應(yīng)用SSR技術(shù)研究香蕉種質(zhì)資源的遺傳多樣性
發(fā)布時間：2020-12-05 13:10
香蕉（Musa spp.）是世界上重要的熱帶糧食作物和水果之一,也是我國華南地區(qū)重要的經(jīng)濟(jì)作物。由于香蕉的種質(zhì)資源的遺傳背景不清,且其復(fù)雜的倍性水平、單性結(jié)實(shí)、高度不育和無性繁殖等特點(diǎn),困擾著傳統(tǒng)香蕉育種工作的開展,加上香芽蕉遺傳背景極其相近,用形態(tài)學(xué)方法難以區(qū)分,不利于品種知識產(chǎn)權(quán)的保護(hù),本研究基于簡單重復(fù)序列具有共顯性和重復(fù)性好等特點(diǎn),所以利用SSR分子標(biāo)記研究香蕉種質(zhì)資源的遺傳多樣性。通過篩選獲得多態(tài)性較好的14對SSR引物,利用這14對引物分析了104份基因型為AAA和ABB香蕉資源的親緣關(guān)系,主要結(jié)果如下:1、212對引物的篩選結(jié)果:經(jīng)過瓊脂凝膠電泳得到206對具有擴(kuò)增特異性的引物,其中具有多態(tài)性的引物有180對。97.1%的引物可以成功擴(kuò)增出特異的SSR標(biāo)記條帶;84.9%的引物具有多態(tài)性。最后篩選出14對具有較好多態(tài)性的SSR引物用于研究供試材料遺傳關(guān)系。2、14對引物的擴(kuò)增結(jié)果:14對SSR引物在104份香蕉材料中共擴(kuò)增得到201個等位基因,每對引物平均擴(kuò)增得到14.35個等位基因。引物的多態(tài)性信息含量（PIC）為0.8009-0.9498,平均0.8903。共得到清晰...
【文章來源】：江西農(nóng)業(yè)大學(xué)江西省
【文章頁數(shù)】：54 頁
【學(xué)位級別】：碩士
【部分圖文】：
（3）引物152、148、98的特異性擴(kuò)增結(jié)果
試驗(yàn)結(jié)果與分析圖 3-2（3） 引物 152、148、98 的特異性擴(kuò)增結(jié)果Fig. 3-2 (3) The specific amplification with primer 152, 148 and 98注：M 是 500bp DNA 分子量標(biāo)記；每 1-8 泳道分別表明一個引物的 PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物Note: M is 500bp DNA marker; eeach lanes indicated PCR amplification of primer 152,148 and 98
24圖 3-5（1） 基于 14 對 SSR 引物的 104 份樣品的 UPGMA 聚類圖Fig. 3-5 (1) UPGMA clustering figure of 104samples based on 14 SSR primers
【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]廣西香蕉種質(zhì)資源的SSR分析[J]. 孫嘉曼,尹玲,張進(jìn)忠,韋紹龍,李朝生,劉金成,盧江. 西南農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2016(08)
[2]2013—2014年中國香蕉產(chǎn)銷形勢分析與預(yù)測[J]. 柯佑鵬,過建春,夏勇開,王芳. 廣東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(15)
[3]基于表型性狀和SSR標(biāo)記的20份香蕉材料遺傳多樣性研究[J]. 余智城,何雪嬌,曹明華. 中國南方果樹. 2014(03)
[4]我國香蕉產(chǎn)業(yè)面臨的主要問題與對策[J]. 董濤,陳新建,凡超,金燕,易干軍. 廣東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(11)
[5]SNP分子標(biāo)記的研究及其應(yīng)用進(jìn)展[J]. 唐立群,肖層林,王偉平. 中國農(nóng)學(xué)通報. 2012(12)
[6]香蕉種質(zhì)資源親緣關(guān)系的ISSR分析[J]. 姚錦愛,蔡鴻嬌,石妞妞,甘林,楊秀娟,陳福如. 福建農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2012(01)
[7]香蕉野生種質(zhì)資源系統(tǒng)分類研究進(jìn)展[J]. 馮慧敏,陳友,鄧長娟,李博,武耀廷. 熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué). 2011(05)
[8]中國芭蕉屬野生種表型性狀和SSR多樣性分析[J]. 馮慧敏,陳友,李博,鄧長娟,武耀廷. 熱帶作物學(xué)報. 2011(04)
[9]Analysis of genetic diversity in banana cultivars(Musa cvs.) from the South of Oman using AFLP markers and classification by phylogenetic,hierarchical clustering and principal component analyses[J]. Umezuruike Linus OPARA,Dan JACOBSON,Nadiya Abubakar AL-SAADY. Journal of Zhejiang University-Science B（Biomedicine & Biotechnology）. 2010(05)
[10]部分香蕉品種SSR指紋圖譜的構(gòu)建[J]. 王靜毅,陳業(yè)淵,黃秉智,于飛,武耀廷. 果樹學(xué)報. 2009(05)
博士論文
[1]SSR分子標(biāo)記開發(fā)和在香蕉種質(zhì)資源遺傳分析中的應(yīng)用[D]. 王靜毅.海南大學(xué) 2010
碩士論文
[1]香蕉種質(zhì)資源基因組類型的分子標(biāo)記及倍性鑒定[D]. 閆佼.江西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[2]世界香蕉貿(mào)易格局變化對中國香蕉市場的影響研究[D]. 李佳琪.海南大學(xué) 2015
[3]中國主要蕉類形態(tài)學(xué)與分子系統(tǒng)學(xué)研究[D]. 姜燕.西南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2005
[4]幾種芭蕉屬植物的AFLP分析及分類研究[D]. 李典范.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2002
本文編號：2899501
【文章來源】：江西農(nóng)業(yè)大學(xué)江西省
【文章頁數(shù)】：54 頁
【學(xué)位級別】：碩士
【部分圖文】：
（3）引物152、148、98的特異性擴(kuò)增結(jié)果
試驗(yàn)結(jié)果與分析圖 3-2（3） 引物 152、148、98 的特異性擴(kuò)增結(jié)果Fig. 3-2 (3) The specific amplification with primer 152, 148 and 98注：M 是 500bp DNA 分子量標(biāo)記；每 1-8 泳道分別表明一個引物的 PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物Note: M is 500bp DNA marker; eeach lanes indicated PCR amplification of primer 152,148 and 98
24圖 3-5（1） 基于 14 對 SSR 引物的 104 份樣品的 UPGMA 聚類圖Fig. 3-5 (1) UPGMA clustering figure of 104samples based on 14 SSR primers
【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]廣西香蕉種質(zhì)資源的SSR分析[J]. 孫嘉曼,尹玲,張進(jìn)忠,韋紹龍,李朝生,劉金成,盧江. 西南農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2016(08)
[2]2013—2014年中國香蕉產(chǎn)銷形勢分析與預(yù)測[J]. 柯佑鵬,過建春,夏勇開,王芳. 廣東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(15)
[3]基于表型性狀和SSR標(biāo)記的20份香蕉材料遺傳多樣性研究[J]. 余智城,何雪嬌,曹明華. 中國南方果樹. 2014(03)
[4]我國香蕉產(chǎn)業(yè)面臨的主要問題與對策[J]. 董濤,陳新建,凡超,金燕,易干軍. 廣東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(11)
[5]SNP分子標(biāo)記的研究及其應(yīng)用進(jìn)展[J]. 唐立群,肖層林,王偉平. 中國農(nóng)學(xué)通報. 2012(12)
[6]香蕉種質(zhì)資源親緣關(guān)系的ISSR分析[J]. 姚錦愛,蔡鴻嬌,石妞妞,甘林,楊秀娟,陳福如. 福建農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2012(01)
[7]香蕉野生種質(zhì)資源系統(tǒng)分類研究進(jìn)展[J]. 馮慧敏,陳友,鄧長娟,李博,武耀廷. 熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué). 2011(05)
[8]中國芭蕉屬野生種表型性狀和SSR多樣性分析[J]. 馮慧敏,陳友,李博,鄧長娟,武耀廷. 熱帶作物學(xué)報. 2011(04)
[9]Analysis of genetic diversity in banana cultivars(Musa cvs.) from the South of Oman using AFLP markers and classification by phylogenetic,hierarchical clustering and principal component analyses[J]. Umezuruike Linus OPARA,Dan JACOBSON,Nadiya Abubakar AL-SAADY. Journal of Zhejiang University-Science B（Biomedicine & Biotechnology）. 2010(05)
[10]部分香蕉品種SSR指紋圖譜的構(gòu)建[J]. 王靜毅,陳業(yè)淵,黃秉智,于飛,武耀廷. 果樹學(xué)報. 2009(05)
博士論文
[1]SSR分子標(biāo)記開發(fā)和在香蕉種質(zhì)資源遺傳分析中的應(yīng)用[D]. 王靜毅.海南大學(xué) 2010
碩士論文
[1]香蕉種質(zhì)資源基因組類型的分子標(biāo)記及倍性鑒定[D]. 閆佼.江西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[2]世界香蕉貿(mào)易格局變化對中國香蕉市場的影響研究[D]. 李佳琪.海南大學(xué) 2015
[3]中國主要蕉類形態(tài)學(xué)與分子系統(tǒng)學(xué)研究[D]. 姜燕.西南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2005
[4]幾種芭蕉屬植物的AFLP分析及分類研究[D]. 李典范.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2002
本文編號：2899501
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