發(fā)布時(shí)間：2024-05-31 05:15

　　為明確江西省稻瘟病菌Magnaporthe oryzae群體遺傳結(jié)構(gòu)及其多樣性水平,選用13對(duì)SSR引物對(duì)分離自5個(gè)不同生態(tài)地理縣(市)水稻穗頸瘟標(biāo)樣的稻瘟病菌單孢菌株的全基因組進(jìn)行PCR擴(kuò)增,利用最長(zhǎng)距離法和POPGENE 32生物學(xué)軟件對(duì)其進(jìn)行聚類分析和群體遺傳多樣性分析。結(jié)果顯示,共分離獲得189株稻瘟病菌菌株,13對(duì)SSR引物對(duì)其均能擴(kuò)增出1條大小相同且清晰的條帶,多態(tài)性位點(diǎn)百分率高達(dá)100.00%。供試189株稻瘟病菌菌株在相似系數(shù)為0.74時(shí)可劃分為15個(gè)遺傳宗譜,其中宗譜JXL01包含71株菌株,占總菌株數(shù)的37.57%,為優(yōu)勢(shì)宗譜;宗譜JXL02、JXL14為亞優(yōu)勢(shì)宗譜,分別包含31、26株菌株,占總菌株數(shù)的16.40%和13.76%;宗譜JXL03、JXL08、JXL10為次要宗譜,包含10～17株菌株;其它9個(gè)宗譜為小宗譜,包含菌株都在5株以下。在群體水平上,來源于不同生態(tài)型地區(qū)的5個(gè)稻瘟病菌群體的Nei’s基因多樣性指數(shù)為0.375,Shannon信息指數(shù)為0.558,具有豐富的遺傳多樣性,且群體間差異較大;這5個(gè)種群基于非加權(quán)配對(duì)平均法大多聚為一類,種群遺傳譜系...

【文章頁數(shù)】：10 頁

【部分圖文】：

圖1引物KMS02、G5、FG02、FG03、A5、KMS20、D4、D5對(duì)部分稻瘟病菌菌株DNA的擴(kuò)增結(jié)果

選用13對(duì)SSR引物對(duì)分離獲得的189株稻瘟病菌菌株基因組DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增，每對(duì)引物均只能擴(kuò)增出1個(gè)大小為250～350bp且清晰的特異性條帶（圖1）。13對(duì)SSR引物在供試189株稻瘟病菌菌株中的擴(kuò)增效率存在差異。引物G5的擴(kuò)增效率最高，為92.59%，引物FG02擴(kuò)增的....

圖2應(yīng)用最長(zhǎng)距離法構(gòu)建不同SSR引物對(duì)稻瘟病菌擴(kuò)增結(jié)果的聚類圖

聚類分析結(jié)果顯示，在相似系數(shù)為0.74時(shí)可將189株稻瘟病菌劃分為15個(gè)遺傳宗譜（圖2）。其中宗譜JXL01包含71株菌株，占總菌株數(shù)的37.57%，為優(yōu)勢(shì)宗譜；宗譜JXL02、JXL14為亞優(yōu)勢(shì)宗譜，分別包含31株和26株菌株，占總菌株數(shù)的16.40%和13.76%；宗譜JXL....

圖3江西省5個(gè)稻瘟病菌種群間的UPGMA聚類圖

供試5個(gè)稻瘟病菌種群間的遺傳距離為0.033～0.214，存在較大的差異（表6）。根據(jù)遺傳距離構(gòu)建5個(gè)稻瘟病菌種群的UPGMA系統(tǒng)樹，在遺傳距離為0.10時(shí)，5個(gè)不同生態(tài)型稻區(qū)的稻瘟病菌種群可以劃分成2個(gè)類群，其中豐城種群、萬安種群和井岡山種群構(gòu)成一個(gè)類群，都昌種群與婺源種群構(gòu)成....

本文編號(hào)：3985170