玉米SIAMESE-Related家族基因進化特征分析及候選基因功能鑒定
【學(xué)位授予單位】:西北農(nóng)林科技大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號】:S513
【圖文】:
間、空間以及細胞特異性需要啟動子區(qū)域中順式 個 ZmSMR 基因的上游 1.5kb 的序列提交到 Plantberry 中 RegSite 植物調(diào)控元件數(shù)據(jù)庫,鑒定到了迫相關(guān)的順式作用元件。圖 2-1 顯示 E2Fa / b 元9 和 ZmSMR11 的啟動子區(qū)域內(nèi)。在 8 個 ZmSMR錄水平順式作用元件(5'UTR Py-rich stretch)(表對基因的上調(diào)起重要作用。除 ZmSMR9 外,所有式作用調(diào)節(jié)元件(Skn-1_motif),從而表明 ZmS外,除了 ZmSMR1、ZmSMR7 和 ZmSMR10 外,其 19 個 MBS,該順勢作用元件參與調(diào)控鹽或者干元件(LTR)分別在四個基因中被發(fā)現(xiàn),但只有 Z有(表 2-5)。響應(yīng) ABA 的作用元件 ABRE 和 C檢測到,表明這些基因可能參與對 ABA 應(yīng)激的內(nèi)復(fù)制的轉(zhuǎn)錄控制以響應(yīng)和抵御外界環(huán)境變化
圖 2-2 12 個 ZmSMR 基因的染色體分布及多個物種中相同和不同基因組間共線性 SMR 基因分析Fig.2-2 Chromosomal distribution of 12 ZmSMR genes and distribution of genome syntenic andintergenomic synteny SMR gene pairs in multiple species(a)染色體編號標注在每條染色體的頂部。每個基因在染色體上的位置值標記在染色體的右側(cè),單位為 mb。(b)分析的物種有玉米、水稻、高粱、二穗短柄草、狗尾草、毛果楊和大豆。它們的染色體由 Zmchr,Bdchr,Oschr,Sbchr,Sichr,Ptchr 和 Gmchr 代表。染色體大小的比例線也在圖中被標出。(a)The chromosome number is indicated on the top of each chromosome. The value of the position ofeach gene on the chromosome is labeled on the right side of the chromosome bar, with unit of mb. (b)Analyzed specieshave maize, Brachypodium distachyon, Oryza sativa, Sorghum bicolor, Setaria italica,Populus trichocarpa and Glycine max. Their chromosomes are identified by Zmchr, Bdchr, Oschr, Sbchr,Sichr, Ptchr and Gmchr. The scale line of the chromosome size is also identified in the figure.
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本文編號:2716628
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