發(fā)布時間：2018-01-22 03:10

  本文關(guān)鍵詞： ESI-HRMS 分子間G-四鏈體DNA 陽離子 黃連素Berberine　出處：《鄭州大學(xué)》2017年碩士論文　論文類型：學(xué)位論文

【摘要】：富含鳥嘌呤堿基(G)的DNA序列廣泛存在于人體基因的多個重要領(lǐng)域且在生理條件下能自組裝形成G-四鏈體結(jié)構(gòu),它是一種特殊的DNA二級結(jié)構(gòu),陽離子可通過嵌入其中心空腔通道減少鳥嘌呤上氧原子之間的靜電斥力來穩(wěn)定G-四鏈體結(jié)構(gòu)。G-四鏈體根據(jù)組成DNA鏈數(shù)的不同可分為分子內(nèi)和分子間G-四鏈體。由于G-四鏈體參與人體重要生命活動且與細胞增殖、癌變具有密切關(guān)系,特別是端粒G-四鏈體的形成使端粒不被端粒酶延伸,起到保護端粒、抑制癌細胞增殖的作用,從而引起人們對其巨大的研究興趣,成為當(dāng)今化學(xué)與生物學(xué)研究的熱點。本文通過電噴霧質(zhì)譜技術(shù)(ESI-HRMS)研究了有關(guān)分子間G-四鏈體及其復(fù)合物形成的一系列問題。1.基于ESI-HRMS的“軟電離”優(yōu)勢研究了富G序列+NH_4~+、富G序列+NH_4~++Berberine體系的相互作用,研究了反應(yīng)時間、干燥氣溫度、毛細管出口電壓(Fragmentor電壓)、流動相H_2O:CH_3OH比例、分析物濃度等因素對目標(biāo)分子間G-四鏈體及其復(fù)合物形成和檢測的影響,并獲得了各因素的最佳條件,為后續(xù)研究打下了良好的基礎(chǔ)。2.在上述研究的基礎(chǔ)上,通過ESI-HRMS研究了2種可形成雙分子G-四鏈體的富G序列(命名為G3G4、G4G4)和3種可形成四分子G-四鏈體的富G序列(命名為G41、G42、G43)與不同陽離子NH_4~+、K~+相互作用,得出分子間G-四鏈體結(jié)構(gòu)信息及結(jié)合陽離子的數(shù)量等信息,從而直觀地計算出與分子間G-四鏈體相關(guān)的化學(xué)計量變化;進一步研究了陽離子濃度變化對陽離子和分子間G-四鏈體結(jié)合率的影響,研究結(jié)果表明在一定濃度范圍內(nèi)該結(jié)合率與陽離子濃度有較好的線性關(guān)系。3.在此基礎(chǔ)上進一步研究了小分子Berberine與NH_4~+、K~+存在下形成的分子間G-四鏈體相互作用,測得了超分子復(fù)合物的化學(xué)計量比,進一步研究表明在一定濃度范圍內(nèi)分子間G-四鏈體與Berberine的結(jié)合率與Berberine的濃度呈現(xiàn)較好的線性關(guān)系,取得了較好的實驗結(jié)果。
[Abstract]:The DNA sequence rich in guanine base (G) exists widely in many important fields of human genes and can self-assemble to form G-quadruplex structure under physiological conditions. It is a special secondary structure of DNA. Cations can stabilize the structure of G- quaternary structure by embedding the channel in the central cavity to reduce the electrostatic repulsive force between oxygen atoms on guanine. According to the different number of DNA chains, it can be divided into intramolecular and intermolecular G. -Four-chain. G- quadruplex is involved in vital human life and cell proliferation. Carcinogenesis has a close relationship, especially the formation of telomere G-quadruplex makes telomere do not extend by telomerase, plays the role of protecting telomere, inhibiting the proliferation of cancer cells, thus causing great interest in its research. It has become a hot topic in chemistry and biology. In this paper, ESI-HRMSs were developed by electrospray mass spectrometry (ESI-HRMS). A series of problems related to the formation of intermolecular G- quadruplex and its complexes have been studied. 1. Based on the "soft ionization" advantage of ESI-HRMS, the G-rich NH _ 4s have been studied. The interaction of G sequence NH4- Berberine system was studied. The reaction time, drying gas temperature, capillary outlet voltage and Fragmentor voltage were studied. The influence of the ratio of H _ 2O: Ch _ 3OH in mobile phase and the concentration of analyte on the formation and detection of G- quadruplex and its complex between target molecules were obtained. The optimum conditions of each factor were obtained. On the basis of the above research, we studied two kinds of G-rich sequences (named G3G4) which can form bimolecular G-quadruplex by ESI-HRMS. G4G4) and three kinds of G-rich sequences (named G41G42G42G43) which can form four-molecule G-quad chains interact with different cations NH _ 4 ~ + K ~ +. The structure information and the number of binding cations were obtained, and the stoichiometric changes related to the intermolecular G- quaternary were calculated intuitively. The effect of the concentration of cations on the binding rate of cations and intermolecular G- quaternary was further studied. The results show that there is a good linear relationship between the binding rate and cationic concentration in a certain concentration range. 3. On the basis of this, the small molecule Berberine and NH _ 4 ~ are further studied. The stoichiometric ratio of supramolecular complexes was measured by the interaction of G- quadruplex in the presence of K ~. Further studies show that there is a good linear relationship between the binding rate of G- quadruplex and Berberine and the concentration of Berberine in a certain concentration range. Good experimental results have been obtained.
【學(xué)位授予單位】：鄭州大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2017
【分類號】：R3416

【相似文獻】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 尚世強,俞錫林,洪文瀾,俞惠民,孫眉月;DETECTION OF BACTERIAL DNA BY PCR AND REVERSE HYBRIDIZATION IN THE 16s rRNA GENE[J];Journal of Zhejiang University Science;2000年02期

2 MA Wen li;DNA Diagnosis and Gene Therapy:Advances and Prospects in the 21st Century[J];深圳大學(xué)學(xué)報;2000年04期

3 葛學(xué)銘,陸應(yīng)麟,付生法,范文紅,劉爽;A NOVEL HUMAN DNA SEQUENCE WITH TUMOR METASTASIS SUPPRESSIVE ACTIVITY[J];Chinese Journal of Cancer Research;2000年02期

4 曹暉,劉玉萍,小松かつ子,畢培曦,邵鵬柱;DNA Molecular Profiling:A New Approach to Quality Control of Chinese Drugs[J];Chinese Journal of Integrated Traditional and Western Medicine;2000年01期

5 ;DNA REPAIR CAPACITY IN LUNG CANCER PATIENTS[J];癌變.畸變.突變;2001年04期

6 黃力拉,朱剛勁;被拐賣及失蹤兒童采血驗DNA前的心理問題及對策[J];齊齊哈爾醫(yī)學(xué)院學(xué)報;2001年03期

7 安小惠 ,王一理 ,來寶長 ,耿一萍 ,司履生;CONSTRUCTION OF HUMAN INTERLUEKIN-18 DNA VACCINE AND IT'S EXPRESSION IN MAMMALIAN CELLS[J];Journal of Xi'an Medical University;2001年02期

8 ;A Study of PCR with DNA Extracted from Single Cell Isolated from Histological Sections[J];遵義醫(yī)學(xué)院學(xué)報;2001年01期

9 王軍陽,范桂香,勝利,袁育康;THE CONSTRUCTION AND PRELIMINARY APPRAISEMENT OF HSV-2 gD GENE DNA VACCINE[J];Academic Journal of Xi'an Jiaotong University;2002年02期

10 董菁 ,成軍 ,王勤環(huán) ,施雙雙 ,王剛 ,斯崇文;CLONING AND ANALYSIS OF THE GENOMIC DNA SEQUENCE OF AUGMENTER OF LIVERR EGENERATION FROM RAT[J];Chinese Medical Sciences Journal;2002年02期

相關(guān)會議論文 前10條

1 Michael J.Siefkes;Cory O.Brant;Ronald B.Walter;;A novel real-time XL-PCR for DNA damage detection[A];漁業(yè)科技創(chuàng)新與發(fā)展方式轉(zhuǎn)變——2011年中國水產(chǎn)學(xué)會學(xué)術(shù)年會論文摘要集[C];2011年

2 ;Hormonal Regulation and Tumorigenic Role of DNA Methyltransferase[A];2011中國婦產(chǎn)科學(xué)術(shù)會議暨浙江省計劃生育與生殖醫(yī)學(xué)學(xué)術(shù)年會暨生殖健康講習(xí)班論文匯編[C];2011年

3 Dongmei Zhao;Fan Jin;Yuli Qian;Hefeng Huang;;Expression patterns of Dnmtl and Dnmt3b in preimplantational mouse embryos and effects of in-vitro cultures on their expression[A];中華醫(yī)學(xué)會第十次全國婦產(chǎn)科學(xué)術(shù)會議婦科內(nèi)分泌會場（婦科內(nèi)分泌學(xué)組、絕經(jīng)學(xué)組、計劃生育學(xué)組）論文匯編[C];2012年

4 姜東成;蔣稼歡;楊力;蔡紹皙;K.-L.Paul Sung;;在聚吡咯微點致動下的DNA雜交行為[A];2008年全國生物流變學(xué)與生物力學(xué)學(xué)術(shù)會議論文摘要集[C];2008年

5 白明慧;翁小成;周翔;;聯(lián)鄰苯二酚類小分子作為DNA交聯(lián)劑的研究[A];第六屆全國化學(xué)生物學(xué)學(xué)術(shù)會議論文摘要集[C];2009年

6 張曄;杜智;楊斌;高英堂;;檢測外周血中游離DNA的應(yīng)用前景(綜述)[A];天津市生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)會第29屆學(xué)術(shù)年會暨首屆生物醫(yī)學(xué)工程前沿科學(xué)研討會論文集[C];2009年

7 周紅;鄭江;王良喜;丁國富;魯永玲;潘文東;羅平;肖光夏;;CpG DNA誘導(dǎo)全身炎癥反應(yīng)綜合征的作用及其機制研究[A];全國燒傷創(chuàng)面處理、感染專題研討會論文匯編[C];2004年

8 ;EFFECTS OF Ku70-DEFICIENT ON ARSENITE-INDUCED DNA DOUBLE STRAND BREAKS, CHROMOSOMAL ALTERATIONS AND CELL CYCLE ARREST[A];海峽兩岸第三屆毒理學(xué)研討會論文摘要[C];2005年

9 李經(jīng)建;冀中華;蔡生民;;小溝結(jié)合方式中的DNA媒介電荷轉(zhuǎn)移[A];第十三次全國電化學(xué)會議論文摘要集（下集）[C];2005年

10 ;The interaction between Levofloxacine Hydrochloride and DNA mediated by Cu~(2+)[A];湖北省化學(xué)化工學(xué)會2006年年會暨循環(huán)經(jīng)濟專家論壇論文集[C];2006年

相關(guān)重要報紙文章 前10條

1 本報記者 袁滿;平安：把“領(lǐng)先”作為DNA[N];經(jīng)濟觀察報;2006年

2 舒放;編織一個DNA納米桶[N];醫(yī)藥經(jīng)濟報;2006年

3 閆潔;英兩無罪公民起訴要求銷毀DNA記錄[N];新華每日電訊;2008年

4 何德功;日本制成診斷魚病的“DNA書”[N];農(nóng)民日報;2004年

5 本報記者 張巍巍;DNA樣本也能作假[N];科技日報;2009年

6 周斌偉　鄒巍;蘇州警方應(yīng)用DNA技術(shù)一年偵破案件1887起[N];人民公安報;2011年

7 本報記者 楊天笑;揭秘“神探”DNA[N];蘇州日報;2011年

8 第四軍醫(yī)大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)部生物化學(xué)與分子生物學(xué)教研室教授 李福洋;破除法老DNA的咒語[N];東方早報;2011年

9 常麗君;DNA電路可檢測導(dǎo)致疾病的基因損傷[N];科技日報;2012年

10 常麗君;效率和質(zhì)量：“DNA制造業(yè)”兩大障礙被攻克[N];科技日報;2012年

相關(guān)博士學(xué)位論文 前10條

1 唐陽;基于質(zhì)譜技術(shù)的基因組DNA甲基化及其氧化衍生物分析[D];武漢大學(xué);2014年

2 池晴佳;DNA動力學(xué)與彈性性質(zhì)研究[D];重慶大學(xué);2015年

3 胡璐璐;哺乳動物DNA去甲基化過程關(guān)鍵酶TET2的三維結(jié)構(gòu)與P暬�机制研究[D];復(fù)旦大學(xué);2014年

4 馬寅洲;基于滾環(huán)擴增的DNA自組裝技術(shù)的研究[D];南京大學(xué);2014年

5 黃學(xué)鋒;精子DNA碎片的臨床意義：臨床和實驗研究[D];復(fù)旦大學(xué);2013年

6 隋江東;APE1促進DNA-PKcs介導(dǎo)hnRNPA1磷酸化及其在有絲分裂期端粒保護中的作用[D];第三軍醫(yī)大學(xué);2015年

7 劉松柏;結(jié)構(gòu)特異性核酸酶FEN1在DNA復(fù)制及細胞周期過程中的功能性研究[D];浙江大學(xué);2015年

8 王璐;哺乳動物中親本DNA甲基化的重編程與繼承[D];中國科學(xué)院北京基因組研究所;2015年

9 齊文靖;染色質(zhì)改構(gòu)蛋白BRG1在DNA雙鏈斷裂修復(fù)中的作用及機制研究[D];東北師范大學(xué);2015年

10 龍湍;水稻T-DNA插入突變?nèi)后w側(cè)翼序列的分離分析和OsaTRZ2的克隆與功能鑒定[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2014年

相關(guān)碩士學(xué)位論文 前10條

1 王嬌嬌;基于ESI-HRMS的分子間G-四鏈體DNA相關(guān)超分子化學(xué)研究[D];鄭州大學(xué);2017年

2 董洪奎;面向可視化納米操作的DNA運動學(xué)建模及誤差實時校正方法[D];沈陽理工大學(xué);2014年

3 林琳;基于光學(xué)方法對含腺嘌呤和GC端粒的低聚核苷酸形成G-DNA四鏈體的研究[D];內(nèi)蒙古大學(xué);2015年

4 聞金燕;水溶性羧基和吡啶基咔咯大環(huán)與DNA和人血清蛋白的相互作用[D];華南理工大學(xué);2015年

5 江懌雨;水溶性羧酸卟啉及其配合物與DNA和人血清蛋白的相互作用[D];華南理工大學(xué);2015年

6 高志森;比較外周游離循環(huán)腫瘤DNA與癌胚抗原監(jiān)測非小細胞肺癌根治術(shù)前后腫瘤負荷變化的初步研究[D];福建醫(yī)科大學(xué);2015年

7 丁浩;血漿循環(huán)DNA完整性及多基因甲基化對肺癌診斷價值的研究[D];河北大學(xué);2015年

8 王鵬;基于碳點@氧化石墨烯復(fù)合材料DNA生物傳感器的構(gòu)建及用于PML/RARα基因檢測[D];福建醫(yī)科大學(xué);2015年

9 李海青;轉(zhuǎn)堿篷和鹽角草總DNA的耐鹽紫花苜蓿的選育[D];內(nèi)蒙古大學(xué);2015年

10 李婷婷;小鼠DNA模式識別重要受體的分子結(jié)構(gòu)特征及其功能研究[D];中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院;2015年

，

本文編號：1453458