高脲酶活性褐土的宏基因組測序與微生物來源脲酶基因的篩選
發(fā)布時間:2024-06-29 20:00
為明確褐土中產(chǎn)脲酶微生物的來源,采集河南省鄭州、洛陽、許昌、平頂山和安陽5個產(chǎn)區(qū)的土樣并檢測其脲酶活性,將脲酶活性最高的土樣進行富集培養(yǎng),提取土壤DNA構(gòu)建宏基因組文庫,采用宏基因組測序技術(shù)對褐土中的產(chǎn)脲酶微生物進行分析。結(jié)果表明:褐土脲酶活性在8.34~67.18μg·d-1·g-1之間。各取樣點脲酶活性最高值分別為46.98、67.18、57.68、45.97和64.15μg·d-1·g-1。利用宏基因組測序數(shù)據(jù)進行序列組裝,篩選到406個脲酶結(jié)構(gòu)蛋白和437個脲酶輔助蛋白;物種注釋表明,褐土中產(chǎn)脲酶微生物以細菌為主,以及少部分真菌和古細菌。產(chǎn)脲酶細菌與鏈霉菌屬(Streptomyces)、節(jié)桿菌屬(Arthrobacter)和不動桿菌屬(Acinetobacter)等親緣關(guān)系最近,與產(chǎn)脲酶真菌親緣關(guān)系較近的有足馬杜拉分枝菌(Madurella mycetomatis)、藍莓枝枯病菌(Neofusicoccum parvum)和嗜熱毛殼菌(Chaetomium thermophilum)等;產(chǎn)脲酶古細菌與亞硝化球菌屬(Nitrososphaera)和氨氧化古菌屬(Nitrosopu...
【文章頁數(shù)】:9 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 土壤樣品的采集
1.2 土壤脲酶活性的測定
1.3 產(chǎn)脲酶菌的富集培養(yǎng)
1.4 宏基因組測序
1.5 基因預(yù)測與生物信息學(xué)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 褐土脲酶酶活性的檢測
2.2 褐土中產(chǎn)脲酶微生物的富集培養(yǎng)與宏基因組測序
2.3 基因預(yù)測與脲酶蛋白篩選
2.4 脲酶和脲酶輔助蛋白的來源
2.5 富集培養(yǎng)后褐土中產(chǎn)脲酶微生物的豐度
3 討論
4 結(jié)論
本文編號:3997870
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【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 土壤樣品的采集
1.2 土壤脲酶活性的測定
1.3 產(chǎn)脲酶菌的富集培養(yǎng)
1.4 宏基因組測序
1.5 基因預(yù)測與生物信息學(xué)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 褐土脲酶酶活性的檢測
2.2 褐土中產(chǎn)脲酶微生物的富集培養(yǎng)與宏基因組測序
2.3 基因預(yù)測與脲酶蛋白篩選
2.4 脲酶和脲酶輔助蛋白的來源
2.5 富集培養(yǎng)后褐土中產(chǎn)脲酶微生物的豐度
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