhì)性神經(jīng)系統(tǒng)病變,它們是發(fā)生在側(cè)腦室壁上的小錯構(gòu)瘤。位于側(cè)腦室孟氏孔附近的 SEN,大約有 5%~20%可能具有轉(zhuǎn)變?yōu)?SEGA的潛力。CT 下,大約在 88%SEN 中可見到高密度鈣化影[32]。MRI 下,T1 加權(quán)像上可見側(cè)腦室壁多發(fā)稍低信號占位,T2 加權(quán)像上為稍高信號[32](圖 3 左)。2.4.3 SEGASEGA 在 TSC 患者中的發(fā)病率為 10%左右,它是一種生長緩慢的良性混合性神經(jīng)膠質(zhì)瘤,常位于側(cè)腦室孟氏孔附近,隨著腫瘤的逐步增大可能會引起阻塞性腦積水和顱內(nèi)壓增高,進(jìn)而出現(xiàn)部分神經(jīng)功能缺失,嚴(yán)重的也可導(dǎo)致患者死亡。MRI 下,SEGA 的特點(diǎn)是,T1 加權(quán)像上為等信號占位,T2 加權(quán)像上為不均勻的稍高信號[32](圖 3 右)。
【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前1條

1 馮建華,丁美萍,楊翠微;應(yīng)用聚合酶鏈反應(yīng)-單鏈構(gòu)象多態(tài)性技術(shù)分析結(jié)節(jié)性硬化癥基因突變[J];中華兒科雜志;2003年03期



本文編號:2883188

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