發(fā)布時間：2024-11-10 08:26

　　 為明確大白菜TPS (BrTPS)家族成員信息及對高溫脅迫信號的響應(yīng),本研究利用生物信息學方法,在大白菜基因組數(shù)據(jù)庫中鑒定了BrTPS基因家族成員,并對其理化性質(zhì)、進化特征、蛋白結(jié)構(gòu)及在高溫脅迫下的表達模式進行分析。結(jié)果表明,大白菜全基因組含有15個TPS基因家族成員,分布于8條染色體上。除BrTPS14和BrTPS15外,其余成員各含有1個TPS和1個TPP結(jié)構(gòu)域,并且所含motif的排列順序也完全一致。理化性質(zhì)分析發(fā)現(xiàn),15個成員的氨基酸長度介于129～1 459 aa之間,分子量大小在14.73～165.83 kD之間,大部分BrTPS蛋白為酸性蛋白和親水蛋白,以無規(guī)則卷曲作為二級結(jié)構(gòu)主要構(gòu)成元件。進化分析表明,大白菜TPS基因家族成員可分為2類,其中ClassⅠ包含5個成員,ClassⅡ包含10個成員。本研究對高溫脅迫前后不同組織和持續(xù)高溫脅迫下葉片中的表達分析,發(fā)現(xiàn)大部分的BrTPS基因可對高溫脅迫產(chǎn)生響應(yīng),但在表達規(guī)律上存在差異。這些研究結(jié)果為后續(xù)研究大白菜TPS基因提供一定參考。

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【部分圖文】：

為進一步分析大白菜TPS基因家族蛋白序列的差異，通過對其motif進行預(yù)測(圖2)，最終獲得10個motif。對發(fā)現(xiàn)的10個motif進行Pfam和SM-ART注釋分析后，共有8個motif得到了命名，分別是motif1、motif2、motif3、motif5、motif7、m....

圖1大白菜TPS基因家族編碼蛋白的系統(tǒng)進化樹1.5高溫脅迫下大白菜TPS家族基因的表達特性

利用Q-PCR技術(shù)，分析了大白菜TPS家族基因在高溫(42℃)處理前后不同組織(根,莖,葉)中的表達情況。結(jié)果表明(圖3)，正常條件下，BrTPS1和BrTP-S3在根和葉中表達量較高，BrTPS2、BrTPS7、BrTPS8、BrTPS11和BrTPS13在葉中的表達量高于在根....

在高溫脅迫不同時間段下大白菜TPS基因在葉片中的表達情況(圖4)。在高溫脅迫過程中，絕大數(shù)BrTPS基因均對高溫脅迫產(chǎn)生響應(yīng)，且呈現(xiàn)出多種相對表達模式，僅BrTPS9和BrTPS14基因表達沒有顯著變化。隨脅迫時間延長，BrTPS1、BrTPS3、BrTPS4、BrTPS5、Br....

本文編號：4011764