中棉所70 RIL群體高密度遺傳圖譜構建及纖維品質QTL定位
發(fā)布時間：2020-12-04 14:49
棉花是我國的重要經濟作物之一,棉花的纖維品質直接影響棉紡織品質量。隨著工業(yè)技術的發(fā)展和人們生活水平的逐步提高,培育高纖維品質的棉花受到了極大的關注。本研究利用SSR分子標記技術和棉花80K SNP芯片技術,以連續(xù)自交的抗蟲品種sGK156和優(yōu)質系非抗蟲材料901-001為親本構建的RIL群體為試驗材料,構建高密度遺傳連鎖圖譜,并用WinQTLCart2.5的復合區(qū)間作圖法定位出與纖維品質相關的QTL,這為分子標記輔助育種奠定了基礎。利用RIL群體在2015年和2016年的兩年9個環(huán)境的纖維品質數(shù)據(jù),分析發(fā)現(xiàn)各纖維品質性狀均呈正態(tài)分布,符合品質性狀受微效多基因遺傳控制的特點。分析各性狀間相關性,得出纖維長度與纖維伸長率、纖維強度和整齊度極顯著正相關,纖維長度與馬克隆值極顯著負相關;纖維伸長率與纖維強度和整齊度極顯著正相關,纖維伸長率與馬克隆值不相關;纖維強度與馬克隆值極顯著負相關,纖維強度與整齊度極顯著正相關;馬克隆值與整齊度不相關。本試驗選取了從14,280對SSR引物中篩選到的在F2群體中具有多態(tài)性的267對SSR引物,進一步篩選131對多態(tài)性引物。用這些引物通...
【文章來源】：河南大學河南省
【文章頁數(shù)】：86 頁
【學位級別】：碩士
【部分圖文】：
遺傳連所圖
Chr22 0 67 67 50.34 0.75 16.28 1Chr23 3 369 372 150.84 0.41 13.27 4Chr24 4 889 903 117.24 0.13 6.93 0Chr25 8 133 141 108.27 0.77 17.39 2Chr26 0 130 130 75.85 0.58 11.88 1Dt subgenome 78 4,066 4,154 1,503.16 0.36 - 27Total 107 8,306 8,413 2,772.79 0.33 - 483.3.2 遺傳圖譜中物理距離與遺傳距離共線性分析對 SSR 標記利用 Blast 進行序列比對得出的物理距離，對 SNP 標記利用 Bowtie 進行序列比對并結合南京農業(yè)大學陸地棉參考基因組序列信息得到物理距離，然后采用CIRCOS0.66 作圖軟件分別對棉花 A 亞組和棉花 D 亞組每個標記的遺傳距離與物理距離進行共線性分析，發(fā)現(xiàn)遺傳圖譜上的絕大多數(shù)位點與它們相應的物理位置一致，這表明遺傳圖譜的高質量，分析結果見如圖 3-3。（b）（a）
【參考文獻】：
期刊論文
[1]雜交棉中棉所70后代分離群體產量品質的表型變異分析[J]. 葉禎維,鄧曉英,石玉真,李俊文,劉愛英,龔舉武,鞏萬奎,商海紅,陳婷婷,葛群,王艷玲,吳玉香,劉志,袁有祿. 棉花學報. 2016(01)
[2]普通小麥農大3338×京冬6號DH系群體株高及節(jié)間長度的QTL分析[J]. 逯臘虎,魏強,王飛,劉剛,秦丹丹,關攀鋒,倪中福,姚穎垠,孫其信,彭惠茹. 中國農業(yè)大學學報. 2014(01)
[3]中棉所70生育特性及適宜種植方式分析[J]. 楊長琴,張培通,袁有祿,劉瑞顯,龔舉武,商海紅,李俊文,石玉真. 江蘇農業(yè)科學. 2012(07)
[4]棉花分子育種進展與展望[J]. 李付廣,袁有祿. 中國農業(yè)科技導報. 2011(05)
[5]Population genetic structure and diversity of high value vulnerable medicinal plant Acorus calamus in India using RAPD and chloroplast microsatellite markers[J]. H. S. Ginwal,Neha Mittal,Arvind Tomar,V. K. Varshney. Journal of Forestry Research. 2011(03)
[6]陸地棉高品質品系纖維品質性狀QTL的分子標記及定位[J]. 王義青,李俊文,石玉真,劉愛英,商海紅,龔舉武,王濤,鞏萬奎,袁有祿. 棉花學報. 2010(06)
[7]轉基因抗蟲優(yōu)質雜交棉——中棉所70[J]. 袁有祿,石玉真,李俊文,劉愛英,翟學軍,李悅有,桑文東. 中國棉花. 2009(02)
[8]陸地棉遺傳圖譜構建及產量和纖維品質性狀QTL定位[J]. 陳利,張正圣,胡美純,王威,張建,劉大軍,鄭靚,鄭風敏,馬靖. 作物學報. 2008(07)
[9]陸地棉優(yōu)質纖維QTL的分子標記篩選及優(yōu)質來源分析[J]. 胡文靜,張曉陽,張?zhí)煺?郭旺珍. 作物學報. 2008(04)
[10]與棉花纖維強度連鎖的主效QTL應用于棉花分子標記輔助育種[J]. 石玉真,劉愛英,李俊文,邵艷華,袁有祿. 分子植物育種. 2007(04)
碩士論文
[1]陸地棉SSR標記遺傳圖譜構建與纖維品質性狀QTL定位[D]. 賈秀凌.西南大學 2014
本文編號：2897789
【文章來源】：河南大學河南省
【文章頁數(shù)】：86 頁
【學位級別】：碩士
【部分圖文】：
遺傳連所圖
Chr22 0 67 67 50.34 0.75 16.28 1Chr23 3 369 372 150.84 0.41 13.27 4Chr24 4 889 903 117.24 0.13 6.93 0Chr25 8 133 141 108.27 0.77 17.39 2Chr26 0 130 130 75.85 0.58 11.88 1Dt subgenome 78 4,066 4,154 1,503.16 0.36 - 27Total 107 8,306 8,413 2,772.79 0.33 - 483.3.2 遺傳圖譜中物理距離與遺傳距離共線性分析對 SSR 標記利用 Blast 進行序列比對得出的物理距離，對 SNP 標記利用 Bowtie 進行序列比對并結合南京農業(yè)大學陸地棉參考基因組序列信息得到物理距離，然后采用CIRCOS0.66 作圖軟件分別對棉花 A 亞組和棉花 D 亞組每個標記的遺傳距離與物理距離進行共線性分析，發(fā)現(xiàn)遺傳圖譜上的絕大多數(shù)位點與它們相應的物理位置一致，這表明遺傳圖譜的高質量，分析結果見如圖 3-3。（b）（a）
【參考文獻】：
期刊論文
[1]雜交棉中棉所70后代分離群體產量品質的表型變異分析[J]. 葉禎維,鄧曉英,石玉真,李俊文,劉愛英,龔舉武,鞏萬奎,商海紅,陳婷婷,葛群,王艷玲,吳玉香,劉志,袁有祿. 棉花學報. 2016(01)
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[4]棉花分子育種進展與展望[J]. 李付廣,袁有祿. 中國農業(yè)科技導報. 2011(05)
[5]Population genetic structure and diversity of high value vulnerable medicinal plant Acorus calamus in India using RAPD and chloroplast microsatellite markers[J]. H. S. Ginwal,Neha Mittal,Arvind Tomar,V. K. Varshney. Journal of Forestry Research. 2011(03)
[6]陸地棉高品質品系纖維品質性狀QTL的分子標記及定位[J]. 王義青,李俊文,石玉真,劉愛英,商海紅,龔舉武,王濤,鞏萬奎,袁有祿. 棉花學報. 2010(06)
[7]轉基因抗蟲優(yōu)質雜交棉——中棉所70[J]. 袁有祿,石玉真,李俊文,劉愛英,翟學軍,李悅有,桑文東. 中國棉花. 2009(02)
[8]陸地棉遺傳圖譜構建及產量和纖維品質性狀QTL定位[J]. 陳利,張正圣,胡美純,王威,張建,劉大軍,鄭靚,鄭風敏,馬靖. 作物學報. 2008(07)
[9]陸地棉優(yōu)質纖維QTL的分子標記篩選及優(yōu)質來源分析[J]. 胡文靜,張曉陽,張?zhí)煺?郭旺珍. 作物學報. 2008(04)
[10]與棉花纖維強度連鎖的主效QTL應用于棉花分子標記輔助育種[J]. 石玉真,劉愛英,李俊文,邵艷華,袁有祿. 分子植物育種. 2007(04)
碩士論文
[1]陸地棉SSR標記遺傳圖譜構建與纖維品質性狀QTL定位[D]. 賈秀凌.西南大學 2014
本文編號：2897789
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