發(fā)布時間：2024-07-02 19:46

　　昆蟲腸道共生大量微生物,其豐富度因種類不同有較大差異。大多數(shù)昆蟲的微生物定殖尚未了解,其菌群組成還有很大研究空間。優(yōu)雅蟈蟲(Gampsocleis gratiosa)隸屬于直翅目(Orthoptera)蟲斯科(Tettigoniidae),是研究直翅目昆蟲生長發(fā)育的良好模式生物,其研究對不完全變態(tài)、也非社會性的昆蟲有代表意義。主要結果如下:1、本課題基于16S rDNA V3-V4區(qū)450 bp高變序列,通過Illumina MiseqTM高通量測序,分別對優(yōu)雅蟈螽兩性1-7齡若蟲、以及成體4個階段,在活體狀態(tài)持續(xù)收集糞便,對腸道微生物組成進行研究,每組3個生物學重復,共66個糞便樣品。單個樣品測序20.79-24.82萬條序列,共計獲得20.96 Gb原始數(shù)據(jù)。2、去除Barcode、引物和接頭序列,根據(jù)Overlap關系,把成對序列拼接成一條序列。然后按照測序前的Barcode標簽,分離出需要的各樣本數(shù)據(jù)。并對分離得到的數(shù)據(jù)質控過濾,以去除嵌合體和非特異性擴增序列,獲得最終數(shù)據(jù)。按照97%的相似性閾值,共獲得576684個OTU。3、門、綱、目、科級水平,優(yōu)勢菌均比較單一,其他菌群...

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【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖２－１?ＤＮＡ電泳圖??Ｆｉｇ．２－１?Ｔｈｅ?ｅｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｓｉｓ?ｏｆ?ＤＮＡ??

圖２－１?ＤＮＡ電泳圖??Ｆｉｇ．２－１?Ｔｈｅ?ｅｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｓｉｓ?ｏｆ?ＤＮＡ??表２－４點樣順序及濃度??Ｔａｂｌｅ?２－４?Ｔｈｅ?ｓｐｏｔ?ｏｒｄｅｒ?ａｎｄ?ｃｏｎｃｅｎｔｒａｔｉｏｎ??Ｓａｍｐｌｅ—ＩＤ?ＭＮ１－Ａ?ＭＮ２－Ａ?ＭＮ３－Ａ?ＭＮ４－Ａ?....

圖２－２?１６Ｓ?ｒＤＮＡ?Ｖ３－Ｖ４?ＰＣＲ產物電泳圖??Ｆｉｇ．２－２?Ｔｈｅ?ＰＣＲ?ｅｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｓｉｓ?ｐｒｏｄｕｃｔｓ?ｏｆ?１６Ｓ?ｒＤＮＡ?Ｖ３－Ｖ４??

表２－８第二輪反應程序??Ｔａｂｌｅ?２－８?Ｒｅａｃｔｉｏｎ?ｐｒｏｇｒａｍ?（ｓｅｃｏｎｄ?ｒｏｕｎｄ）??反應程淨?Ｗｍ?ｉｆｉ?循環(huán)數(shù)??Ｐｒｏｇｒａｍ?Ｔｅｍｐｅｒａｔｕｒｅ?Ｔｉｍｅ?Ｃｙｃｌｅｓ??預變性?９５?°Ｃ?３?ｍｉｎ?１?ｃｙｃｌｅ??９４?°Ｃ?２０?....

圖２－３質控后優(yōu)雅蟈螽雄性序列長度分布圖??Ｆｉｇ．２－３?Ｌｅｎｇｔｈ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ｏｆ?ｒｅａｄｓ?ａｆｔｅｒ?ＱＣ?（ｍａｌｅ?

圖２－３質控后優(yōu)雅蟈螽雄性序列長度分布圖??Ｆｉｇ．２－３?Ｌｅｎｇｔｈ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ｏｆ?ｒｅａｄｓ?ａｆｔｅｒ?ＱＣ?（ｍａｌｅ?Ｇａｍｐｓｏｃｌｅｉｓ?ｇｒａｔｉｏｓａ）??３２??

圖２－４質控后優(yōu)雅蟈螽雌性序列長度分布圖??Ｆｉｇ．２－４?Ｌｅｎｇｔｈ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ｏｆ?ｒｅａｄｓ?ａｆｔｅｒ?ＱＣ?（ｆｅｍａｌｅ?Ｇａｍｐｓｏｃｌｅｉｓ?ｇｒａｔｉｏｓａ）??各樣本的編號、分組情況、Ｂａｒｃｏｄｅ序列、原始序列數(shù)目，以及?

ＭＡ３?ＭＡ４??圖２－３質控后優(yōu)雅蟈螽雄性序列長度分布圖??Ｆｉｇ．２－３?Ｌｅｎｇｔｈ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ｏｆ?ｒｅａｄｓ?ａｆｔｅｒ?ＱＣ?（ｍａｌｅ?Ｇａｍｐｓｏｃｌｅｉｓ?ｇｒａｔｉｏｓａ）??３２??

本文編號：3999918