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1例高甲硫氨酸血癥兒童的臨床表型和基因型分析并文獻復習

發(fā)布時間:2020-12-04 15:53
  目的對1例在新生兒篩查發(fā)現(xiàn)血漿甲硫氨酸升高而無明顯臨床癥狀的患兒的臨床資料進行回顧性分析,歸納總結(jié)該類疾病的臨床特點和診療思路,探討臨床上遇到新生兒篩查異常和致病性未明的新基因突變時,如何對篩查報告和基因報告做出正確合理的解讀,從而作出正確的干預和遺傳指導。方法1.研究對象:青島大學附屬醫(yī)院接診的1例高甲硫氨酸血癥兒童家庭。2.研究方法:(1)回顧性總結(jié)分析先證者的臨床資料、實驗室檢查及血、尿代謝篩查結(jié)果;(2)歸納總結(jié)先證者疾病特點,以其典型氨基酸代謝異常指標為關(guān)鍵詞進行文獻搜索,將查獲的疾病與該患兒的臨床表現(xiàn)進行比對;(3)經(jīng)醫(yī)院醫(yī)學倫理委員會同意,與家屬溝通并簽署知情同意書,收集先證者及其家庭成員的外周血,通過測序技術(shù)對相關(guān)基因外顯子編碼區(qū)進行直接測序,查找疑似致病基因,并對其他成員進行致病性基因的驗證;結(jié)果一名2月齡女嬰,新生兒血串聯(lián)質(zhì)譜代謝病篩查時發(fā)現(xiàn)血甲硫氨酸水平升高,無相關(guān)臨床癥狀,直至就診前生長發(fā)育均良好。查體精神反應好,無特殊疾病面容,肝脾無腫大,血檢僅有肝功能輕度異常,血串聯(lián)質(zhì)譜分析仍提示甲硫氨酸輕度升高。由于患兒缺乏臨床特異性,我們選擇最合適的基因測序+MLPA技... 

【文章來源】:青島大學山東省

【文章頁數(shù)】:40 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

1例高甲硫氨酸血癥兒童的臨床表型和基因型分析并文獻復習


先證者及其父母測序結(jié)果與正常對比

先證者,甲硫氨酸


親Ⅰ1攜帶相同錯義突變,箭頭所指出為突變位點。Ⅰ2、Ⅲ圖分別為先證者母親及正常氨基酸序列。圖2 先證者甲硫氨酸濃度變化圖3 家系圖注:圖 3 家系圖中Ⅱ是先證者,I1、I2 分別是先證者父親、母親。2.4 生物信息學分析致病性“中心法則”提出DNA的改變會導致RNA的變化,并可導致其編碼的氨基酸發(fā)生變化。而氨基酸的改變可能會引起蛋白質(zhì)高級結(jié)構(gòu)改變,并最終影響蛋白質(zhì)功能。利用SIFT(Sorting Intolerant From Tolerant)和Polyphen-2(Phenotyping Version2)基于蛋白序列同源性算法的預測原理,來共同評價SNP(人類可遺傳的變異中最常見的一種)對蛋白結(jié)構(gòu)、功能的影響。2.4.1 Polyphen-2軟件采用了Na ve Bayes的機器學習算法來評估SNP導致的氨基酸改變對蛋白質(zhì)折疊、互作、構(gòu)象穩(wěn)定性的影響。

家系圖,家系圖


圖2 先證者甲硫氨酸濃度變化圖3 家系圖注:圖 3 家系圖中Ⅱ是先證者,I1、I2 分別是先證者父親、母親。2.4 生物信息學分析致病性“中心法則”提出DNA的改變會導致RNA的變化,并可導致其編碼的氨基酸發(fā)生變化。而氨基酸的改變可能會引起蛋白質(zhì)高級結(jié)構(gòu)改變,并最終影響蛋白質(zhì)功能。利用SIFT(Sorting Intolerant From Tolerant)和Polyphen-2(Phenotyping Version2)基于蛋白序列同源性算法的預測原理,來共同評價SNP(人類可遺傳的變異中最常見的一種)對蛋白結(jié)構(gòu)、功能的影響。2.4.1 Polyphen-2軟件采用了Na ve Bayes的機器學習算法來評估SNP導致的氨基酸改變對蛋白質(zhì)折疊、互作、構(gòu)象穩(wěn)定性的影響。

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