發(fā)布時(shí)間：2020-12-16 09:27

　　柑橘（Citrus L.）是世界上重要的經(jīng)濟(jì)作物之一,也是全球第三大貿(mào)易農(nóng)產(chǎn)品,具有重要的營(yíng)養(yǎng)價(jià)值、藥用價(jià)值和生態(tài)價(jià)值。寬皮柑橘原產(chǎn)于我國(guó),在世界柑橘業(yè)中寬皮柑橘的地位僅次于甜橙,我國(guó)的寬皮柑橘品種繁多,目前正處于品種更新和結(jié)構(gòu)調(diào)整時(shí)期,培育出外觀美、品質(zhì)優(yōu)、產(chǎn)量高、易栽培一直是柑橘育種的目標(biāo)�；�于RAPD^[1,2]AFLP^[3-5]、SSR^[6,7]等分子標(biāo)記對(duì)柑橘性狀關(guān)聯(lián)分析的研究已有很多報(bào)道,但是基于全基因范圍內(nèi)SNP多態(tài)位點(diǎn)的全基因關(guān)聯(lián)分析（GWAS）的研究近幾年才顯有報(bào)道。本研究利用240份寬皮柑橘的自然群體,基于GBS簡(jiǎn)化基因組測(cè)序技術(shù),共獲取遍布于整個(gè)柑橘基因組的112,768個(gè)高質(zhì)量SNPs位點(diǎn),對(duì)240份寬皮柑橘的10個(gè)重要性狀（單果重、縱徑、果皮厚度、果皮光滑度、可溶性固形物含量、可滴定酸含量、種子胚型、花藥顏色、囊瓣數(shù)、果形指數(shù)）進(jìn)行連續(xù)兩年的表型鑒定,并利用表型數(shù)據(jù)及SNP標(biāo)記進(jìn)行遺傳多樣性和群體結(jié)構(gòu)分析,將目標(biāo)性狀的表型多樣性與基因的多態(tài)性結(jié)合起來分析,從而鑒定出與表型變異顯著相關(guān)的基因位點(diǎn),并... 

【文章來源】：西南大學(xué)重慶市 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：91 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

40份寬皮柑橘基于18個(gè)性狀的聚類圖

圖 2 240 份寬皮柑橘的主成分分析圖Fig. 2 The principal component analysis of 240 mandarins為對(duì)寬皮柑橘進(jìn)行性狀的綜合評(píng)價(jià)，根據(jù)特征向量矩陣及標(biāo)準(zhǔn)化的表型數(shù)據(jù)得到主成分得分計(jì)算公式，第一主成分得分線性方程如下所示：F1=0.39x1+0.39x2+0.41x3+0.23x4-0.16x5+0.27x6+0.14x7-0.09x8+0.32x9+

圖 3-1 GBS 實(shí)驗(yàn)流程Fig.3-1 GBS experiment procedure.1.4 測(cè)序數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與質(zhì)量分析測(cè)序得到的原始圖像數(shù)據(jù)經(jīng) base calling 轉(zhuǎn)化為序列數(shù)據(jù)，稱之為 raw read

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]寬皮柑橘種質(zhì)資源表型多樣性分析及綜合評(píng)價(jià)[J]. 孫珍珠,李秋月,王小柯,趙婉彤,薛楊,馮錦英,劉小豐,劉夢(mèng)雨,江東.  中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(22)
[2]利用GBS技術(shù)研究240份寬皮柑橘的系統(tǒng)演化[J]. 王小柯,江東,孫珍珠.  中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(09)
[3]271份豌豆種質(zhì)資源農(nóng)藝性狀遺傳多樣性分析[J]. 萬述偉,宋鳳景,郝俊杰,張曉艷,李紅衛(wèi),邵陽,趙愛鴻.  植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2017(01)
[4]我國(guó)柑橘十二五生產(chǎn)現(xiàn)狀和十三五生產(chǎn)發(fā)展趨勢(shì)及對(duì)策[J]. 沈兆敏.  科學(xué)種養(yǎng). 2016(12)
[5]陸地棉核心種質(zhì)表型性狀遺傳多樣性分析及綜合評(píng)價(jià)[J]. 代攀虹,孫君靈,何守樸,王立如,賈銀華,潘兆娥,龐保印,杜雄明,王謐.  中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2016(19)
[6]果實(shí)酸度調(diào)控的遺傳、分子與系統(tǒng)生物學(xué)研究進(jìn)展[J]. 喬梁,曹明浩,鄭劍,鄭志亮.  中國(guó)南方果樹. 2016(04)
[7]45份寬皮柑桔野生和地方資源遺傳多樣性分析[J]. 高恒錦,儲(chǔ)春榮,王小柯,陳紹彬,晏承泉,閆樹堂,孫珍珠,江東.  中國(guó)南方果樹. 2016(02)
[8]谷子核心種質(zhì)表型遺傳多樣性分析及綜合評(píng)價(jià)[J]. 王海崗,賈冠清,智慧,溫琪汾,董俊麗,陳凌,王君杰,曹曉寧,劉思辰,王綸,喬治軍,刁現(xiàn)民.  作物學(xué)報(bào). 2016(01)
[9]20份山西糜子種質(zhì)資源抗旱性綜合評(píng)價(jià)[J]. 王海崗,陳凌,王君杰,曹曉寧,董俊麗,王綸,楊天育,喬治軍.  中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào). 2014(36)
[10]西瓜種質(zhì)資源表型多樣性及聚類分析[J]. 潘存祥,許勇,紀(jì)海波,李玉明,陳年來.  植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2015(01)

博士論文
[1]馬鈴薯種質(zhì)資源遺傳多樣性研究及塊莖性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析[D]. 王艦.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]柑桔無核機(jī)理及無核性狀分子標(biāo)記研究[D]. 肖金平.浙江大學(xué) 2007
[3]‘無核甌柑’、溫州蜜柑無核的細(xì)胞及分子機(jī)理研究[D]. 胡志勇.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
[4]寬皮柑橘（Citrus reticulate Blanco）的遺傳多樣性及系統(tǒng)發(fā)育研究[D]. 李映志.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2006

碩士論文
[1]干旱脅迫對(duì)溫州蜜柑果實(shí)品質(zhì)及檸檬酸代謝相關(guān)基因表達(dá)的影響[D]. 肖玉明.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[2]中國(guó)野生寬皮柑橘酚類物質(zhì)的檢測(cè)及其抗氧化活性研究[D]. 張?jiān)��?西南大學(xué) 2013
[3]暗柳橙及其突變體紅暗柳橙果實(shí)發(fā)育過程中糖酸組分的變化[D]. 顧建芹.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
[4]紅江橙嵌合特性的分子標(biāo)記和無核性狀的細(xì)胞遺傳學(xué)研究[D]. 張青閃.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2006



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