金魚(yú)和鯽PTX3基因的克
發(fā)布時(shí)間:2020-11-21 05:52
金魚(yú)是由我國(guó)野生鯽演變而來(lái)的一類(lèi)觀賞魚(yú)類(lèi),頭瘤類(lèi)金魚(yú)是其眾多品系中重要的一類(lèi)。頭瘤類(lèi)金魚(yú)的觀賞價(jià)值和經(jīng)濟(jì)價(jià)值受頭瘤形狀、大小和顏色等的影響,然而其頭瘤的產(chǎn)生機(jī)制尚不清楚。目前的研究普遍認(rèn)為頭瘤是組織的異常增生。最近的研究發(fā)現(xiàn),隨著頭瘤的發(fā)生,PTX3(Pentraxin 3)基因的表達(dá)水平上調(diào),證明PTX3在金魚(yú)頭瘤發(fā)生過(guò)程中可能發(fā)揮著重要作用;而PTX3在哺乳動(dòng)物中發(fā)揮著類(lèi)抗體、結(jié)合特定病原菌、激活并調(diào)控補(bǔ)體等免疫相關(guān)作用。因此我們推測(cè),在頭瘤的異常增生過(guò)程中,PTX3可能作為免疫相關(guān)因子對(duì)其發(fā)揮持續(xù)免疫的作用。為驗(yàn)證這一推論,我們對(duì)魚(yú)類(lèi)中的PTX3開(kāi)展了相關(guān)研究。主要研究結(jié)論如下:1.PTX3在基因結(jié)構(gòu)和蛋白結(jié)構(gòu)上具有保守性。金魚(yú)和異育銀鯽PTX3基因均由3個(gè)外顯子和2個(gè)內(nèi)含子構(gòu)成。金魚(yú)的兩個(gè)內(nèi)含子分別長(zhǎng)945bp,1519bp;異育銀鯽的兩個(gè)內(nèi)含子分別長(zhǎng)970bp,1513bp。金魚(yú)和異育銀鯽PTX3基因c DNA序列全長(zhǎng)分別為1918bp,1560bp,均包含了一個(gè)1362bp的開(kāi)放閱讀框,編碼453aa的蛋白質(zhì)。預(yù)測(cè)的PTX3蛋白由信號(hào)肽(1-22aa)、氨基端(23-240aa)和PTX結(jié)構(gòu)域(241-453aa)三部分構(gòu)成,在PTX結(jié)構(gòu)域有一非典型的Pentraxin信號(hào)(HICAVWSS)。兩種魚(yú)類(lèi)編碼的PTX3氨基酸序列高度同源,僅有兩個(gè)氨基酸不同。2.PTX3在異育銀鯽各組織中均有表達(dá),在腦和肌肉中的表達(dá)量最高。在嗜水氣單胞菌感染后,PTX3在肝臟、脾臟、頭腎、腸和血液等魚(yú)體的主要免疫器官和組織中均出現(xiàn)顯著的表達(dá)上調(diào)。這一結(jié)果表明PTX3與魚(yú)類(lèi)免疫相關(guān)。3.PTX3體外功能實(shí)驗(yàn)證明,PTX3不具有細(xì)菌抑制活性,但具有細(xì)菌結(jié)合活性,這一結(jié)合在PTX3氨基端區(qū)域和PTX結(jié)構(gòu)域均可發(fā)生。
【學(xué)位單位】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位年份】:2015
【中圖分類(lèi)】:S917.4
【部分圖文】:
金魚(yú)和異育銀鯽PTX3蛋白結(jié)構(gòu)示意圖
22圖 2 金魚(yú) PTX3 基因全長(zhǎng)起始密碼子用方框標(biāo)出;外顯子序列用大寫(xiě)字母表示,下面顯示氨基酸序列;內(nèi)含子/外顯子連接處的 gt/tg 用黑體表示;信號(hào)肽用下劃線標(biāo)出。Fig.2 The full nucleotide sequence of PTX3 in goldfishInitiation codon is surrounded by box;exon sequences are indicated in upper case letters and thededuced amino acid sequence is shown below the nucleotide sequence. The gt/ag intron/exonboundaries are highlighted in boldface.The putative signal peptide is underlined.
23圖 3 異育銀鯽 PTX3 基因全長(zhǎng)起始密碼子用方框標(biāo)出;外顯子序列用大寫(xiě)字母表示,下面顯示氨基酸序列;內(nèi)含子/外顯子連接處的 gt/tg 用黑體表示;信號(hào)肽用下劃線標(biāo)出。Fig.3 The full nucleotide sequence of PTX3 in gibel carpInitiation codon is surrounded by box; exon sequences are indicated in upper case letters and thededuced amino acid sequence is shown below the nucleotide sequence. The gt/ag intron/exonboundaries are highlighted in boldface.The putative signal peptide is underlined.
【參考文獻(xiàn)】
本文編號(hào):2892627
【學(xué)位單位】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位年份】:2015
【中圖分類(lèi)】:S917.4
【部分圖文】:
金魚(yú)和異育銀鯽PTX3蛋白結(jié)構(gòu)示意圖
22圖 2 金魚(yú) PTX3 基因全長(zhǎng)起始密碼子用方框標(biāo)出;外顯子序列用大寫(xiě)字母表示,下面顯示氨基酸序列;內(nèi)含子/外顯子連接處的 gt/tg 用黑體表示;信號(hào)肽用下劃線標(biāo)出。Fig.2 The full nucleotide sequence of PTX3 in goldfishInitiation codon is surrounded by box;exon sequences are indicated in upper case letters and thededuced amino acid sequence is shown below the nucleotide sequence. The gt/ag intron/exonboundaries are highlighted in boldface.The putative signal peptide is underlined.
23圖 3 異育銀鯽 PTX3 基因全長(zhǎng)起始密碼子用方框標(biāo)出;外顯子序列用大寫(xiě)字母表示,下面顯示氨基酸序列;內(nèi)含子/外顯子連接處的 gt/tg 用黑體表示;信號(hào)肽用下劃線標(biāo)出。Fig.3 The full nucleotide sequence of PTX3 in gibel carpInitiation codon is surrounded by box; exon sequences are indicated in upper case letters and thededuced amino acid sequence is shown below the nucleotide sequence. The gt/ag intron/exonboundaries are highlighted in boldface.The putative signal peptide is underlined.
【參考文獻(xiàn)】
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1 潘泓宇;頭瘤類(lèi)金魚(yú)雜交子一代性狀分析及頭瘤的早期發(fā)育[D];上海海洋大學(xué);2012年
本文編號(hào):2892627
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