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水稻染色體片段代換系的構(gòu)建與種子耐儲(chǔ)藏QTL定位

發(fā)布時(shí)間:2020-06-16 17:43
【摘要】:水稻是我國(guó)主要的糧食作物。水稻種子儲(chǔ)藏是農(nóng)業(yè)生產(chǎn)的戰(zhàn)略需要。種子的長(zhǎng)時(shí)間儲(chǔ)藏往往引起活力的下降。種子的耐儲(chǔ)藏特性受遺傳控制,是一個(gè)復(fù)雜的遺傳性狀。染色體代換系是研究復(fù)雜性狀遺傳的理想群體。本研究以秀水134和揚(yáng)稻6號(hào)為親本,構(gòu)建互為輪回親本的染色體片段代換系;并以染色體代換系(以秀水134為輪回親本)為材料,在未老化和老化處理下,以種子電導(dǎo)率和發(fā)芽率、發(fā)芽勢(shì)、發(fā)芽指數(shù)、平均發(fā)芽天數(shù)為指標(biāo),進(jìn)行QTL檢測(cè)。得到結(jié)果如下:以秀水134為輪回親本的染色體片段代換系包含53個(gè)株系,其供體片段長(zhǎng)度在7.4-182.15cM,占全基因組0.49%-12.15%,供體片段導(dǎo)入率平均值為5.0%;這套代換系的供體片段總長(zhǎng)度為1995cM,覆蓋水稻基因組的1.33倍。以揚(yáng)稻6號(hào)為輪回親本的染色體片段代換系包含46個(gè)株系,其供體片段長(zhǎng)度在11.3-243.6cM,占全基因組0.78%-16.8%,供體片段導(dǎo)入率平均值為5.5%;這套代換系的供體片段總長(zhǎng)度為1956.8M,覆蓋水稻基因組的1.3倍。以秀水134為輪回親本的染色體片段代換系共選取233個(gè)株系進(jìn)行種子老化處理,老化后,電導(dǎo)率、發(fā)芽率、發(fā)芽勢(shì)、發(fā)芽指數(shù)都表現(xiàn)為降低,平均發(fā)芽天數(shù)表現(xiàn)為增加。未老化和老化處理下,都表現(xiàn)為電導(dǎo)率與平均發(fā)芽天數(shù)呈正相關(guān),與發(fā)芽率、發(fā)芽指數(shù)、發(fā)芽勢(shì)呈負(fù)相關(guān);發(fā)芽率、發(fā)芽勢(shì)、發(fā)芽指數(shù)三者呈正相關(guān)性。未老化處理?xiàng)l件下,共檢測(cè)出30個(gè)與電導(dǎo)率、發(fā)芽率、發(fā)芽勢(shì)、發(fā)芽指數(shù)、平均發(fā)芽天數(shù)有關(guān)的QTL,其中qTDS1-1-3是控制電導(dǎo)率的主效QTL,相對(duì)效應(yīng)為22.7%,貢獻(xiàn)率為8.9%;qGP1-9-1是控制發(fā)芽率的主效QTL,相對(duì)效應(yīng)為5.2%,貢獻(xiàn)率為6.6%;qGM1-9-1是控制發(fā)芽勢(shì)的主效QTL,相對(duì)效應(yīng)為7.8%,貢獻(xiàn)率為7.6%;qMGT1-2-3是控制平均發(fā)芽天數(shù)的主效QTL,相對(duì)效應(yīng)為11.2%,貢獻(xiàn)率為13.6%;qGI1-9-1是控制發(fā)芽指數(shù)的主效QTL,相對(duì)效應(yīng)為10.1%,貢獻(xiàn)率為5.8%。老化處理?xiàng)l件下,共檢測(cè)出9個(gè)與電導(dǎo)率、平均發(fā)芽天數(shù)有關(guān)的QTL,其中qTDS2-1-2是控制電導(dǎo)率的主效QTL,相對(duì)效應(yīng)為24.2%,貢獻(xiàn)率為19.3%;qMGT2-5-1是控制平均發(fā)芽天數(shù)的主效QTL,相對(duì)效應(yīng)為-23.1%,貢獻(xiàn)率為6.4%。未老化和老化處理?xiàng)l件下,在1號(hào)染色體上的S1-505、RM8105、RM259,8號(hào)染色體上的RM5545,9號(hào)染色體上的RM5535、RM6797標(biāo)記附近均檢測(cè)出控制電導(dǎo)率的QTL。
【學(xué)位授予單位】:浙江農(nóng)林大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:S511
【圖文】:

遺傳連鎖圖譜,分子標(biāo)記連鎖圖譜


3 結(jié)果與分析3 結(jié)果與分析3.1 SSR 分子標(biāo)記連鎖圖譜的構(gòu)建共檢測(cè)了 629 對(duì)引物,篩選到秀水 134 和揚(yáng)稻 6 號(hào)兩個(gè)親本間有多態(tài)的引物 263對(duì),親本間多態(tài)性比例為 41.8%。選擇 PCR 擴(kuò)增條帶分辨清晰且均勻覆蓋水稻 12 條染色體的 95 對(duì)多態(tài)性分子標(biāo)記,構(gòu)建遺傳連鎖圖譜,見(jiàn)圖 3.1。

載荷圖,主成分分析,指數(shù),老化指數(shù)


發(fā)芽率 -0.07 0.21 -0.256 芽指數(shù) 0.131 0.954 0.149 發(fā)芽勢(shì) 0.164 0.939 0.141 發(fā)芽天數(shù) -0.059 -0.894 -0.255 導(dǎo)率 -0.191 -0.261 0.921 芽率 0.97 0.057 0.001 芽指數(shù) 0.983 0.016 0.005 芽勢(shì) 0.939 -0.006 0.005 發(fā)芽天數(shù) -0.775 0.057 -0.192 化指數(shù) -0.117 0.101 0.605 化指數(shù) 0.971 -0.016 0.004 老化指數(shù) 0.968 -0.104 -0.01 化指數(shù) 0.939 -0.103 -0.005 數(shù)老化指數(shù) -0.745 0.289 -0.13

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):2716356

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