a国产,中文字幕久久波多野结衣AV,欧美粗大猛烈老熟妇,女人av天堂

單配子體測(cè)序剖析玉米減數(shù)分裂重組交換的雌雄差異

發(fā)布時(shí)間:2024-11-03 02:42
  減數(shù)分裂重組交換(Crossover,CO)在配子體的發(fā)生和遺傳變異的產(chǎn)生上具有重要作用,是物種進(jìn)化的動(dòng)力和遺傳改良的基礎(chǔ)。CO發(fā)生的模式在物種間和物種內(nèi)都有差異,而在性別之間也有差別。然而,在植物中,性別特異的CO發(fā)生模式至今還鮮有研究。隨著單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)的發(fā)展,CO模式已經(jīng)可以在單個(gè)配子體中得到,這為在研究單細(xì)胞水平研究性別特異的CO模式提供了機(jī)會(huì)。本研究中,我們構(gòu)建了首個(gè)單細(xì)胞水平的植物雌性重組圖譜,并與相同背景下的雄性重組圖譜進(jìn)行了比較,分析了在CO頻率、分布和干涉上的性別差異。這項(xiàng)研究為理解不同性別中CO發(fā)生的分子機(jī)制提供了見解,并且說明父本選擇可以幫助提高育種效率。主要結(jié)果有:1.開發(fā)了一個(gè)分離玉米單胚囊反足細(xì)胞并用于基因組測(cè)序的方法。在約1.2倍的測(cè)序深度下,可以獲取約40%的基因組覆蓋度;106個(gè)單雌配子體中獲得的2,033,416個(gè)高質(zhì)量SNPs(Single Nucleotide Polymorphisms),高分辨度的雌性重組圖譜被構(gòu)建出來。相比于雄性(平均每個(gè)小孢子19.3次CO,總共962.5 c M),雌性減數(shù)分裂產(chǎn)生更少的CO(平均每個(gè)胚囊12.4次CO...

【文章頁(yè)數(shù)】:82 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
Abstract
縮略語表
1 前言
    1.1 單細(xì)胞全基因組測(cè)序技術(shù)的發(fā)展
        1.1.1 單細(xì)胞分離技術(shù)
        1.1.2 單細(xì)胞全基因組擴(kuò)增技術(shù)
        1.1.3 單細(xì)胞全基因組測(cè)序的應(yīng)用
    1.2 減數(shù)分裂重組交換的研究進(jìn)展
        1.2.1 減數(shù)分裂重組過程
        1.2.2 重組交換的特性和數(shù)學(xué)模型
        1.2.3 重組交換模式的影響因素
        1.2.4 單細(xì)胞水平研究重組交換的相關(guān)技術(shù)
        1.2.5 基于單細(xì)胞基因組學(xué)方法的重組交換性別差異研究
2 材料與方法
    2.1 研究材料
    2.2 單胚囊反足細(xì)胞的分離
    2.3 單細(xì)胞全基因組擴(kuò)增和測(cè)序
        2.3.1 單細(xì)胞全基因組擴(kuò)增
        2.3.2 擴(kuò)增產(chǎn)物質(zhì)量檢測(cè)
        2.3.3 文庫(kù)的構(gòu)建和測(cè)序
    2.4 測(cè)序數(shù)據(jù)分析
        2.4.1 測(cè)序讀段的比對(duì)和SNP的獲取
        2.4.2 高質(zhì)量SNP的篩選
    2.5 短片段雙交換的重測(cè)序驗(yàn)證
    2.6 CO模擬
        2.6.1 基于BF模型的CO模擬
        2.6.2 基于gamma模型的CO模擬
3 結(jié)果與分析
    3.1 單雌配子體全基因組測(cè)序
        3.1.1 單胚囊反足細(xì)胞分離和擴(kuò)增
        3.1.2 雌雄配子體SNP的獲取
    3.2 雌雄CO的鑒定和影響因素分析
        3.2.1 bin map的構(gòu)建
        3.2.2 CO數(shù)量和SC長(zhǎng)度及供體單株的關(guān)系
        3.2.3 CO數(shù)量在雌雄配子體間的差異
    3.3 雌雄重組圖譜的構(gòu)建和差異分析
    3.4 雌雄CO模擬分析
        3.4.1 BF模型的基本原理
        3.4.2 雌雄CO模式的模擬
        3.4.3 模擬參數(shù)和結(jié)果的驗(yàn)證
        3.4.4 不同遺傳背景下的CO模擬
        3.4.5 CMI的發(fā)現(xiàn)和驗(yàn)證
        3.4.6 不同類型CO數(shù)量的性別差異和驗(yàn)證
4 討論
    4.1 單配子體全基因組測(cè)序和減數(shù)分裂數(shù)學(xué)模型的結(jié)合加深了對(duì)重組交換性別差異的理解
    4.2 玉米是研究 CMI 發(fā)生機(jī)制的理想材料
    4.3 減數(shù)分裂性別差異的分子機(jī)制
5 參考文獻(xiàn)
附錄A PCR引物
附錄B PCR反應(yīng)體系
附錄C 單配子體測(cè)序數(shù)據(jù)處理的統(tǒng)計(jì)結(jié)果
附錄D 雌雄配子體(Zheng58 x SK背景)小片段雙交換的Sanger測(cè)序驗(yàn)證
附錄E 雌雄配子體(Zheng58 x SK背景)的CO數(shù)量
附錄F 雌雄配子體(Zheng58 x SK背景)CO熱區(qū)統(tǒng)計(jì)
附錄G 不同群體在BF模型中的最佳擬合參數(shù)
附錄H 作者簡(jiǎn)歷、在讀期間與課題有關(guān)的研究成果,包括發(fā)表的論文、出版專著、參加國(guó)際會(huì)議及論文等
致謝



本文編號(hào):4010554

資料下載
論文發(fā)表

本文鏈接:http://www.wukwdryxk.cn/nykjlw/nzwlw/4010554.html


Copyright(c)文論論文網(wǎng)All Rights Reserved | 網(wǎng)站地圖 |

版權(quán)申明:資料由用戶881f1***提供,本站僅收錄摘要或目錄,作者需要?jiǎng)h除請(qǐng)E-mail郵箱bigeng88@qq.com
亚洲欧洲中文日韩久久A∨乱码| 第一九区另类中文字幕| 久久婷婷国产综合亚洲91| japanese色视频在线播放| 久久精品国产亚洲AVAPP下载| 亚洲色中文字幕在线播放| 成在线人视频免费视频| 亚洲伊人久久大香线蕉综合图片| 超碰AⅤ人人做人人爽欧美| 成在人线av无码免观看| 夜夜精品无码一区二区三区| 久久这里只有精品首页| 人妻熟妇乱又伦精品视频APP | 亚洲中文字幕无码中文字幕| 欧美国产成人精品二区| 99精产国品一二三产区区别电影| 兴城市| 新龙县| 狠狠躁天天躁日日躁欧美| 沽源县| 最近2019年中文字幕| 久久久综合九色综合| 苍井空一区二区三区在线观看| 宜春市| 99国产成人综合久久精品| 中文字幕无码视频手机免费看| 安泽县| aⅴ免费视频在线观看| 成人欧美一区在线视频| 国产成人一区二区三区在线观看| 国产综合视频一区二区三区| 国产精品一区二区av片| 国产成人久久精品一区二区三区| 亚洲VA在线VA天堂XXXX中文| 污污网站18禁在线永久免费观看| 无套中出丰满人妻无码| 图片区小说区激情区偷拍区| 中文毛片无遮挡高清免费| 婷婷五月六月激情综合色中文字幕| 无码少妇一区二区三区| 国产三级久久久精品麻豆三级|