發(fā)布時(shí)間：2020-12-05 13:21

　　重金屬相關(guān)的異戊二烯化蛋白（heavy metal associated isoprenylated plant protein,HIPP）,屬于植物金屬伴侶蛋白,該類蛋白主要在植物細(xì)胞的重金屬穩(wěn)態(tài)和解毒機(jī)制中發(fā)揮重要作用,同時(shí)發(fā)現(xiàn)可能是響應(yīng)非生物脅迫轉(zhuǎn)錄反應(yīng)中的調(diào)節(jié)元件。對該類基因在逆境應(yīng)答的分析,可為植物逆境耐受性的研究提供理論資料。本研究從菠菜轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫中獲得SpoHIPP39基因的cDNA全長,共計(jì)1747 bp,其中最大開放閱讀框?yàn)?19 bp,編碼蛋白為172個(gè)氨基酸,具有HMA保守結(jié)構(gòu)域和異戊二烯化基序。利用PCR技術(shù)獲得SpoHIPP39基因的cDNA全長,以該基因編碼的氨基酸序列和已知的擬南芥HIPP蛋白序列為依據(jù)建立HIPP蛋白家族的（Hidden Markov Model,HMM）模型,通過建立的模型進(jìn)行菠菜轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫搜庫,確定34個(gè)菠菜HIPP家族蛋白。對于該家族成員分析,預(yù)測均不含有跨膜區(qū)域和信號肽,認(rèn)為該家族蛋白均為胞內(nèi)蛋白。通過將SpoHIPP39基因構(gòu)建至帶有綠色熒光蛋白（Green fluorescent protein,GFP）的pBI121-G... 

【文章來源】：東北農(nóng)業(yè)大學(xué)黑龍江省 211工程院校

【文章頁數(shù)】：60 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

SpoHIPP39基因全長的PCR驗(yàn)證Fig.3-2Full-lengthcDNAsequenceamplificationofSpoHIPP39byPCR

結(jié)果與分析與分析菜SpoHIPP39基因cDNA全長的獲得菜 Sp75 品系 RNA 的獲得生長狀態(tài)良好的成熟期菠菜，取葉片提取菠菜總RNA，進(jìn)行瓊超微量分光光度計(jì)測定總RNA濃度以及RNA純度。如圖所示，為0.78μg/μL和0.70μg/μL，其中28SrRNA與18SrRNA亮度比值260/A280比值分別為1.99、1.98，證明菠菜葉片總RNA純度很高，以作為下一步實(shí)驗(yàn)樣本。1 2

東北農(nóng)業(yè)大學(xué)理學(xué)碩士學(xué)位論文2 菠菜SpoHIPP基因家族的生物信息學(xué)分析2.1 菠菜 SpoHIPP39 基因 cDNA 全長的序列分析菠菜SpoHIPP39基因cDNA全長共519bp，編碼172個(gè)氨基酸。紅框處為異戊二烯化色框處為編碼HMA保守結(jié)構(gòu)域序列。該基因編碼的蛋白質(zhì)符合HIPP蛋白特性，屬于H ， 其氨 基 酸序 列 進(jìn)行BLASTp分 析， 確 定為 菠 菜 SpoHIPP39 蛋 白， NCBI序 列_021850468.1。理論分子量為19.9kDa，等電點(diǎn)為6.69。ATGAAGAAAATAGTGTTGAAATTGGATTTGCATGATGACAAGGCGAAGCAAAAAGCTCTT


本文編號：2899515