發(fā)布時(shí)間：2020-06-15 12:45

【摘要】：方莖白粉藤(Cissus quadrangularis L.)屬于葡萄科(Vitaceae)白粉藤屬,是多年生藤本植物,莖多肉,廣泛分布于非洲和南亞等干旱和半干旱地區(qū)。過(guò)去方莖白粉藤的植株或根莖一直作為藥物被廣泛用于人類(lèi)和動(dòng)物的疾病治療。近年其整株或部分組織的提取物也被用于醫(yī)療和保健。同時(shí)該植物的莖也是生產(chǎn)天然纖維的潛在原材料。雖然該植物在分布區(qū)被廣泛利用,但是對(duì)于它的細(xì)胞遺傳學(xué)相關(guān)研究卻鮮見(jiàn)報(bào)道。本研究以方莖白粉藤為主要研究材料,確定了其基因組大小和染色體數(shù)目,并利用二代測(cè)序(NGS)數(shù)據(jù)和生物信息學(xué)分析初步揭示了其基因組重復(fù)序列的特征。獲得的主要結(jié)果如下;1.利用流式細(xì)胞儀評(píng)估了方莖白粉藤的基因組大小。以蘿卜作為標(biāo)準(zhǔn)參照物,繪制熒光直方圖(CV值小于5)。依據(jù)蘿卜基因組大小和峰值讀數(shù),估算方莖白粉藤基因組大小約為2C=1.410 pg。與白粉屬目前已經(jīng)報(bào)道了基因組大小的其他成員相比,方莖白粉藤的基因組增加了一倍,推測(cè)可能與其進(jìn)化過(guò)程中的加倍事件有關(guān)。2.以根尖為材料,采用熒光顯微鏡結(jié)合DAPI染色法對(duì)方莖白粉藤的染色體進(jìn)行計(jì)數(shù)。由于其染色體較小,僅觀察到兩對(duì)染色體上的著絲粒。計(jì)數(shù)結(jié)果表明方莖白粉藤的染色體數(shù)目為2n=48。考慮到白粉藤屬植物已報(bào)道的染色體基數(shù)(n=11或n=12)和其他成員已鑒定的染色體數(shù)目,加之可識(shí)別著絲粒的兩對(duì)大染色體,我們推測(cè)方莖白粉藤為四倍體。3.使用改良后CTAB法從方莖白粉藤新鮮葉中提取了 DNA。通過(guò)低通量基因組測(cè)序和生物信息學(xué)分析初步揭示了方莖白粉藤的基因組組成。發(fā)現(xiàn)方莖白粉藤基因組由大約52%的重復(fù)序列和48%的非重復(fù)序列組成。對(duì)重復(fù)元件的注釋表明長(zhǎng)末端重復(fù)序列(LTR-反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子)是其主要組分,約占重復(fù)元件的40%。對(duì)LTR的注釋表明其主要由兩個(gè)LTR超家族:Copia和Gypsy組成�；�因組重復(fù)序列比較分析表明方莖白粉藤與其起源關(guān)系較近的葡萄屬歐亞種葡萄(Vitis vinifera)之間差異顯著,推測(cè)這種差異可能是由長(zhǎng)期分化過(guò)程中的多倍化或全基因組復(fù)制等事件導(dǎo)致的。
【學(xué)位授予單位】：中國(guó)科學(xué)院大學(xué)(中國(guó)科學(xué)院武漢植物園)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2019
【分類(lèi)號(hào)】：S567.239

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本文編號(hào)：2714432