發(fā)展S-棕櫚;さ鞍谆瘜W(xué)合成新方法及多肽改造新策略用于膜蛋白功能的調(diào)控
發(fā)布時(shí)間:2024-05-11 03:21
蛋白質(zhì)化學(xué)合成能夠在原子尺度上操控多肽/蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu),獲得其他方法難以獲取的蛋白質(zhì)樣品,例如D型蛋白質(zhì)、非天然結(jié)構(gòu)的多肽/蛋白質(zhì)以及位點(diǎn)特異性的翻譯后修飾蛋白質(zhì)等,其已經(jīng)廣泛應(yīng)用于生物化學(xué)、生物物理和生物醫(yī)學(xué)等研究領(lǐng)域。目前,使用化學(xué)合成方法已經(jīng)制備了大量重要的水溶性蛋白,例如翻譯后修飾核小體、糖基化促紅細(xì)胞生成素(EPO)和鏡像DNA聚合酶等。除了水溶性蛋白,膜蛋白也重要,它參與很多重要的生理進(jìn)程,包括信號(hào)傳導(dǎo)、分子運(yùn)輸、酶催化、免疫響應(yīng)和細(xì)胞凋亡等,是重要的藥物作用靶標(biāo)。但合成獲取的膜蛋白卻很少,這是因?yàn)槟さ鞍追浅J杷?因此它的化學(xué)合成非常困難。為了促進(jìn)膜蛋白的化學(xué)合成,科學(xué)家們發(fā)展了一系列新方法和新策略,包括外加增溶試劑、提高溫度和修飾可脫除增溶標(biāo)簽(特別是可脫除骨架修飾(Removable Backbone Modification,RBM)策略)等。值得一提的是,RBM 策略通過(guò)在主鏈骨架上安裝增溶標(biāo)簽后,可使跨膜肽/膜蛋白的性質(zhì)跟水溶性蛋白類(lèi)似,易于其分析、分離、連接和質(zhì)譜表征等,實(shí)現(xiàn)了中小型膜蛋白的高效制備。盡管目前膜蛋白化學(xué)合成已有不少研究進(jìn)展,但其仍存在許多問(wèn)題有待解決...
【文章頁(yè)數(shù)】:211 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
摘要
abstract
第1章 化學(xué)合成膜蛋白的研究進(jìn)展
1.1 引言
1.2 外部因素
1.2.1 溫度
1.2.2 pH
1.2.3 溶劑
1.2.4 鹽類(lèi)
1.2.5 去垢劑
1.2.6 離子液體
1.3 內(nèi)部修飾:主鏈酰胺鍵保護(hù)基
1.3.1 偽脯氨酸
1.3.2 異肽
1.3.3 鄰羥基芐基結(jié)構(gòu)
1.3.4 鄰巰基芐基結(jié)構(gòu)
1.3.5 甲氧基芐基結(jié)構(gòu)
1.3.6 非芐基結(jié)構(gòu)
1.4 內(nèi)部修飾:短肽增溶標(biāo)簽
1.4.1 多肽C端
1.4.2 多肽N端
1.4.3 多肽側(cè)鏈
1.5 內(nèi)部修飾:多肽骨架修飾增溶標(biāo)簽
1.5.1 Gly骨架
1.5.2 任意氨基酸骨架
1.6 結(jié)果與展望
第2章 通過(guò)可移除骨架修飾輔助的絲氨酸連接方法化學(xué)合成天然的S-棕桐;さ鞍
2.1 研究背景
2.2 結(jié)果與討論
2.2.1 直接通過(guò)Fmoc SPPS方法化學(xué)合成S-Palm SLN
2.2.2 發(fā)展RBMGABA-assisted STL方法用于化學(xué)合成S-Palm SLN
2.2.3 使用RBMGABA-assisted STL方法化學(xué)合成S-Palm M2
2.3 結(jié)論
2.4 實(shí)驗(yàn)部分
2.4.1 材料儀器及通用合成策略
2.4.2 直接通過(guò)Fmoc SPPS方法合成S-Palm SLN 1
2.4.3 通過(guò)RBMGABA輔助的STL反應(yīng)化學(xué)合成S-Palm SLN
2.4.4 基于RBMGABA輔助的STL化學(xué)合成S-Palm M2
第3章 使用新的丙二硫醇保護(hù)水楊醛的硫縮舅發(fā)展了N-to-C順序的NCL和STL結(jié)合策略
3.1 研究背景
3.2 結(jié)果與討論
3.2.1 SAL-酯或SAL縮氨基脲(SAL~(SCA_))酯不能用于N-to-C順序的NCL-STL反應(yīng)
3.2.2 發(fā)現(xiàn)可活化的新的S,S-1,3-丙二硫縮醛(SAL~(PDT))酯
3.2.3 使用新發(fā)展的SAL~(PDT)-ester介導(dǎo)N-to-C順序NCL和STL結(jié)合的連接策略
3.2.4 使用新的NCL-STL方法化學(xué)合成S-Palm M2離子通道蛋白
3.2.5 使用新的NCL-STL方法化學(xué)合成S-Palm IFITM3
3.3 結(jié)論
3.4 實(shí)驗(yàn)部分
3.4.1 材料儀器及通用合成策略
3.4.2 使用N-to-C順序的NCL-STL方法連接模型肽
3.4.3 發(fā)現(xiàn)新的可活化肽SAL~(PDT)-ester
3.4.4 SALPDT-ester介導(dǎo)的N-to-C順序的NCL和STL結(jié)合的連接方法
3.4.5 通過(guò)NCL-STL方法化學(xué)合成S-Palm M2
3.4.6 通過(guò)NCL-STL法合成S-palm IFITM3
第4章 不可還原的硫醚鍵替代二硫鍵顯示鐵調(diào)素與其受體膜鐵轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白間的相互作用無(wú)需二硫鍵交換
4.1 研究背景
4.2 結(jié)果與討論
4.3 結(jié)論
4.4 實(shí)驗(yàn)部分
4.4.1 材料儀器及合成方法
4.4.2 S-C鍵和C-S鍵的二氨基二酸的合成
4.4.3 合成Hepcidin
4.4.4 合成Hepcidin二硫鍵類(lèi)似物
4.4.5 合成minihepcidins
4.4.6 Ferroportin內(nèi)在化實(shí)驗(yàn)
參考文獻(xiàn)
致謝
在讀期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文與取得的其他研究成果
本文編號(hào):3969448
【文章頁(yè)數(shù)】:211 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
摘要
abstract
第1章 化學(xué)合成膜蛋白的研究進(jìn)展
1.1 引言
1.2 外部因素
1.2.1 溫度
1.2.2 pH
1.2.3 溶劑
1.2.4 鹽類(lèi)
1.2.5 去垢劑
1.2.6 離子液體
1.3 內(nèi)部修飾:主鏈酰胺鍵保護(hù)基
1.3.1 偽脯氨酸
1.3.2 異肽
1.3.3 鄰羥基芐基結(jié)構(gòu)
1.3.4 鄰巰基芐基結(jié)構(gòu)
1.3.5 甲氧基芐基結(jié)構(gòu)
1.3.6 非芐基結(jié)構(gòu)
1.4 內(nèi)部修飾:短肽增溶標(biāo)簽
1.4.1 多肽C端
1.4.2 多肽N端
1.4.3 多肽側(cè)鏈
1.5 內(nèi)部修飾:多肽骨架修飾增溶標(biāo)簽
1.5.1 Gly骨架
1.5.2 任意氨基酸骨架
1.6 結(jié)果與展望
第2章 通過(guò)可移除骨架修飾輔助的絲氨酸連接方法化學(xué)合成天然的S-棕桐;さ鞍
2.1 研究背景
2.2 結(jié)果與討論
2.2.1 直接通過(guò)Fmoc SPPS方法化學(xué)合成S-Palm SLN
2.2.2 發(fā)展RBMGABA-assisted STL方法用于化學(xué)合成S-Palm SLN
2.2.3 使用RBMGABA-assisted STL方法化學(xué)合成S-Palm M2
2.3 結(jié)論
2.4 實(shí)驗(yàn)部分
2.4.1 材料儀器及通用合成策略
2.4.2 直接通過(guò)Fmoc SPPS方法合成S-Palm SLN 1
2.4.3 通過(guò)RBMGABA輔助的STL反應(yīng)化學(xué)合成S-Palm SLN
2.4.4 基于RBMGABA輔助的STL化學(xué)合成S-Palm M2
第3章 使用新的丙二硫醇保護(hù)水楊醛的硫縮舅發(fā)展了N-to-C順序的NCL和STL結(jié)合策略
3.1 研究背景
3.2 結(jié)果與討論
3.2.1 SAL-酯或SAL縮氨基脲(SAL~(SCA_))酯不能用于N-to-C順序的NCL-STL反應(yīng)
3.2.2 發(fā)現(xiàn)可活化的新的S,S-1,3-丙二硫縮醛(SAL~(PDT))酯
3.2.3 使用新發(fā)展的SAL~(PDT)-ester介導(dǎo)N-to-C順序NCL和STL結(jié)合的連接策略
3.2.4 使用新的NCL-STL方法化學(xué)合成S-Palm M2離子通道蛋白
3.2.5 使用新的NCL-STL方法化學(xué)合成S-Palm IFITM3
3.3 結(jié)論
3.4 實(shí)驗(yàn)部分
3.4.1 材料儀器及通用合成策略
3.4.2 使用N-to-C順序的NCL-STL方法連接模型肽
3.4.3 發(fā)現(xiàn)新的可活化肽SAL~(PDT)-ester
3.4.4 SALPDT-ester介導(dǎo)的N-to-C順序的NCL和STL結(jié)合的連接方法
3.4.5 通過(guò)NCL-STL方法化學(xué)合成S-Palm M2
3.4.6 通過(guò)NCL-STL法合成S-palm IFITM3
第4章 不可還原的硫醚鍵替代二硫鍵顯示鐵調(diào)素與其受體膜鐵轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白間的相互作用無(wú)需二硫鍵交換
4.1 研究背景
4.2 結(jié)果與討論
4.3 結(jié)論
4.4 實(shí)驗(yàn)部分
4.4.1 材料儀器及合成方法
4.4.2 S-C鍵和C-S鍵的二氨基二酸的合成
4.4.3 合成Hepcidin
4.4.4 合成Hepcidin二硫鍵類(lèi)似物
4.4.5 合成minihepcidins
4.4.6 Ferroportin內(nèi)在化實(shí)驗(yàn)
參考文獻(xiàn)
致謝
在讀期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文與取得的其他研究成果
本文編號(hào):3969448
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