發(fā)布時(shí)間：2020-11-19 20:30

　　 背景:胃癌是最常見的惡性腫瘤之一,近年來中國(guó)的胃癌發(fā)病率有增高趨勢(shì),且趨于年輕化。目前胃癌病因尚未完全闡明,發(fā)病隱匿,早期無(wú)明顯癥狀而易漏診,因此胃癌的防治工作存在許多困難,許多的胃癌患者發(fā)現(xiàn)時(shí)處于晚期,治療難度大,死亡率很高。因此如何早期發(fā)現(xiàn)和診斷胃癌,成為防治胃癌的重要課題。生物信息學(xué)可以從基因組和蛋白組相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)中提取海量數(shù)據(jù),從而系統(tǒng)、全面地揭示腫瘤的發(fā)生、發(fā)展的規(guī)律。目的:本研究通過生物信息學(xué)分析非編碼單鏈RNA在胃癌發(fā)生發(fā)展中所起的作用,從而為提高胃癌診斷率提供新的方法及思路。方法:首先,從基因表達(dá)綜合數(shù)據(jù)庫(kù)(gene expression omnibus,GEO)篩選出符合樣本條件的同一個(gè)平臺(tái)的多個(gè)非編碼單鏈RNA芯片,利用Mev等軟件做出熱圖及火山圖,利用GEO2R找出差異基因,同時(shí)找出最顯著的差異非編碼單鏈RNA。接下來通過miRDB及Targetscan兩個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)差異非編碼單鏈RNA進(jìn)行靶基因預(yù)測(cè),同時(shí)取其交集,做出維恩圖,得出最終預(yù)測(cè)靶基因。其次通過DAVID在線軟件對(duì)靶基因進(jìn)行GO富集分析和功能注釋,通過KOBAS在線軟件對(duì)靶基因進(jìn)行KEGG富集分析和功能注釋,了解靶基因的主要功能及所在通路。最后通過TransmiR軟件找出差異非編碼單鏈RNA的上游轉(zhuǎn)錄因子,通過文獻(xiàn)查找轉(zhuǎn)錄因子在胃部惡性腫瘤的發(fā)生與發(fā)展中是否起著重要作用。結(jié)果:差異表達(dá)的非編碼單鏈RNA有hsa-miR-181d,hsa-miR-4481,hsa-miR-574-3p,hsa-miR-623,hsa-miR-4701-3p,hsa-miR-1587,hsa-miR-197-3p,hsa-miRNA-181b-5p這8個(gè),其中最具顯著的差異基因是hsa-miRNA-181b-5p。通過預(yù)測(cè)miRNA-181b-5p靶基因,得到828個(gè)基因,其中通過GO富集分析及KEGG富集分析后得到TGFBR1/TGFBR2在胃癌的發(fā)生發(fā)展中起到重要作用。通過尋找miRNA-181b-5p的轉(zhuǎn)錄因子有ETS1、EZH2、NF-Y、STAT3,其中通過蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫(kù)(HPA)及查閱相關(guān)文獻(xiàn)發(fā)現(xiàn)E2H2在胃癌的發(fā)生及發(fā)展中有著密不可分的關(guān)系。結(jié)論:生物信息學(xué)分析提示hsa-miRNA-181b-5p可作為胃癌的診斷標(biāo)志物。其作用機(jī)制可能是通過轉(zhuǎn)錄因子EZH2與miRNA-181b-5p相結(jié)合作用于靶基因TGFBR1/TGFBR2,然后通過TGFβ信號(hào)系統(tǒng)導(dǎo)致胃癌的發(fā)生發(fā)展。
【學(xué)位單位】：南華大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位年份】：2019
【中圖分類】：R735.2;Q811.4
【部分圖文】：

第 3 章 結(jié)果3.1 差異表達(dá)的 miRNA通過 GEO 數(shù)據(jù)庫(kù)篩選出符合條件的序列通過 t 檢驗(yàn)進(jìn)行差異分析后，取P<0.05 為有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義，然后取表達(dá)值倍數(shù)的變化值（fold change,FC）≥1.5得出顯著的差異 miRNA(見表 3.1)，有 hsa-miR-181b-5p，hsa-miR-181d，hsa-miR-4481，hsa-miR-574-3p，hsa-miR-623 ，hsa-miR-4701-3p ，hsa-miR-1587 以及 hsa-miR-197-3p 共 8 個(gè)差異 miRNA，同時(shí)繪制熱圖及火山圖（見圖 3.1 及 3.2），得出 8 個(gè)差異 miRNA 全為表達(dá)上調(diào) miRNA。其中has-miR181b-5p 最具差異顯著性，接下來將對(duì) has-miR-181b-5p 進(jìn)行生物信息學(xué)方面的分析。

火山圖

3.2 has-miR181b-5p 的靶基因預(yù)測(cè)通過兩大靶基因預(yù)測(cè)數(shù)據(jù)庫(kù) Targetscan 及 miRDB 對(duì) has-miR-181b-5p 的因進(jìn)行預(yù)測(cè)，同時(shí)取兩個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)的交集，得到 has-miR-181b-5p 的潛在靶基 828 個(gè)，并繪制韋恩圖（見圖 3.3），所有靶基因的名字見表 3.2。
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1 徐大志;;胃癌患者關(guān)心的幾個(gè)問題[J];江蘇衛(wèi)生保健;2019年01期

2 汪明;;小心胃癌的六個(gè)信號(hào)[J];農(nóng)村新技術(shù);2019年08期

3 李超;王昕;康倩;潘元明;楊桂彬;;胃脂肪酶在胃癌中的表達(dá)及臨床意義[J];胃腸病學(xué)和肝病學(xué)雜志;2018年08期

4 柴振中;姚利琴;王建娥;崔戈;馮文明;;2型糖尿病與胃癌發(fā)生的相關(guān)性研究[J];中國(guó)現(xiàn)代醫(yī)生;2018年23期

5 周亞蘭;;胃癌診斷中X線診斷的臨床應(yīng)用價(jià)值評(píng)價(jià)[J];臨床醫(yī)藥文獻(xiàn)電子雜志;2016年54期

6 張漢語(yǔ);;胃癌為何“偏愛”東亞特別是中國(guó)人[J];飲食科學(xué);2018年05期

7 朱本浩;;防治胃癌重在“早”[J];健康生活;2016年12期

8 樂和;;中國(guó)式胃癌為何死亡高發(fā)?[J];健康之家;2016年12期

9 王旭芳;;彩色多普勒超聲應(yīng)用在胃癌患者診斷中的臨床分析[J];影像視覺;2016年Z3期

10 李少軍;;探究胃癌的CT表現(xiàn)及診斷價(jià)值[J];人人健康;2016年20期

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1 賈妍;miR-1296-5p在胃癌組織細(xì)胞中的表達(dá)、功能及作用機(jī)制研究[D];河北醫(yī)科大學(xué);2019年

2 許義松;胃癌分子分型及AKR1C2與5-FU/DDP敏感性關(guān)系的研究[D];西北大學(xué);2019年

3 彭興春;ERK通路激動(dòng)劑抑制胃癌細(xì)胞增殖的作用及其機(jī)制研究[D];上海交通大學(xué);2016年

4 黃艷霞;LncRNA AK023391介導(dǎo)氧化苦參堿調(diào)控胃癌的分子機(jī)制研究[D];上海交通大學(xué);2018年

5 黃錦宇;Borrmann 4型胃癌的預(yù)后價(jià)值分析以及LIPC調(diào)控Borrmann 4型胃癌惡性生物學(xué)行為的機(jī)制研究[D];中國(guó)醫(yī)科大學(xué);2019年

6 趙博超;MicroRNA-26b通過靶向調(diào)控CDC6表達(dá)抑制胃癌細(xì)胞增殖、侵襲能力的實(shí)驗(yàn)研究[D];中國(guó)醫(yī)科大學(xué);2019年

7 陳小華;能譜CT多參數(shù)成像與胃癌脈管生成的關(guān)系及其在臨床預(yù)后中的價(jià)值[D];鄭州大學(xué);2018年

8 陳望;動(dòng)態(tài)容積CT增強(qiáng)掃描與血管成像在胃癌術(shù)前評(píng)估中的應(yīng)用價(jià)值[D];鄭州大學(xué);2018年

9 沈潔;血漿游離mRNA在胃癌個(gè)體化藥物治療中的療效預(yù)測(cè)與評(píng)價(jià)[D];南京大學(xué);2013年

10 麻聞慧;SLP2通過PHB活化MAPK信號(hào)通路促進(jìn)胃癌細(xì)胞增殖和侵襲的分子調(diào)控機(jī)制[D];南方醫(yī)科大學(xué);2016年

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1 葉庭菠;MicroRNA-7成熟障礙活化NF-κB通路在胃癌遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移的作用與調(diào)控機(jī)制[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2019年

2 胡世康;多模數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)的胃癌篩查智能輔助決策方法研究[D];合肥工業(yè)大學(xué);2019年

3 侯震濤;Lgr5和β-catenin蛋白在胃癌中表達(dá)及其相關(guān)性的研究[D];蚌埠醫(yī)學(xué)院;2019年

4 朱聚龍;胃癌術(shù)后化療患者肝功能異常的相關(guān)因素分析[D];河南科技大學(xué);2019年

5 蘭亭竹;血清循環(huán)游離DNA含量及完整性對(duì)胃癌診斷及治療價(jià)值的研究[D];北華大學(xué);2019年

6 王碩;血清DR-70與胃癌臨床病理特征的相關(guān)性分析[D];濟(jì)南大學(xué);2019年

7 成艷麗;基于運(yùn)氣學(xué)說探究胃癌患者體質(zhì)及出生時(shí)期分布規(guī)律研究[D];山西中醫(yī)藥大學(xué);2019年

8 馬千清;口服胃超聲造影在胃部病變聲像圖特征的臨床研究[D];皖南醫(yī)學(xué)院;2019年

9 劉小岑;miRNA-221、P53與胃癌化療敏感性的相關(guān)性研究[D];皖南醫(yī)學(xué)院;2019年

10 狄蘇紅;NUAK1及其下游靶基因在胃癌中的研究[D];南昌大學(xué);2019年

本文編號(hào)：2890404