發(fā)布時(shí)間：2020-12-03 14:54

　　本研究對(duì)401份胡麻種質(zhì)進(jìn)行表型變異和SRAP標(biāo)記的遺傳多樣性分析,構(gòu)建了關(guān)聯(lián)群體。通過(guò)全基因組重測(cè)序技術(shù)對(duì)269份胡麻關(guān)聯(lián)群體進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)分析,獲得了產(chǎn)量和品質(zhì)相關(guān)性狀顯著關(guān)聯(lián)的SNP位點(diǎn)和候選基因,并NR、Swiss-port、KEGG、GO數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行基因功能注釋。主要研究結(jié)果如下:1.401份胡麻種質(zhì)的14個(gè)表型性狀平均變異系數(shù)為17.87%,平均遺傳多樣性指數(shù)為2.132。用26對(duì)SRAP引物評(píng)價(jià)了胡麻核心種質(zhì),共擴(kuò)增出234個(gè)多態(tài)性條帶,多態(tài)性信息量（PIC）平均為0.60;聚類分析結(jié)果顯示,將401份胡麻資源分為2大類和7個(gè)亞類,與國(guó)內(nèi)外7個(gè)不同地區(qū)來(lái)源吻合。2.對(duì)269份胡麻品種進(jìn)行重測(cè)序獲得了 1.3684Tb的有效序列數(shù)據(jù),與胡麻參考基因組平均比對(duì)率為96.32%,堿基GC含量平均值為38.57%。平均測(cè)序深度為 12.55。得到了 1,069,106個(gè)SNPs,分布在4037個(gè)Scaffold上。3.胡麻產(chǎn)量相關(guān)性狀獲得了 21個(gè)顯著SNP位點(diǎn)和57個(gè)候選基因,其中株高5個(gè)SNP為scaffold9:516785、scaffold977:291500、scaff... 

【文章來(lái)源】：內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)內(nèi)蒙古自治區(qū)

【文章頁(yè)數(shù)】：148 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：博士

【部分圖文】：

圖１－２本研究的技術(shù)路線??Ｆｉｇ．?１－２?Ｔｅｃｈｎｉｃａｌ?ｒｏｕｔｅ?ｏｆ?ｔｈｅ?ｓｔｕｄｙ??

多態(tài)性比率為６０．７７％。每對(duì)引物擴(kuò)增多態(tài)位點(diǎn)變幅為５？１４個(gè)，平均９．００個(gè)。??Ｍ１５Ｅ７擴(kuò)增的多態(tài)性位點(diǎn)最多，Ｍ１１Ｅ６的擴(kuò)增多態(tài)性位點(diǎn)最少（表２－７）?？Ｍ１４Ｅ２??引物對(duì)部分胡麻品種（系）的擴(kuò)增結(jié)果見圖２－１。觀測(cè)等位基因數(shù)為２．００，每個(gè)??位點(diǎn)的平均有效等位基因數(shù)為１．５８，每對(duì)引物的多態(tài)性信息量（Ｐ／Ｃ）從０．５１？??０．７６，平均為０．６０，引用的所有引物組合為高多態(tài)性ＣＰ／Ｃ＞０．５）［ｍ］。用ＰＯＰＧＥＮ??軟件計(jì)算了?４０１份胡麻資源的有效等位基因數(shù)（乂＝１．５８４７?）、香農(nóng)指數(shù)??（／＝０．５２３５）、Ｎｅｉ＇ｓ基因多樣性指數(shù)（／／＝０．３４７９）。說(shuō)明本研究供試資源材料在??物種水平上遺傳多樣性豐富。??７１１?．廣?＂一?包＾?＾?＾??Ｍ．?ＤＬ１５００：?１￣３０依次為３０份胡麻樣品??圖２－１引物對(duì)Ｍ１４Ｅ２在胡麻中的擴(kuò)增產(chǎn)物??Ｍ．?ＤＬ１５００；?１?？３０．?Ｆｌａｘ?ｓａｍｐｌｅｓ??Ｆｉｇ．?２－１?ＰＣＲ?ｐｒｏｄｕｃｔ?ｗｉｔｈ?ＳＲＡＰ?ｐｒｉｍｅｒ?Ｍ１４Ｅ２??

內(nèi)蒙古?中國(guó)西北??群體?中國(guó)華北ｍ?Ｈ?ｆ?美國(guó)?加拿大?亞洲?歐洲??ｎ?，?Ｉｎｎｅｒ?ＶＴ?，?廣，．?Ｎｏｒｔｈｗｅｓｔｅｒｎ?Ａ?＾?」?▲?．?ｒ??Ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎ?Ｎｏｒｔｈｅｒｎ?Ｃｈｉｎａ?．?Ａｍｅｒｉｃａ?Ｃａｎａｄａ?Ａｓｉａ?Ｅｕｒｏｐｅ??Ｍｏｎｇｏｌｉａ?Ｃｈｉｎａ??Ｉｎｎｅｒ?Ｍｏｎｇｏｌｉａ?０．９３８９＊?０．９３６０＊?０．８９８０＊?０．９４３９＊?０．８８６５＊?０．９２２２＊??Ｎｏｒｔｈｅｒｎ?０．０６３０?０．９５７０＊?０．９１３６＊?０．９１４８＊?０．８５６６＊?０．９５０９＊??Ｎｏｒｔｈｗｅｓｔｅｒｎ?０．０６６１?０．０４３９?０．９０４８?０．９３８８?０．８５７７?０．９４１８??Ａｍｅｒｉｃａ?０．１０７６?０．０９０４?０．１００１?０．９４４０＊?０．９６０?ｆ?０．９５２７＊??Ｃａｎａｄａ?０．０５７８?０．０８９１?０．０６３１?０．０５７６?０．９３４３＊?０．９２３６＊??Ａｓｉａ?０．１２０５?０．１５４８?０．１５３５?０．０４０８?０．０６８０?０．９２０７＊??Ｅｕｒｏｐｅ?０．０８１０?０．０５０４?０．０５９９?０．０４８４?０．０７９５?０．０８２６??注：＊Ｐ＜０．０５?Ｎｏｔｅ：?＊Ｐ＜０．０５??從不同地理來(lái)源胡麻種質(zhì)資源群聚類分析結(jié)果可以看出，在遺傳相似系數(shù)??０．８８０處聚成２類，其中，第一類是內(nèi)蒙古、加拿大、中國(guó)華北、西北、歐洲群??體組成；第二類是美國(guó)和亞洲（除了中國(guó)）群體組成。在遺傳相似系數(shù)０．８９５??處聚成３類，第一類是內(nèi)蒙古和加拿大群體，第

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]純天然胡麻膠的提取工藝優(yōu)化及化學(xué)改性研究[J]. 張印紅,趙春生,方濤,毛勇坡,李筱然,王彥斌.  精細(xì)與專用化學(xué)品. 2018(03)
[2]外引油用亞麻品種資源鑒定與評(píng)價(jià)[J]. 李建增,楊若菡,吳學(xué)英,杜剛,朱炫,白永劉,劉飛虎,劉其寧.  西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2017(10)
[3]油用亞麻品種資源主要性狀的鑒定與評(píng)價(jià)[J]. 歐巧明,葉春雷,李進(jìn)京,陳軍,崔文娟,厚毅清,王立光,李忠旺,羅俊杰.  中國(guó)油料作物學(xué)報(bào). 2017(05)
[4]從俄羅斯引進(jìn)亞麻種質(zhì)資源的農(nóng)藝性狀評(píng)價(jià)[J]. 張麗麗,劉晶晶,喬海明,曲志華,李世芳,王玉祥,金穎璐.  中國(guó)油料作物學(xué)報(bào). 2017(05)
[5]300份亞麻種質(zhì)資源主要農(nóng)藝性狀的鑒定及評(píng)價(jià)[J]. 李秋芝,姜穎,魯振家,曹洪勛,宋鑫玲,姜籽竹.  中國(guó)麻業(yè)科學(xué). 2017(04)
[6]胡麻種質(zhì)資源、育種及遺傳研究進(jìn)展[J]. 伊六喜,斯欽巴特爾,賈霄云,高鳳云,周宇,王雪嬌,趙小慶,侯建華,張輝.  中國(guó)麻業(yè)科學(xué). 2017(02)
[7]旱地胡麻主要農(nóng)藝性狀綜合評(píng)價(jià)[J]. 張煒,曹秀霞,楊崇慶,錢愛萍.  寧夏農(nóng)林科技. 2017(03)
[8]俄羅斯遠(yuǎn)東及黑龍江省大豆種質(zhì)資源遺傳多樣性和群體結(jié)構(gòu)分析[J]. 馬淑梅,張宏紀(jì),孫巖,劉東軍,郭怡璠,劉文林,楊淑萍,張睿,張舉梅,李小紅,陽(yáng)小鳳,黃山.  中國(guó)油料作物學(xué)報(bào). 2017(01)
[9]俄引大豆種質(zhì)遺傳多樣性及分子ID的構(gòu)建[J]. 郭怡璠,張宏紀(jì),張舉梅,孫巖,劉東軍,劉文林,閆文義,耿宏偉,楊淑萍,張睿.  中國(guó)油料作物學(xué)報(bào). 2016(03)
[10]新疆石榴種質(zhì)資源遺傳多樣性的SRAP分析[J]. 陳蕓,王繼蓮,丁曉麗,馬劉峰.  西北植物學(xué)報(bào). 2016(05)

博士論文
[1]白菜類作物基因組及重要農(nóng)藝性狀相關(guān)基因的生物信息學(xué)分析[D]. 宋小明.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[2]亞麻分子標(biāo)記的開發(fā)及產(chǎn)量相關(guān)性狀的關(guān)聯(lián)分析[D]. 鄧欣.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2013
[3]部分亞麻屬植物遺傳多樣性及分子進(jìn)化研究[D]. 李冬梅.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009

碩士論文
[1]部分胡麻種質(zhì)資源主要農(nóng)藝性狀和AFLP分子標(biāo)記的遺傳多樣性分析[D]. 李丹丹.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[2]利用形態(tài)學(xué)標(biāo)記和SRAP標(biāo)記分析國(guó)內(nèi)胡麻育成品種的遺傳多樣性[D]. 郝榮楷.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[3]茶樹中花青素還原酶的研究[D]. 張憲林.安徽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
[4]甘藍(lán)型油菜遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建及花色基因的QTL初步定位[D]. 柳麗.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009



本文編號(hào)：2896378