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冬瓜高密度遺傳圖譜構(gòu)建及果皮顏色QTL定位

發(fā)布時間:2024-10-24 21:20
  冬瓜(Benincasa hispida Cogn.),別稱寒瓜、枕瓜,屬于葫蘆科冬瓜屬一年生攀緣植物,具有豐富的營養(yǎng)價值和藥用價值,是我國南菜北運,周年供應(yīng)的特色蔬菜。冬瓜果皮顏色是重要的商品品質(zhì)之一,鮮艷的果皮顏色能提高商品價值,滿足人們對蔬菜品種更新?lián)Q代的要求。而遺傳圖譜構(gòu)建、QTL定位及候選基因預(yù)測等基礎(chǔ)研究,可以深入了解冬瓜生物學(xué)功能,為定向分子輔助育種提供重要的理論指導(dǎo)與技術(shù)方法。本研究利用果皮墨綠色父本(kx-2)和果皮黃白色母本(yo-16)為材料構(gòu)建F2作圖群體,對冬瓜群體進行全基因組重測序,基于測序結(jié)果開發(fā)SNP標(biāo)記并構(gòu)建冬瓜高密度遺傳圖譜;將圖譜與F2子代表型數(shù)據(jù)相結(jié)合完成QTL定位;最后利用參考基因組注釋信息對定位區(qū)間內(nèi)的基因進行注釋并預(yù)測控制冬瓜果皮顏色的候選基因。本研究的主要結(jié)果如下:1.根據(jù)父本、母本和F1代果皮顏色以及葉綠素含量對比發(fā)現(xiàn),冬瓜果皮墨綠色對黃白色不完全顯性,F1果皮顏色為親本的中間色-淡綠色;統(tǒng)計和分析F2子代的表型數(shù)據(jù),發(fā)現(xiàn)F

【文章頁數(shù)】:59 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

冬瓜高密度遺傳圖譜構(gòu)建及果皮顏色QTL定位



廣西大學(xué)碩士學(xué)位論文冬瓜高密度遺傳圖譜構(gòu)建及果皮顏色QTL定位12第二章基于全基因組重測序的冬瓜高密度遺傳圖譜構(gòu)建2.1試驗材料2.1.1親本及作圖群體由南寧科農(nóng)種苗有限責(zé)任公司提供的冬瓜高世代自交系kx-2和yo-16為親本(圖2-1),兩品種的多對果實性狀具有顯著差異。kx-....


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廣西大學(xué)碩士學(xué)位論文冬瓜高密度遺傳圖譜構(gòu)建及果皮顏色QTL定位14圖2-2WGS文庫構(gòu)建流程Fig.2-2FlowchartofWGSlibraryconstruction2.2.3重測序數(shù)據(jù)質(zhì)量評估通過IlluminaHiSeq測序后得到原始數(shù)據(jù)(即Rawdata或Rawrea....


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廣西大學(xué)碩士學(xué)位論文冬瓜高密度遺傳圖譜構(gòu)建及果皮顏色QTL定位18圖2-3SNP標(biāo)記基因分型分布圖Fig.2-3mapofSNPmarkersgenotyping2.3.3高密度遺傳圖譜的構(gòu)建通過篩選獲得了426654個SNP標(biāo)記,對所有標(biāo)記進行重組斷點檢測、孟德爾分離比例的檢驗....


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廣西大學(xué)碩士學(xué)位論文冬瓜高密度遺傳圖譜構(gòu)建及果皮顏色QTL定位19的占比在85.29%-99.37%之間,第7條連鎖群占比最大為99.37%,第9和第10條連鎖群的占比其次為98.7%,占比最小的是第8條連鎖群為85.29%。由此可發(fā)現(xiàn),所有連鎖群中除了個別的連鎖群標(biāo)記較稀疏外,....



本文編號:4008212

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