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高通量測序技術在感染病原檢測中的應用與展望

發(fā)布時間:2020-12-05 12:36
  近年來,隨著高通量測序技術,也稱新一代(或下一代)測序技術(NGS)的迅猛發(fā)展,在操作流程不斷簡化、檢測通量不斷增長的同時,檢測成本也大大降低,使其在感染病原檢測中呈現(xiàn)出一定的技術優(yōu)勢,并得到越來越廣泛的引用。采用NGS技術對臨床標本直接進行病原檢測的策略包括目標擴增子測序和基于宏基因組測序(mNGS),尤以后者應用更廣。mNGS通過直接檢測臨床標本中病原核酸,幫助明確標本中微生物的種類和相對數(shù)量,無需對病原菌進行培養(yǎng)即能夠幫助確定引起感染的病原。目前的檢測服務多由專業(yè)的測序公司提供。對檢測結果及其應用價值的考察和評價應從以下幾項技術指標進行:測序深度、序列數(shù)量、覆蓋度、置信度、相對豐度。此外,使用NGS數(shù)據(jù)對病原生物學特性(如藥物敏感性)也可進行準確分析,在結核桿菌等病原的檢測中已得到良好的應用。未來,NGS在檢測技術、檢測流程、檢測性能、檢測結果應用等方面的快速發(fā)展必將對臨床感染病原檢測帶來巨大的技術和應用革新,同時也必將給相關從業(yè)者帶來巨大挑戰(zhàn)和發(fā)展機遇。 

【文章來源】:中華檢驗醫(yī)學雜志. 2020年05期 第533-539頁 北大核心

【文章頁數(shù)】:7 頁


本文編號:2899463

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