1例高甲硫氨酸血癥兒童的臨床表型和基因型分析并文獻復習
發(fā)布時間:2020-12-04 15:53
目的對1例在新生兒篩查發(fā)現(xiàn)血漿甲硫氨酸升高而無明顯臨床癥狀的患兒的臨床資料進行回顧性分析,歸納總結(jié)該類疾病的臨床特點和診療思路,探討臨床上遇到新生兒篩查異常和致病性未明的新基因突變時,如何對篩查報告和基因報告做出正確合理的解讀,從而作出正確的干預和遺傳指導。方法1.研究對象:青島大學附屬醫(yī)院接診的1例高甲硫氨酸血癥兒童家庭。2.研究方法:(1)回顧性總結(jié)分析先證者的臨床資料、實驗室檢查及血、尿代謝篩查結(jié)果;(2)歸納總結(jié)先證者疾病特點,以其典型氨基酸代謝異常指標為關(guān)鍵詞進行文獻搜索,將查獲的疾病與該患兒的臨床表現(xiàn)進行比對;(3)經(jīng)醫(yī)院醫(yī)學倫理委員會同意,與家屬溝通并簽署知情同意書,收集先證者及其家庭成員的外周血,通過測序技術(shù)對相關(guān)基因外顯子編碼區(qū)進行直接測序,查找疑似致病基因,并對其他成員進行致病性基因的驗證;結(jié)果一名2月齡女嬰,新生兒血串聯(lián)質(zhì)譜代謝病篩查時發(fā)現(xiàn)血甲硫氨酸水平升高,無相關(guān)臨床癥狀,直至就診前生長發(fā)育均良好。查體精神反應好,無特殊疾病面容,肝脾無腫大,血檢僅有肝功能輕度異常,血串聯(lián)質(zhì)譜分析仍提示甲硫氨酸輕度升高。由于患兒缺乏臨床特異性,我們選擇最合適的基因測序+MLPA技...
【文章來源】:青島大學山東省
【文章頁數(shù)】:40 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
先證者及其父母測序結(jié)果與正常對比
親Ⅰ1攜帶相同錯義突變,箭頭所指出為突變位點。Ⅰ2、Ⅲ圖分別為先證者母親及正常氨基酸序列。圖2 先證者甲硫氨酸濃度變化圖3 家系圖注:圖 3 家系圖中Ⅱ是先證者,I1、I2 分別是先證者父親、母親。2.4 生物信息學分析致病性“中心法則”提出DNA的改變會導致RNA的變化,并可導致其編碼的氨基酸發(fā)生變化。而氨基酸的改變可能會引起蛋白質(zhì)高級結(jié)構(gòu)改變,并最終影響蛋白質(zhì)功能。利用SIFT(Sorting Intolerant From Tolerant)和Polyphen-2(Phenotyping Version2)基于蛋白序列同源性算法的預測原理,來共同評價SNP(人類可遺傳的變異中最常見的一種)對蛋白結(jié)構(gòu)、功能的影響。2.4.1 Polyphen-2軟件采用了Na ve Bayes的機器學習算法來評估SNP導致的氨基酸改變對蛋白質(zhì)折疊、互作、構(gòu)象穩(wěn)定性的影響。
圖2 先證者甲硫氨酸濃度變化圖3 家系圖注:圖 3 家系圖中Ⅱ是先證者,I1、I2 分別是先證者父親、母親。2.4 生物信息學分析致病性“中心法則”提出DNA的改變會導致RNA的變化,并可導致其編碼的氨基酸發(fā)生變化。而氨基酸的改變可能會引起蛋白質(zhì)高級結(jié)構(gòu)改變,并最終影響蛋白質(zhì)功能。利用SIFT(Sorting Intolerant From Tolerant)和Polyphen-2(Phenotyping Version2)基于蛋白序列同源性算法的預測原理,來共同評價SNP(人類可遺傳的變異中最常見的一種)對蛋白結(jié)構(gòu)、功能的影響。2.4.1 Polyphen-2軟件采用了Na ve Bayes的機器學習算法來評估SNP導致的氨基酸改變對蛋白質(zhì)折疊、互作、構(gòu)象穩(wěn)定性的影響。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]20027例新生兒遺傳代謝病串聯(lián)質(zhì)譜篩查的初步報告[J]. 楊宇奇,蔣曙紅,韓小亞,江麗華,虞斌,朱偉. 重慶醫(yī)學. 2018(02)
[2]1例高甲硫氨酸血癥基因突變分析[J]. 楊宇奇,王淮燕,江麗華,張瑜平,虞斌,朱偉,秦志強. 中國當代兒科雜志. 2017(09)
[3]遺傳變異分類標準與指南[J]. 王秋菊,沈亦平,鄔玲仟,陳少科,陳子江,方向東,傅松濱,龔瑤琴,黃國英,黃國寧,黃荷鳳,黃山,郝曉柯,冀小平,李紅,梁波,廖燦,喬杰,蘇海翔,魏軍,王磊,王樹玉,王曉紅,邢清和,徐湘民,袁慧軍,楊正林,周從容,周文浩,曾勇,張學軍,黃濤生,鄭茜,秦勝營,于世輝,關(guān)靜,王洪陽,王大勇,趙立東,王慧君,孔令印,宣黎明,冒燕,祝軼君,徐君玲,王劍青,王莉,趙婷,秦一丁,夏瀅穎,樊麗霞,趙丁丁,邱浩,賀林. 中國科學:生命科學. 2017(06)
[4]一例單純性高甲硫氨酸血癥患兒的MAT1A基因突變分析[J]. 孫云,馬定遠,王彥云,楊冰,蔣濤. 中華醫(yī)學遺傳學雜志. 2017 (01)
[5]五種生物信息學軟件對于錯義突變預測性能的評估[J]. 陳倩婷,戴聰伶,張前軍,杜娟,李汶. 中華醫(yī)學遺傳學雜志. 2016 (05)
[6]11204例新生兒串聯(lián)質(zhì)譜篩查結(jié)果分析[J]. 鄭文吉,王飛,余頎,陳志央,莊丹燕. 中國優(yōu)生與遺傳雜志. 2016(02)
[7]高通量測序數(shù)據(jù)分析和臨床診斷流程的解讀[J]. 黎籽秀,劉博,徐凌麗,楊琳,王慧君,周文浩. 中國循證兒科雜志. 2015(01)
[8]全外顯子組測序:兒童疾病診斷新思路[J]. 馬丁艾遙,馬丁艾路,王慧君,周文浩. 中國循證兒科雜志. 2015(01)
[9]希特林蛋白缺乏癥的研究進展[J]. 堵向楠,丁巖,王向波. 疑難病雜志. 2014(09)
[10]Citrin缺陷導致的新生兒肝內(nèi)膽汁淤積癥內(nèi)分泌代謝特征分析[J]. 張文,劉麗,盛慧英,彭敏芝,趙小媛,吳冬燕. 中國實用兒科雜志. 2013(01)
本文編號:2897869
【文章來源】:青島大學山東省
【文章頁數(shù)】:40 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
先證者及其父母測序結(jié)果與正常對比
親Ⅰ1攜帶相同錯義突變,箭頭所指出為突變位點。Ⅰ2、Ⅲ圖分別為先證者母親及正常氨基酸序列。圖2 先證者甲硫氨酸濃度變化圖3 家系圖注:圖 3 家系圖中Ⅱ是先證者,I1、I2 分別是先證者父親、母親。2.4 生物信息學分析致病性“中心法則”提出DNA的改變會導致RNA的變化,并可導致其編碼的氨基酸發(fā)生變化。而氨基酸的改變可能會引起蛋白質(zhì)高級結(jié)構(gòu)改變,并最終影響蛋白質(zhì)功能。利用SIFT(Sorting Intolerant From Tolerant)和Polyphen-2(Phenotyping Version2)基于蛋白序列同源性算法的預測原理,來共同評價SNP(人類可遺傳的變異中最常見的一種)對蛋白結(jié)構(gòu)、功能的影響。2.4.1 Polyphen-2軟件采用了Na ve Bayes的機器學習算法來評估SNP導致的氨基酸改變對蛋白質(zhì)折疊、互作、構(gòu)象穩(wěn)定性的影響。
圖2 先證者甲硫氨酸濃度變化圖3 家系圖注:圖 3 家系圖中Ⅱ是先證者,I1、I2 分別是先證者父親、母親。2.4 生物信息學分析致病性“中心法則”提出DNA的改變會導致RNA的變化,并可導致其編碼的氨基酸發(fā)生變化。而氨基酸的改變可能會引起蛋白質(zhì)高級結(jié)構(gòu)改變,并最終影響蛋白質(zhì)功能。利用SIFT(Sorting Intolerant From Tolerant)和Polyphen-2(Phenotyping Version2)基于蛋白序列同源性算法的預測原理,來共同評價SNP(人類可遺傳的變異中最常見的一種)對蛋白結(jié)構(gòu)、功能的影響。2.4.1 Polyphen-2軟件采用了Na ve Bayes的機器學習算法來評估SNP導致的氨基酸改變對蛋白質(zhì)折疊、互作、構(gòu)象穩(wěn)定性的影響。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]20027例新生兒遺傳代謝病串聯(lián)質(zhì)譜篩查的初步報告[J]. 楊宇奇,蔣曙紅,韓小亞,江麗華,虞斌,朱偉. 重慶醫(yī)學. 2018(02)
[2]1例高甲硫氨酸血癥基因突變分析[J]. 楊宇奇,王淮燕,江麗華,張瑜平,虞斌,朱偉,秦志強. 中國當代兒科雜志. 2017(09)
[3]遺傳變異分類標準與指南[J]. 王秋菊,沈亦平,鄔玲仟,陳少科,陳子江,方向東,傅松濱,龔瑤琴,黃國英,黃國寧,黃荷鳳,黃山,郝曉柯,冀小平,李紅,梁波,廖燦,喬杰,蘇海翔,魏軍,王磊,王樹玉,王曉紅,邢清和,徐湘民,袁慧軍,楊正林,周從容,周文浩,曾勇,張學軍,黃濤生,鄭茜,秦勝營,于世輝,關(guān)靜,王洪陽,王大勇,趙立東,王慧君,孔令印,宣黎明,冒燕,祝軼君,徐君玲,王劍青,王莉,趙婷,秦一丁,夏瀅穎,樊麗霞,趙丁丁,邱浩,賀林. 中國科學:生命科學. 2017(06)
[4]一例單純性高甲硫氨酸血癥患兒的MAT1A基因突變分析[J]. 孫云,馬定遠,王彥云,楊冰,蔣濤. 中華醫(yī)學遺傳學雜志. 2017 (01)
[5]五種生物信息學軟件對于錯義突變預測性能的評估[J]. 陳倩婷,戴聰伶,張前軍,杜娟,李汶. 中華醫(yī)學遺傳學雜志. 2016 (05)
[6]11204例新生兒串聯(lián)質(zhì)譜篩查結(jié)果分析[J]. 鄭文吉,王飛,余頎,陳志央,莊丹燕. 中國優(yōu)生與遺傳雜志. 2016(02)
[7]高通量測序數(shù)據(jù)分析和臨床診斷流程的解讀[J]. 黎籽秀,劉博,徐凌麗,楊琳,王慧君,周文浩. 中國循證兒科雜志. 2015(01)
[8]全外顯子組測序:兒童疾病診斷新思路[J]. 馬丁艾遙,馬丁艾路,王慧君,周文浩. 中國循證兒科雜志. 2015(01)
[9]希特林蛋白缺乏癥的研究進展[J]. 堵向楠,丁巖,王向波. 疑難病雜志. 2014(09)
[10]Citrin缺陷導致的新生兒肝內(nèi)膽汁淤積癥內(nèi)分泌代謝特征分析[J]. 張文,劉麗,盛慧英,彭敏芝,趙小媛,吳冬燕. 中國實用兒科雜志. 2013(01)
本文編號:2897869
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