發(fā)布時間：2020-11-07 16:47

　　 大豆屬(genus Glycine Willd.)包含有兩個亞屬,分別是Soja亞屬和Glycine亞屬。Soja亞屬包含有兩個一年生種,栽培大豆(G.max[L.]Merr.)和一年生野生大豆(G.soja Seib.Zucc.),Glycine亞屬包含有26個多年生野生種,根據(jù)中國植物志,目前國內(nèi)只鑒定了兩個多年生種,煙豆(Glycine tabacina)和短絨野大豆(Glycine tomentella)。多年生野生大豆作為栽培大豆的野生近緣種,具有很高的利用價值,能為大豆提供具有優(yōu)良農(nóng)藝學性狀和抗性的基因源,擴寬其遺傳基礎(chǔ),創(chuàng)新種質(zhì)資源。目前,國內(nèi)對G.tabacina和G.tomentella的研究較少,缺少對二者的地理分布、生物學特征、遺傳多樣性、種群結(jié)構(gòu)和地理遺傳分化的了解,而鑒于多年生野生大豆具有較多優(yōu)良農(nóng)藝性狀和抗性性狀,具有潛在應用價值,尤其對今后大豆育種具有重要意義,亟需對這兩個物種進行研究,并闡明關(guān)于這兩個種的居群遺傳多樣性和居群結(jié)構(gòu)等的基本遺傳信息,同時為有效保護我國Glycine亞屬遺傳資源提供理論依據(jù)。本研究分別采用22對和25對SSR遺傳標記對中國東南沿海島嶼上28個居群中708份G.tabacina材料和11個居群中的291份G.tomentella材料進行遺傳多樣性分析。結(jié)果如下:Glycine tabacina1.G.tabacina具有豐富的遺傳變異,通過使用22對SSR遺傳標記,共檢測到127個等位變異,每個位點的平均等位基因數(shù)目為5.8個,有效等位基因數(shù)目為2.385,平均期望雜合度和觀測雜合度分別為0.505和0.035,平均多態(tài)性信息含量為0.456。2.G.tabacina具有相對較高的異交率,平均單位點異交率(t_s)和平均多位點異交率(t_m)分別為6.52%和6.75%;AMOVA結(jié)果顯示,43.55%的遺傳變異存在于居群間,49.66%的遺傳變異存在于居群內(nèi),平均遺傳分化指數(shù)(Gst)為0.436;空間自相關(guān)結(jié)果顯示,在14.70 km范圍內(nèi)具有顯著的遺傳相關(guān)性;個體分配檢驗和單倍型分析,揭示了G.tabacina長距離(推斷擴散距離200 km;觀測擴散距離56 km)傳播的遺傳事件。3.居群水平的NJ聚類和Structure結(jié)果高度一致,結(jié)果顯示,G.tabacina具有一定的地理分化,并被聚為三大類群,北部、中北部和除北部外的區(qū)域;其中北部和中北部區(qū)域的遺傳多樣性較高,并推斷其為中國G.tabacina的遺傳多樣性中心。Glycine tomentella4.G.tomentella也具有豐富的遺傳變異,經(jīng)25對SSR引物的檢測,共檢測到179個等位變異,每個位點的平均等位基因數(shù)目為7.2個,有效等位基因數(shù)目為3.494,平均期望雜合度和觀測雜合度分別為0.595和0.035,平均多態(tài)性信息含量為0.562。5.G.tomentella同樣具有相對較高的異交率(t_s=8.23%,t_m=5.74%);AMOVA結(jié)果顯示,其居群間的遺傳變異(60.96%)要大于居群內(nèi)的遺傳變異(33.47%),表現(xiàn)出自花授粉作物的特性,平均遺傳分化指數(shù)(Gst)為0.607;空間自相關(guān)結(jié)果顯示,在30.45 km范圍內(nèi)具有顯著的遺傳相關(guān)性。6.基于個體水平的NJ聚類和Structure結(jié)果顯示,G.tomentella具有三種遺傳結(jié)構(gòu)和保守的地理分布,100%的個體被聚類到了居群所在的島嶼,沒有島嶼間材料的交流,基于居群水平的聚類顯示,分布于同一島嶼上的居群被聚到一起。單倍型分析顯示,僅有一份材料發(fā)生了遷移,且遷移發(fā)生在同一島嶼上的兩個居群間。
【學位單位】：中國農(nóng)業(yè)科學院
【學位級別】：碩士
【學位年份】：2018
【中圖分類】：S565.1
【部分圖文】：

碩士學位論文 第二章 中國多年生野生大豆 G. tabacina 的遺acina 的地理遺傳結(jié)構(gòu)與分化進一步了解不同島嶼上分布的居群在地理上的遺傳分化和遺傳結(jié)構(gòu)，ture 分析。結(jié)果顯示，最適的 K 值為 3 (圖 2.1)，即 708 份材料被分為三 (綠色) 和 C3 (藍色)；同時根據(jù) Q 值進行的排序，將其分為了三個遺傳roup-3 (圖 2.2b)。28 個居群中，多數(shù)的居群表現(xiàn)出復雜的遺傳組成， (C2)，而 P-28 盡管具有三種不同的遺傳成分，結(jié)合相關(guān)的遺傳參數(shù)) 其在遺傳結(jié)構(gòu)上是單一的。遺傳結(jié)構(gòu)分析表明，少數(shù)居群 (中部的一群 Ps-25, 26, 27, 28) 表現(xiàn)出相對單一的遺傳結(jié)構(gòu)，但多數(shù)的居群表現(xiàn)

碩士學位論文 第二章 中國多年生野生大豆 G. tabacina 的遺acina 的地理遺傳結(jié)構(gòu)與分化進一步了解不同島嶼上分布的居群在地理上的遺傳分化和遺傳結(jié)構(gòu)，ture 分析。結(jié)果顯示，最適的 K 值為 3 (圖 2.1)，即 708 份材料被分為三 (綠色) 和 C3 (藍色)；同時根據(jù) Q 值進行的排序，將其分為了三個遺傳roup-3 (圖 2.2b)。28 個居群中，多數(shù)的居群表現(xiàn)出復雜的遺傳組成， (C2)，而 P-28 盡管具有三種不同的遺傳成分，結(jié)合相關(guān)的遺傳參數(shù)) 其在遺傳結(jié)構(gòu)上是單一的。遺傳結(jié)構(gòu)分析表明，少數(shù)居群 (中部的一群 Ps-25, 26, 27, 28) 表現(xiàn)出相對單一的遺傳結(jié)構(gòu)，但多數(shù)的居群表現(xiàn)

業(yè)科學院碩士學位論文 第二章 中國多年生野生大豆 G. tabacina 的遺傳多樣性，占比 83.8%；其余三個居群 (Ps-8, 10, 13) 對三個遺傳分組貢獻幾乎相同的材料數(shù) (表理分布上，Groups-1 主要包括了來自北部和中北部的島嶼上的居群，同時還包括南部 (P-28)，Groups-2 包括了中部和南部的居群，而 Groups-3 包含了除 P-22 外的北部的居為了進一步闡明G. tabacina 居群遺傳距離和地理距離是否具有相關(guān)性，進行了Mantel顯示兩者之間存在顯著的相關(guān)性 (r = 0.585 *，p <0.001)，回歸分析 (y) 表明居群隨地加，遺傳距離增大 (-logGD減小)，遺傳關(guān)系變��；其中 P-16 和 P-17 及 P-26 和 P-27 度的相關(guān)性 (圖 2.3)�？臻g自相關(guān)分析表明，G. tabacina 在半徑約 25.7 km (14.7 km) 正相關(guān)關(guān)系 (顯著正相關(guān))，超過 194.1 km 后呈現(xiàn)顯著的負相關(guān) (圖 2.4)。
【參考文獻】

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本文編號：2874218