HuLDO:人類肝臟疾病本體的構(gòu)建及應(yīng)用
本文選題:生物醫(yī)學(xué)本體 + 肝臟疾病; 參考:《軍事醫(yī)學(xué)》2015年02期
【摘要】:目的中國(guó)是多種常見肝病的高發(fā)國(guó)家,肝臟疾病的研究對(duì)提高防治水平,保障人民健康有著重要的意義。為了全面收集、整理、共享和分析分散于現(xiàn)有數(shù)據(jù)庫(kù)和文獻(xiàn)資料中的肝臟生理病理學(xué)知識(shí),該研究構(gòu)建了人類肝臟疾病本體HuL DO并展開多方面應(yīng)用。方法 HuL DO是參考疾病相關(guān)的多個(gè)權(quán)威術(shù)語(yǔ)集和肝臟病學(xué)專著而構(gòu)建的,依據(jù)該本體中的疾病名稱列表,從現(xiàn)有數(shù)據(jù)庫(kù)中收集各種肝病的相關(guān)數(shù)據(jù),以本體結(jié)構(gòu)為數(shù)據(jù)組織框架構(gòu)建肝病知識(shí)庫(kù),以本體為字典挖掘肝病與基因的關(guān)系。結(jié)果 HuL DO是目前最全面的肝病概念分類系統(tǒng),以該本體為基礎(chǔ)建立了一整套肝病知識(shí)的收集、挖掘和展示的工具和策略。結(jié)論 HuL DO是全面收集、高效分享和靈活分析各類肝病數(shù)據(jù)和知識(shí)的重要工具。肝病本體的下載地址是ftp://liveratlas.hupo.org.cn/5.liver%20Disease%20Ontology/。
[Abstract]:Objective China is a country with high incidence of common liver diseases, and the study of liver diseases is of great significance in improving the level of prevention and treatment and protecting people's health. In order to collect, organize, share and analyze the knowledge of liver physiology and pathology scattered in the existing database and literature, this study constructed the human liver disease ontology HuL do and applied it in many aspects. Methods HuL do was constructed by referring to a number of authoritative terms and monographs of liver diseases. According to the list of disease names in this body, the relevant data of various liver diseases were collected from existing databases. The liver disease knowledge base is constructed with ontology structure as data organization framework and the relationship between liver disease and gene is mined by ontology dictionary. Results HuL do is the most comprehensive classification system of liver diseases at present. Based on this ontology, a set of tools and strategies for collecting, mining and displaying liver diseases knowledge are established. Conclusion HuL do is an important tool for comprehensive collection, efficient sharing and flexible analysis of all kinds of liver disease data and knowledge. The download address of the liver ontology is ftp://liveratlas.hupo.org.cn/5.liver Disease Ontology /.
【作者單位】: 北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院 中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)研究所;軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院放射與輻射醫(yī)學(xué)研究所蛋白質(zhì)組學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 北京蛋白質(zhì)組研究中心;
【基金】:國(guó)家973計(jì)劃資助項(xiàng)目(2011CB910600,2013CB911200) 國(guó)家863計(jì)劃資助項(xiàng)目(2012AA020409,2012AA020201) 國(guó)家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(201105121,21275160)
【分類號(hào)】:R575
【參考文獻(xiàn)】
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,本文編號(hào):1949554
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