Shinella sp.HZN7代謝尼古丁的分子機(jī)制初步研究
發(fā)布時(shí)間:2024-06-14 06:20
尼古丁作為一種有毒的危險(xiǎn)廢棄物,給人們的生存環(huán)境帶來(lái)了極大威脅,從煙草廢棄物中去除尼古丁或者將其轉(zhuǎn)化為有價(jià)值的化合物顯得尤為重要,而微生物處理方法因其快速、價(jià)廉等優(yōu)點(diǎn)被普遍關(guān)注。研究微生物降解尼古丁的機(jī)理可為揭示尼古丁代謝的生物化學(xué)機(jī)制和進(jìn)一步的實(shí)際應(yīng)用提供理論依據(jù)和參考。本論文從杭州農(nóng)藥廠的活性污泥中篩選到一株新型高效降解尼古丁的菌株Shinellasp.HZN7,并對(duì)其生理生化特性進(jìn)行了研究,結(jié)果顯示:菌株HZN7在30~35 ℃時(shí)降解效率最高;在pH值6.5~8.0之間降解速率變化不大。在溫度為30 ℃,pH為7.0的條件下,Shinella sp.HZN7能在3小時(shí)內(nèi)將濃度為500mg/L的尼古丁完全降解。然后研究了該菌株的代謝中間產(chǎn)物,利用紫外光譜儀(UV)、高效液相色譜儀(HPLC)和高效液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用儀(LC-MS)共檢測(cè)到五種代謝中間產(chǎn)物,分別為6-羥基尼古丁(6-hydroxy-nicotine,6HN),6-羥基麥斯明(6-hydroxy-N-methylmyosmine,6HMM),6-羥基假氧尼古丁(6-hydroxypseudooxynicotine,6H...
【文章頁(yè)數(shù)】:90 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 尼古丁簡(jiǎn)介
1.1.1 尼古丁的性質(zhì)
1.1.2 尼古丁的來(lái)源和用途
1.2 尼古丁的污染及危害
1.2.1 尼古丁的污染
1.2.2 尼古丁對(duì)人類(lèi)的危害
1.3 微生物降解尼古丁的研究現(xiàn)狀
1.3.1 降解尼古丁的微生物
1.3.2 尼古丁降解過(guò)程中的顏色反應(yīng)
1.4 尼古丁的代謝途徑及其分子機(jī)制
1.4.1 吡啶途徑及其分子機(jī)制
1.4.2 吡咯烷途徑及其分子機(jī)制
1.4.3 吡啶和吡咯烷交叉途徑
1.4.4 脫甲基途徑
1.5 尼古丁降解菌的生物技術(shù)應(yīng)用
1.5.1 尼古丁降解菌降解尼古丁的最佳條件
1.5.2 尼古丁代謝中間產(chǎn)物應(yīng)用
1.6 本研究的目的、意義和主要內(nèi)容
1.6.1 研究的目的和意義
1.6.2 研究的主要內(nèi)容
第二章 尼古丁降解菌Shinella sp. HZN7的篩選和鑒定
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.1.1 菌種、試劑和所用儀器
2.1.2 培養(yǎng)基
2.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.2.1 尼古丁降解菌株的富集、純化和分離
2.2.2 菌株的培養(yǎng)特征和生理生化特性的測(cè)定
2.2.3 菌株16S rDNA序列的測(cè)定和鑒定
2.2.3.1 菌株基因組DNA提取
2.2.3.2 菌株16S rRNA基因的PCR擴(kuò)增
2.2.3.3 菌株16S rRNA基因PCR產(chǎn)物的回收和T/A克隆
2.2.3.4 感受態(tài)細(xì)胞的制備與酶連產(chǎn)物的轉(zhuǎn)化
2.2.3.5 質(zhì)粒DNA的提取
2.2.3.6 16S rRNA序列測(cè)定和菌株系統(tǒng)發(fā)育地位的確定
2.3 結(jié)果與討論
2.3.1 尼古丁降解菌的篩選、分離和純化
2.3.2 菌株HZN7的培養(yǎng)特征及生理生化特性
2.3.3 菌株HZN7的測(cè)序結(jié)果及系統(tǒng)發(fā)育地位的確定
2.4 本章小結(jié)
第三章 Shinella sp. HZN7的降解特性及代謝途徑研究
3.1 實(shí)驗(yàn)材料
3.1.1 菌株、試劑和所用儀器
3.1.2 培養(yǎng)基
3.2 實(shí)驗(yàn)方法
3.2.1 菌株Shinella sp. HZN7種子液制備
3.2.2 尼古丁含量測(cè)定
3.2.3 不同pH值下菌株對(duì)尼古丁的降解
3.2.4 不同溫度下菌株對(duì)尼古丁的降解
3.2.5 不同接菌量下菌株對(duì)尼古丁的降解
3.2.6 不同初始尼古丁濃度下菌株對(duì)尼古丁的降解
3.2.7 尼古丁及其代謝中間產(chǎn)物的檢測(cè)方法
3.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析
3.3.1 pH值對(duì)菌株Shinella sp. HZN7降解尼古丁的影響
3.3.2 溫度對(duì)菌株Shinella sp. HZN7降解尼古丁的影響
3.3.3 接種量對(duì)菌株Shinella sp. HZN7降解尼古丁的影響
3.3.4 尼古丁初始濃度對(duì)菌株Shinella sp. HZN7降解尼古丁的影響
3.3.5 代謝中間產(chǎn)物測(cè)定
3.3.6 Shinella sp. HZN7降解途徑推測(cè)
3.4 本章小節(jié)
第四章 轉(zhuǎn)座子突變文庫(kù)的構(gòu)建與篩選
4.1 實(shí)驗(yàn)材料
4.1.1 菌株、試劑和儀器
4.1.2 培養(yǎng)基
4.2 實(shí)驗(yàn)方法
4.2.1 菌株誘變前培養(yǎng)
4.2.2 轉(zhuǎn)座子誘變
4.2.3 轉(zhuǎn)座子突變株的篩選
4.2.4 失活突變株降解尼古丁的驗(yàn)證
4.2.5 突變株降解液的檢測(cè)
4.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與討論
4.3.1 菌株HZN7誘變最適條件
4.3.2 菌株HZN7插入突變效率
4.3.3 代表性轉(zhuǎn)座子突變株的初步分析
4.3.3.1 a型突變株
4.3.3.2 b型突變株
4.3.3.3 c型突變株
4.3.3.4 d型突變株
4.3.3.5 e型突變株
4.4 本章小結(jié)
第五章 降解途徑的驗(yàn)證和其中一株突變株缺失基因的克隆及功能分析
5.1 實(shí)驗(yàn)材料
5.1.1 菌株、試劑和儀器
5.1.2 培養(yǎng)基
5.2 實(shí)驗(yàn)方法
5.2.1 6HN,6HMM、6HPON和HSP的制備
5.2.2 菌株HZN7及其突變株對(duì)各種中間產(chǎn)物的降解
5.2.3 轉(zhuǎn)座子突變基因的克隆
5.2.4 克隆序列的測(cè)定、組裝和分析
5.2.5 orf2基因的敲除
5.2.5.1 基因片段的敲除及同源重組片段的構(gòu)建
5.2.5.2 構(gòu)建同源重組載體
5.2.5.3 基因敲除重組子的獲得
5.2.5.4 orf2基因功能
5.3 結(jié)果與分析
5.3.1 菌株HZN7及其突變株降解分析
5.3.2 降解途徑的確定
5.3.3 SEFA-PCR克隆突變株N7-X5突變基因的分析
5.3.4 基因的敲除與功能互補(bǔ)分析
5.4 討論
5.4.1 降解途徑
5.4.2 突變株的選擇
5.4.3 新代謝產(chǎn)物的預(yù)測(cè)
5.5 本章小結(jié)
第六章 論文總結(jié)
6.1 研究?jī)?nèi)容
6.2 創(chuàng)新點(diǎn)
6.3 不足與展望
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
攻讀學(xué)位期間的研究成果
發(fā)表的文章
專(zhuān)利
本文編號(hào):3994267
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摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 尼古丁簡(jiǎn)介
1.1.1 尼古丁的性質(zhì)
1.1.2 尼古丁的來(lái)源和用途
1.2 尼古丁的污染及危害
1.2.1 尼古丁的污染
1.2.2 尼古丁對(duì)人類(lèi)的危害
1.3 微生物降解尼古丁的研究現(xiàn)狀
1.3.1 降解尼古丁的微生物
1.3.2 尼古丁降解過(guò)程中的顏色反應(yīng)
1.4 尼古丁的代謝途徑及其分子機(jī)制
1.4.1 吡啶途徑及其分子機(jī)制
1.4.2 吡咯烷途徑及其分子機(jī)制
1.4.3 吡啶和吡咯烷交叉途徑
1.4.4 脫甲基途徑
1.5 尼古丁降解菌的生物技術(shù)應(yīng)用
1.5.1 尼古丁降解菌降解尼古丁的最佳條件
1.5.2 尼古丁代謝中間產(chǎn)物應(yīng)用
1.6 本研究的目的、意義和主要內(nèi)容
1.6.1 研究的目的和意義
1.6.2 研究的主要內(nèi)容
第二章 尼古丁降解菌Shinella sp. HZN7的篩選和鑒定
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.1.1 菌種、試劑和所用儀器
2.1.2 培養(yǎng)基
2.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.2.1 尼古丁降解菌株的富集、純化和分離
2.2.2 菌株的培養(yǎng)特征和生理生化特性的測(cè)定
2.2.3 菌株16S rDNA序列的測(cè)定和鑒定
2.2.3.1 菌株基因組DNA提取
2.2.3.2 菌株16S rRNA基因的PCR擴(kuò)增
2.2.3.3 菌株16S rRNA基因PCR產(chǎn)物的回收和T/A克隆
2.2.3.4 感受態(tài)細(xì)胞的制備與酶連產(chǎn)物的轉(zhuǎn)化
2.2.3.5 質(zhì)粒DNA的提取
2.2.3.6 16S rRNA序列測(cè)定和菌株系統(tǒng)發(fā)育地位的確定
2.3 結(jié)果與討論
2.3.1 尼古丁降解菌的篩選、分離和純化
2.3.2 菌株HZN7的培養(yǎng)特征及生理生化特性
2.3.3 菌株HZN7的測(cè)序結(jié)果及系統(tǒng)發(fā)育地位的確定
2.4 本章小結(jié)
第三章 Shinella sp. HZN7的降解特性及代謝途徑研究
3.1 實(shí)驗(yàn)材料
3.1.1 菌株、試劑和所用儀器
3.1.2 培養(yǎng)基
3.2 實(shí)驗(yàn)方法
3.2.1 菌株Shinella sp. HZN7種子液制備
3.2.2 尼古丁含量測(cè)定
3.2.3 不同pH值下菌株對(duì)尼古丁的降解
3.2.4 不同溫度下菌株對(duì)尼古丁的降解
3.2.5 不同接菌量下菌株對(duì)尼古丁的降解
3.2.6 不同初始尼古丁濃度下菌株對(duì)尼古丁的降解
3.2.7 尼古丁及其代謝中間產(chǎn)物的檢測(cè)方法
3.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析
3.3.1 pH值對(duì)菌株Shinella sp. HZN7降解尼古丁的影響
3.3.2 溫度對(duì)菌株Shinella sp. HZN7降解尼古丁的影響
3.3.3 接種量對(duì)菌株Shinella sp. HZN7降解尼古丁的影響
3.3.4 尼古丁初始濃度對(duì)菌株Shinella sp. HZN7降解尼古丁的影響
3.3.5 代謝中間產(chǎn)物測(cè)定
3.3.6 Shinella sp. HZN7降解途徑推測(cè)
3.4 本章小節(jié)
第四章 轉(zhuǎn)座子突變文庫(kù)的構(gòu)建與篩選
4.1 實(shí)驗(yàn)材料
4.1.1 菌株、試劑和儀器
4.1.2 培養(yǎng)基
4.2 實(shí)驗(yàn)方法
4.2.1 菌株誘變前培養(yǎng)
4.2.2 轉(zhuǎn)座子誘變
4.2.3 轉(zhuǎn)座子突變株的篩選
4.2.4 失活突變株降解尼古丁的驗(yàn)證
4.2.5 突變株降解液的檢測(cè)
4.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與討論
4.3.1 菌株HZN7誘變最適條件
4.3.2 菌株HZN7插入突變效率
4.3.3 代表性轉(zhuǎn)座子突變株的初步分析
4.3.3.1 a型突變株
4.3.3.2 b型突變株
4.3.3.3 c型突變株
4.3.3.4 d型突變株
4.3.3.5 e型突變株
4.4 本章小結(jié)
第五章 降解途徑的驗(yàn)證和其中一株突變株缺失基因的克隆及功能分析
5.1 實(shí)驗(yàn)材料
5.1.1 菌株、試劑和儀器
5.1.2 培養(yǎng)基
5.2 實(shí)驗(yàn)方法
5.2.1 6HN,6HMM、6HPON和HSP的制備
5.2.2 菌株HZN7及其突變株對(duì)各種中間產(chǎn)物的降解
5.2.3 轉(zhuǎn)座子突變基因的克隆
5.2.4 克隆序列的測(cè)定、組裝和分析
5.2.5 orf2基因的敲除
5.2.5.1 基因片段的敲除及同源重組片段的構(gòu)建
5.2.5.2 構(gòu)建同源重組載體
5.2.5.3 基因敲除重組子的獲得
5.2.5.4 orf2基因功能
5.3 結(jié)果與分析
5.3.1 菌株HZN7及其突變株降解分析
5.3.2 降解途徑的確定
5.3.3 SEFA-PCR克隆突變株N7-X5突變基因的分析
5.3.4 基因的敲除與功能互補(bǔ)分析
5.4 討論
5.4.1 降解途徑
5.4.2 突變株的選擇
5.4.3 新代謝產(chǎn)物的預(yù)測(cè)
5.5 本章小結(jié)
第六章 論文總結(jié)
6.1 研究?jī)?nèi)容
6.2 創(chuàng)新點(diǎn)
6.3 不足與展望
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
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