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實(shí)驗(yàn)紅鯽線粒體DNA條形碼和核脅迫下HSP70表達(dá)的分析

發(fā)布時(shí)間:2024-06-02 15:16
  目的:1.為進(jìn)一步完善實(shí)驗(yàn)紅鯽C1HD系遺傳背景研究,建立實(shí)驗(yàn)紅鯽C1HD系的線粒體分子標(biāo)記,開展了實(shí)驗(yàn)紅鯽C1HD系線粒體DNA條形碼分析。2.為推廣實(shí)驗(yàn)紅鯽在核輻射生物學(xué)效應(yīng)方面的應(yīng)用研究,探討了137Cs輻射對(duì)實(shí)驗(yàn)紅鯽HSP70表達(dá)的影響。方法:1.設(shè)計(jì)引物對(duì)驗(yàn)紅鯽C1HD系、金魚、同源二倍體金魚和同源二倍體紅鯽、鯽和白鯽等6種魚類的鯽屬魚類線粒體COI、COIII、Cytb和D-loop基因進(jìn)行PCR擴(kuò)增,目的條帶經(jīng)回收、轉(zhuǎn)化后進(jìn)行測(cè)序,獲得測(cè)序結(jié)果。以鯉魚為外類群,結(jié)合NCBI中下載的序列,分別對(duì)每個(gè)基因的序列特征進(jìn)行分析,并計(jì)算種間和種內(nèi)遺傳距離,分析系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系。2.通過(guò)測(cè)序得到實(shí)驗(yàn)紅鯽、同源二倍體金魚、同源二倍體紅鯽和金魚線粒體基因組全序列,對(duì)實(shí)驗(yàn)紅鯽線粒體基因組全序列的結(jié)構(gòu)特征、堿基組成和密碼子使用頻率進(jìn)行分析。最后,結(jié)合NCBI中下載的有關(guān)鯽屬魚類的線粒體基因組全序列構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹。3.根據(jù)實(shí)驗(yàn)紅鯽137Cs輻射的LD50/30,設(shè)計(jì)4.1Gy、6.1Gy、8.2Gy輻照劑量組與空白對(duì)照組,用輻照儀對(duì)...

【文章頁(yè)數(shù)】:76 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

圖2-16種鯽屬魚類不同標(biāo)記基因PCR產(chǎn)物電泳檢測(cè)圖

圖2-16種鯽屬魚類不同標(biāo)記基因PCR產(chǎn)物電泳檢測(cè)圖

V占總序列長(zhǎng)度的15.5%,簡(jiǎn)約信息位點(diǎn)(PI)為65個(gè),自裔位點(diǎn)(S)80個(gè)。從堿基組成來(lái)看(見(jiàn)表2-5),COI序列中4種堿基的平均含量分別是T:29.3%、C:26.2%、A:26.9%、G:17.6%,G的所占比例明顯低于其他3種堿基的比例,且G+C的含....


圖3-1線粒體基因組結(jié)構(gòu)圖

圖3-1線粒體基因組結(jié)構(gòu)圖

22個(gè)tRNA中有8個(gè)位于L鏈上,其他的結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析顯示,其中21種tRNA基因的結(jié)形狀(圖3-2),只有tRNASer(GCT)因二氫尿嘧完整的三葉草結(jié)構(gòu)(圖3-3)。


圖3一2實(shí)驗(yàn)紅卿CllD〕系tRNA三葉草結(jié)構(gòu)模型

圖3一2實(shí)驗(yàn)紅卿CllD〕系tRNA三葉草結(jié)構(gòu)模型

其他密碼子的RSCU值均小于1,使用頻率較低,蛋白編碼基因在密碼子第三位點(diǎn)堿基的使用上也表現(xiàn)為明顯的AT偏向性。圖3-2實(shí)驗(yàn)紅鯽C1HD系tRNA三葉草結(jié)構(gòu)模型Figure3-2TheclassicalcloverleafstructureoftRNAge....


圖3一3實(shí)驗(yàn)紅螂Clll】〕系tRNA加結(jié)構(gòu)模型

圖3一3實(shí)驗(yàn)紅螂Clll】〕系tRNA加結(jié)構(gòu)模型

其他密碼子的RSCU值均小于1,使用頻率較低,蛋白編碼基因在密碼子第三位點(diǎn)堿基的使用上也表現(xiàn)為明顯的AT偏向性。圖3-2實(shí)驗(yàn)紅鯽C1HD系tRNA三葉草結(jié)構(gòu)模型Figure3-2TheclassicalcloverleafstructureoftRNAge....



本文編號(hào):3987423

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