發(fā)布時(shí)間：2020-11-10 03:37

　　 遺傳多樣性是生物多樣性的重要組成部分,是生命進(jìn)化和適應(yīng)的基礎(chǔ),遺傳多樣性越豐富,物種對(duì)環(huán)境變化的適應(yīng)能力也越大。遺傳多樣性分析可以為物種的起源與進(jìn)化、動(dòng)植物遺傳育種、品種鑒定與評(píng)價(jià)以及生物多樣性保護(hù)策略的制定等研究提供理論依據(jù)。云南省是茶組植物種類(lèi)最多、分布最廣的地區(qū);臨滄是云南第二大茶葉茶區(qū),廣泛分布野生、栽培大理茶(Camellia taliensis)、阿薩姆茶(C.sinensis var.assamica)及中間過(guò)渡型茶樹(shù)。本研究利用葉綠體基因間隔區(qū)rpl32-trnL序列和30個(gè)核心簡(jiǎn)單重復(fù)序列(SSR)標(biāo)記對(duì)臨滄市雙江縣冰島村、大雪山、鳳慶縣香竹箐村、云縣白鶯山村、臨翔區(qū)昔歸村和那罕自然村6個(gè)代表性古茶樹(shù)居群的遺傳多樣性與遺傳結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析,主要結(jié)果如下:1.通過(guò)對(duì)臨滄6個(gè)居群的453個(gè)茶樹(shù)個(gè)體的葉綠體基因間隔區(qū)rpl32-trn L多態(tài)性進(jìn)行分析,得到7種葉綠體單倍型。總的單倍型多樣性指數(shù)(H_d)為0.6820,核苷酸多樣性指數(shù)(π)為0.00475。居群水平,昔歸(H_d=0.4340,π=0.00510)與那罕(H_d=0.6800,π=0.00440)居群多樣性較高,大雪山(H_d=0.0000,π=0.00000)居群多樣性最低。昔歸居群擁有獨(dú)特單倍型H6和H7,大雪山居群中僅有單倍型H3分布。分子差異分析(AMOVA)分析結(jié)果顯示,分布在居群內(nèi)(56.95%)的遺傳變異與分布在居群間(43.05%)的遺傳變異相接近。巢式支系分析結(jié)果表明,地理隔離導(dǎo)致的有限基因流是臨滄古茶樹(shù)群體遺傳結(jié)構(gòu)形成的主要原因。2.30個(gè)SSR位點(diǎn)在臨滄古茶樹(shù)群體中表現(xiàn)出較高的多態(tài)性。白鶯山(I=1.245,H_o=0.547,H_e=0.614)和香竹箐(I=1.132,H_o=0.429,H_e=0.557)居群具有較高的遺傳多樣性,推測(cè)大理茶和阿薩姆茶間的基因交流能夠在居群內(nèi)累積遺傳變異,導(dǎo)致遺傳多樣性增加。與其它居群相比,冰島(I=0.706,H_o=0.374,H_e=0.399)居群各遺傳多樣性指數(shù)均為最低,具有最低的遺傳多樣性。分子差異分析(AMOVA)分析結(jié)果顯示,臨滄茶樹(shù)群體遺傳變異主要存在于居群內(nèi)(74.67%)。大雪山居群近交系數(shù)為負(fù)(F_(is)=-0.0362),表明居群內(nèi)雜合子過(guò)剩,結(jié)合瓶頸效應(yīng)檢測(cè),推測(cè)大雪山居群可能經(jīng)歷過(guò)遺傳瓶頸。根據(jù)Ennos的花粉流和種子流比值的公式,計(jì)算得到花粉流是種子流的4.97倍,表明花粉流是基因交流的主要方式。Structure的結(jié)果顯示,臨滄古茶樹(shù)群體可以劃分為3個(gè)亞群,表明臨滄茶樹(shù)群體存在三個(gè)同源基因庫(kù)。其中,白鶯山居群中分布有一個(gè)遺傳背景未知的亞群。3.基于葉綠體rpl32-trnL基因間隔區(qū)與30個(gè)SSR標(biāo)記,對(duì)白鶯山7個(gè)茶樹(shù)亞群共130個(gè)個(gè)體進(jìn)行分析。結(jié)果表明,黑條子(H_d=0.541,π=0.00510,I=1.127,H_o=0.656,H_e=0.590)亞群具有較高的遺傳多樣性,白芽子(H_d=0.541,π=0.00510,I=0.421,H_o=0.582,H_e=0.315)亞群遺傳多樣性較低。7個(gè)亞群共檢測(cè)到4種葉綠體單倍型,單倍型H4為勐庫(kù)種亞群特有單倍型,白芽子亞群中僅有單倍型H3分布,藤子茶亞群中僅有單倍型H1分布。分子差異分析(AMOVA)分析結(jié)果表明遺傳變異主要存在于亞群內(nèi),葉綠體與核基因組水平亞群內(nèi)的遺傳變異分別占總遺傳變異的89.91%和77.78%。葉綠體水平,亞群間表現(xiàn)為中等水平遺傳分化,遺傳分化系數(shù)為0.101,核基因組水平,亞群間出現(xiàn)較大遺傳分化,遺傳分化系數(shù)為0.202。葉綠體水平,白鶯山亞群間基因流為2.16,表明亞群間可以通過(guò)某種途徑產(chǎn)生基因流。Structure結(jié)果表明,白鶯山可劃分為2個(gè)同源基因庫(kù),但是當(dāng)K值取3時(shí),顯示白芽子具有獨(dú)特的遺傳背景。結(jié)合前人數(shù)據(jù)分析,可以排除白芽子茶為人為引種的栽培型茶(C.sinensis var.assamica)。基于遺傳距離構(gòu)建的130個(gè)個(gè)體的N-J聚類(lèi)樹(shù)與Structure結(jié)果綜合分析表明,當(dāng)?shù)鼐用窀鶕?jù)表型性狀對(duì)亞群的劃分具有一定合理性,但仍需分子標(biāo)記等遺傳學(xué)手段加以輔助。
【學(xué)位單位】：中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位年份】：2018
【中圖分類(lèi)】：S571.1
【部分圖文】：

圖 2.1 6 個(gè)茶樹(shù)居群樣本的地理分布Fig 2.1 Geographical distribution information of six tea populations

測(cè)序結(jié)果與序列比對(duì)結(jié)果

圖 2.3 茶樹(shù)居群中單倍型頻率及 7 個(gè)單倍型的地理分布，單倍型 H1-H7 以不同顏色表示（見(jiàn)圖例）Fig 2.3 Frequencies and geographic distribution of 7 haplotypes in six tea plant populations.The haplotypes H1-H7 are represented by different colors
【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：2877419