玉米骨干自交系京2416雜種優(yōu)勢及遺傳重組解析
發(fā)布時間:2024-11-03 03:12
【研究背景】玉米骨干自交系京2416是以(京24×5237)×京24構建基礎選系群體,利用高大嚴及同群優(yōu)系聚合等選系技術選育的優(yōu)良黃改群自交系。以其為父本育成的審定品種已有20多個,其中代表性品種京農科728,突破了黃淮海夏玉米籽粒機收技術瓶頸,成為中國首批通過國家審定的機收籽粒品種。通過分析京2416與X群種質的雜種優(yōu)勢,及其形成過程中的重組事件和黃早四基因組片段傳遞規(guī)律,解析京2416形成的遺傳機制,以期為黃改系的進一步遺傳改良提供參考;【材料與方法】選用黃早四、京2416及其2個選系親本(京24和5237)為材料,與5份X群代表性自交系根據(jù)NCII遺傳設計組配雜交組合,利用F1產量相關性狀單穗粒重的中親優(yōu)勢、超高親優(yōu)勢值和配合力效應值評估4份黃改系的雜種優(yōu)勢。對4份黃改系及5份X群自交系進行測序深度約為18×的全基因組重測序,用BWA、GATK等軟件進行序列比對和變異檢測,基于獲得的SNP和InDel標記信息,利用GCTA和Treebest軟件進行主成分分析和系統(tǒng)發(fā)生樹構建,同源傳遞片段(identity-by-descent,IBD)使用IBDseq軟件識別;【結果與分析】通過比...
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【部分圖文】:
本文編號:4010589
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高通量測序為解析骨干親本形成的遺傳基礎提供了豐富的數(shù)據(jù)信息。高密度SNP和InDel分子標記的發(fā)掘和已知的系譜關系可以高分辨率地解析骨干自交系京2416形成的遺傳基礎。京2416的選育過程:首先將京24與5237雜交,再與京24回交1次,構建基礎選系群體,按照高大嚴育種技術(高....
圖19份自交系的主成分分析(A)和系統(tǒng)發(fā)生樹(B)2.4黃早四到京2416基因組片段傳遞
京2416保留了黃早四傳遞下來的很多優(yōu)勢性狀,例如抗病抗逆性強、適宜區(qū)域廣、早熟脫水快、自身產量及配合力高等,這些優(yōu)勢性狀通過黃早四的IBD基因組片段進行傳遞。為了確定黃早四傳遞到京2416的IBD基因組片段,利用IBD方法對黃早四、京2416及其2個選系親本京24和5237的全....
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