組蛋白甲基轉(zhuǎn)移酶參與草酸青霉糖苷水解酶合成調(diào)控的研究
發(fā)布時(shí)間:2020-12-09 01:52
木質(zhì)纖維素的微生物酶水解是全球碳循環(huán)和生物質(zhì)利用的關(guān)鍵步驟。絲狀真菌中纖維素降解酶的合成受到轉(zhuǎn)錄水平的嚴(yán)格調(diào)控。組蛋白甲基化修飾是染色質(zhì)調(diào)控的重要形式,是真核細(xì)胞基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控的關(guān)鍵因素。探索組蛋白修飾在纖維素降解真菌中的生物學(xué)功能,將有助于發(fā)掘影響纖維素酶合成的新的關(guān)鍵調(diào)控因子,全面地闡明纖維素酶合成的調(diào)控網(wǎng)絡(luò),為構(gòu)建高產(chǎn)纖維素酶菌株提供遺傳改造的合理靶點(diǎn)。本論文以重要的纖維素酶生產(chǎn)真菌草酸青霉為研究對(duì)象,通過表觀遺傳學(xué)的研究方法,聚焦于幾種典型的組蛋白甲基轉(zhuǎn)移酶的生物學(xué)功能研究,確認(rèn)草酸青霉纖維素酶產(chǎn)生與組蛋白甲基化修飾之間的關(guān)聯(lián),并對(duì)組蛋白甲基化調(diào)控糖苷水解酶基因表達(dá)的機(jī)制進(jìn)行了探究。本論文的主要研究結(jié)果如下:1.組蛋白甲基轉(zhuǎn)移酶LaeA在草酸青霉纖維素酶和β-木糖苷酶合成中具有相反的調(diào)控功能。通過比較四株突變株ΔlaeA(laeA敲除菌株)、OEclrBΔlaeA(clrB過表達(dá)laeA敲除菌株)、OExlnRΔlaeA(xlnR過表達(dá)laeA敲除菌株)和ΔcreAΔlaeA(creA和laeA雙敲除菌株)與各自的出發(fā)菌株WT(野生型)、OEclrB(clrB過表達(dá)菌株)、OEx...
【文章來源】:山東大學(xué)山東省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:185 頁
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
圖1.2組蛋白N末端發(fā)生的部分修飾
(Methyl-binding?domain,?MBD)蛋白的結(jié)合位點(diǎn),常與染色質(zhì)重塑蛋白和轉(zhuǎn)錄??共抑制因子復(fù)合物結(jié)合,導(dǎo)致基因沉默(Kloseetal.,2006)。DNA甲基化與組蛋??白修飾相結(jié)合(圖1.3),創(chuàng)建了一個(gè)與DNA序列協(xié)調(diào)運(yùn)作、動(dòng)態(tài)調(diào)節(jié)染色質(zhì)功??能的多樣化的表觀遺傳學(xué)景觀(Scott?et?al.,?2014)。??Repressive??Permissive??圖1.3染色質(zhì)修飾與“松散”或“抑制”環(huán)境相關(guān)。組蛋白尾巴的修飾和DNA甲基化與染??色質(zhì)濃縮的“抑制”狀態(tài)或更易接近的染色質(zhì)的“松散”狀態(tài)有關(guān)。紅色小球,DNA甲基??化;紫色小球,抑制性組蛋白修飾;綠色小球,活性組蛋白修飾;黃色球體,組蛋白;藍(lán)色??球體,組蛋白變體(Costello?and?Schones,?2018)。??Fig.?1.3?Chromatin?modifications?associated?with?“permissive”?or?“repressive”?environments.??Modifications?to?histone?tails?and?DNA?methylation?are?associated?with?“repressive”?states?with??condensed?chromatin?or?“permissive”?state?of?more?accessible?chromatin.?Red?balls,?DNA??methylation;?purple?balls
1.3.1組蛋白修飾參與染色質(zhì)狀態(tài)的調(diào)節(jié)??組蛋白N端尾部的翻譯后修飾可以產(chǎn)生轉(zhuǎn)錄活性的常染色質(zhì)或轉(zhuǎn)錄抑制性??的異染色質(zhì),如圖1.5所示。異染色質(zhì)對(duì)維持染色體結(jié)構(gòu)很重要,特別是在沒有??端粒酶的情況下(Jain?et?al.,?2010)。位于常染色質(zhì)的核小體通常具有H3K4me3、??H3K36me3、H3K79me3、H3ac或H4ac的組合標(biāo)記;位于異染色質(zhì)的核小體則??存在H3K9和H3K27位點(diǎn)的甲基化修飾。各種修飾機(jī)器之間的串?dāng)_(crosstalk)??產(chǎn)生相互關(guān)聯(lián)的正負(fù)反饋回路,控制染色質(zhì)狀態(tài)和基因的沉默與否(Zhangetal.,??2015)。??16??
本文編號(hào):2906043
【文章來源】:山東大學(xué)山東省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:185 頁
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
圖1.2組蛋白N末端發(fā)生的部分修飾
(Methyl-binding?domain,?MBD)蛋白的結(jié)合位點(diǎn),常與染色質(zhì)重塑蛋白和轉(zhuǎn)錄??共抑制因子復(fù)合物結(jié)合,導(dǎo)致基因沉默(Kloseetal.,2006)。DNA甲基化與組蛋??白修飾相結(jié)合(圖1.3),創(chuàng)建了一個(gè)與DNA序列協(xié)調(diào)運(yùn)作、動(dòng)態(tài)調(diào)節(jié)染色質(zhì)功??能的多樣化的表觀遺傳學(xué)景觀(Scott?et?al.,?2014)。??Repressive??Permissive??圖1.3染色質(zhì)修飾與“松散”或“抑制”環(huán)境相關(guān)。組蛋白尾巴的修飾和DNA甲基化與染??色質(zhì)濃縮的“抑制”狀態(tài)或更易接近的染色質(zhì)的“松散”狀態(tài)有關(guān)。紅色小球,DNA甲基??化;紫色小球,抑制性組蛋白修飾;綠色小球,活性組蛋白修飾;黃色球體,組蛋白;藍(lán)色??球體,組蛋白變體(Costello?and?Schones,?2018)。??Fig.?1.3?Chromatin?modifications?associated?with?“permissive”?or?“repressive”?environments.??Modifications?to?histone?tails?and?DNA?methylation?are?associated?with?“repressive”?states?with??condensed?chromatin?or?“permissive”?state?of?more?accessible?chromatin.?Red?balls,?DNA??methylation;?purple?balls
1.3.1組蛋白修飾參與染色質(zhì)狀態(tài)的調(diào)節(jié)??組蛋白N端尾部的翻譯后修飾可以產(chǎn)生轉(zhuǎn)錄活性的常染色質(zhì)或轉(zhuǎn)錄抑制性??的異染色質(zhì),如圖1.5所示。異染色質(zhì)對(duì)維持染色體結(jié)構(gòu)很重要,特別是在沒有??端粒酶的情況下(Jain?et?al.,?2010)。位于常染色質(zhì)的核小體通常具有H3K4me3、??H3K36me3、H3K79me3、H3ac或H4ac的組合標(biāo)記;位于異染色質(zhì)的核小體則??存在H3K9和H3K27位點(diǎn)的甲基化修飾。各種修飾機(jī)器之間的串?dāng)_(crosstalk)??產(chǎn)生相互關(guān)聯(lián)的正負(fù)反饋回路,控制染色質(zhì)狀態(tài)和基因的沉默與否(Zhangetal.,??2015)。??16??
本文編號(hào):2906043
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