1例高甲硫氨酸血癥兒童的臨床表型和基因型分析并文獻(xiàn)復(fù)習(xí)
發(fā)布時(shí)間:2020-12-04 15:53
目的對(duì)1例在新生兒篩查發(fā)現(xiàn)血漿甲硫氨酸升高而無(wú)明顯臨床癥狀的患兒的臨床資料進(jìn)行回顧性分析,歸納總結(jié)該類疾病的臨床特點(diǎn)和診療思路,探討臨床上遇到新生兒篩查異常和致病性未明的新基因突變時(shí),如何對(duì)篩查報(bào)告和基因報(bào)告做出正確合理的解讀,從而作出正確的干預(yù)和遺傳指導(dǎo)。方法1.研究對(duì)象:青島大學(xué)附屬醫(yī)院接診的1例高甲硫氨酸血癥兒童家庭。2.研究方法:(1)回顧性總結(jié)分析先證者的臨床資料、實(shí)驗(yàn)室檢查及血、尿代謝篩查結(jié)果;(2)歸納總結(jié)先證者疾病特點(diǎn),以其典型氨基酸代謝異常指標(biāo)為關(guān)鍵詞進(jìn)行文獻(xiàn)搜索,將查獲的疾病與該患兒的臨床表現(xiàn)進(jìn)行比對(duì);(3)經(jīng)醫(yī)院醫(yī)學(xué)倫理委員會(huì)同意,與家屬溝通并簽署知情同意書,收集先證者及其家庭成員的外周血,通過(guò)測(cè)序技術(shù)對(duì)相關(guān)基因外顯子編碼區(qū)進(jìn)行直接測(cè)序,查找疑似致病基因,并對(duì)其他成員進(jìn)行致病性基因的驗(yàn)證;結(jié)果一名2月齡女嬰,新生兒血串聯(lián)質(zhì)譜代謝病篩查時(shí)發(fā)現(xiàn)血甲硫氨酸水平升高,無(wú)相關(guān)臨床癥狀,直至就診前生長(zhǎng)發(fā)育均良好。查體精神反應(yīng)好,無(wú)特殊疾病面容,肝脾無(wú)腫大,血檢僅有肝功能輕度異常,血串聯(lián)質(zhì)譜分析仍提示甲硫氨酸輕度升高。由于患兒缺乏臨床特異性,我們選擇最合適的基因測(cè)序+MLPA技...
【文章來(lái)源】:青島大學(xué)山東省
【文章頁(yè)數(shù)】:40 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
先證者及其父母測(cè)序結(jié)果與正常對(duì)比
親Ⅰ1攜帶相同錯(cuò)義突變,箭頭所指出為突變位點(diǎn)。Ⅰ2、Ⅲ圖分別為先證者母親及正常氨基酸序列。圖2 先證者甲硫氨酸濃度變化圖3 家系圖注:圖 3 家系圖中Ⅱ是先證者,I1、I2 分別是先證者父親、母親。2.4 生物信息學(xué)分析致病性“中心法則”提出DNA的改變會(huì)導(dǎo)致RNA的變化,并可導(dǎo)致其編碼的氨基酸發(fā)生變化。而氨基酸的改變可能會(huì)引起蛋白質(zhì)高級(jí)結(jié)構(gòu)改變,并最終影響蛋白質(zhì)功能。利用SIFT(Sorting Intolerant From Tolerant)和Polyphen-2(Phenotyping Version2)基于蛋白序列同源性算法的預(yù)測(cè)原理,來(lái)共同評(píng)價(jià)SNP(人類可遺傳的變異中最常見(jiàn)的一種)對(duì)蛋白結(jié)構(gòu)、功能的影響。2.4.1 Polyphen-2軟件采用了Na ve Bayes的機(jī)器學(xué)習(xí)算法來(lái)評(píng)估SNP導(dǎo)致的氨基酸改變對(duì)蛋白質(zhì)折疊、互作、構(gòu)象穩(wěn)定性的影響。
圖2 先證者甲硫氨酸濃度變化圖3 家系圖注:圖 3 家系圖中Ⅱ是先證者,I1、I2 分別是先證者父親、母親。2.4 生物信息學(xué)分析致病性“中心法則”提出DNA的改變會(huì)導(dǎo)致RNA的變化,并可導(dǎo)致其編碼的氨基酸發(fā)生變化。而氨基酸的改變可能會(huì)引起蛋白質(zhì)高級(jí)結(jié)構(gòu)改變,并最終影響蛋白質(zhì)功能。利用SIFT(Sorting Intolerant From Tolerant)和Polyphen-2(Phenotyping Version2)基于蛋白序列同源性算法的預(yù)測(cè)原理,來(lái)共同評(píng)價(jià)SNP(人類可遺傳的變異中最常見(jiàn)的一種)對(duì)蛋白結(jié)構(gòu)、功能的影響。2.4.1 Polyphen-2軟件采用了Na ve Bayes的機(jī)器學(xué)習(xí)算法來(lái)評(píng)估SNP導(dǎo)致的氨基酸改變對(duì)蛋白質(zhì)折疊、互作、構(gòu)象穩(wěn)定性的影響。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]20027例新生兒遺傳代謝病串聯(lián)質(zhì)譜篩查的初步報(bào)告[J]. 楊宇奇,蔣曙紅,韓小亞,江麗華,虞斌,朱偉. 重慶醫(yī)學(xué). 2018(02)
[2]1例高甲硫氨酸血癥基因突變分析[J]. 楊宇奇,王淮燕,江麗華,張瑜平,虞斌,朱偉,秦志強(qiáng). 中國(guó)當(dāng)代兒科雜志. 2017(09)
[3]遺傳變異分類標(biāo)準(zhǔn)與指南[J]. 王秋菊,沈亦平,鄔玲仟,陳少科,陳子江,方向東,傅松濱,龔瑤琴,黃國(guó)英,黃國(guó)寧,黃荷鳳,黃山,郝曉柯,冀小平,李紅,梁波,廖燦,喬杰,蘇海翔,魏軍,王磊,王樹(shù)玉,王曉紅,邢清和,徐湘民,袁慧軍,楊正林,周從容,周文浩,曾勇,張學(xué)軍,黃濤生,鄭茜,秦勝營(yíng),于世輝,關(guān)靜,王洪陽(yáng),王大勇,趙立東,王慧君,孔令印,宣黎明,冒燕,祝軼君,徐君玲,王劍青,王莉,趙婷,秦一丁,夏瀅穎,樊麗霞,趙丁丁,邱浩,賀林. 中國(guó)科學(xué):生命科學(xué). 2017(06)
[4]一例單純性高甲硫氨酸血癥患兒的MAT1A基因突變分析[J]. 孫云,馬定遠(yuǎn),王彥云,楊冰,蔣濤. 中華醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)雜志. 2017 (01)
[5]五種生物信息學(xué)軟件對(duì)于錯(cuò)義突變預(yù)測(cè)性能的評(píng)估[J]. 陳倩婷,戴聰伶,張前軍,杜娟,李汶. 中華醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)雜志. 2016 (05)
[6]11204例新生兒串聯(lián)質(zhì)譜篩查結(jié)果分析[J]. 鄭文吉,王飛,余頎,陳志央,莊丹燕. 中國(guó)優(yōu)生與遺傳雜志. 2016(02)
[7]高通量測(cè)序數(shù)據(jù)分析和臨床診斷流程的解讀[J]. 黎籽秀,劉博,徐凌麗,楊琳,王慧君,周文浩. 中國(guó)循證兒科雜志. 2015(01)
[8]全外顯子組測(cè)序:兒童疾病診斷新思路[J]. 馬丁艾遙,馬丁艾路,王慧君,周文浩. 中國(guó)循證兒科雜志. 2015(01)
[9]希特林蛋白缺乏癥的研究進(jìn)展[J]. 堵向楠,丁巖,王向波. 疑難病雜志. 2014(09)
[10]Citrin缺陷導(dǎo)致的新生兒肝內(nèi)膽汁淤積癥內(nèi)分泌代謝特征分析[J]. 張文,劉麗,盛慧英,彭敏芝,趙小媛,吳冬燕. 中國(guó)實(shí)用兒科雜志. 2013(01)
本文編號(hào):2897869
【文章來(lái)源】:青島大學(xué)山東省
【文章頁(yè)數(shù)】:40 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
先證者及其父母測(cè)序結(jié)果與正常對(duì)比
親Ⅰ1攜帶相同錯(cuò)義突變,箭頭所指出為突變位點(diǎn)。Ⅰ2、Ⅲ圖分別為先證者母親及正常氨基酸序列。圖2 先證者甲硫氨酸濃度變化圖3 家系圖注:圖 3 家系圖中Ⅱ是先證者,I1、I2 分別是先證者父親、母親。2.4 生物信息學(xué)分析致病性“中心法則”提出DNA的改變會(huì)導(dǎo)致RNA的變化,并可導(dǎo)致其編碼的氨基酸發(fā)生變化。而氨基酸的改變可能會(huì)引起蛋白質(zhì)高級(jí)結(jié)構(gòu)改變,并最終影響蛋白質(zhì)功能。利用SIFT(Sorting Intolerant From Tolerant)和Polyphen-2(Phenotyping Version2)基于蛋白序列同源性算法的預(yù)測(cè)原理,來(lái)共同評(píng)價(jià)SNP(人類可遺傳的變異中最常見(jiàn)的一種)對(duì)蛋白結(jié)構(gòu)、功能的影響。2.4.1 Polyphen-2軟件采用了Na ve Bayes的機(jī)器學(xué)習(xí)算法來(lái)評(píng)估SNP導(dǎo)致的氨基酸改變對(duì)蛋白質(zhì)折疊、互作、構(gòu)象穩(wěn)定性的影響。
圖2 先證者甲硫氨酸濃度變化圖3 家系圖注:圖 3 家系圖中Ⅱ是先證者,I1、I2 分別是先證者父親、母親。2.4 生物信息學(xué)分析致病性“中心法則”提出DNA的改變會(huì)導(dǎo)致RNA的變化,并可導(dǎo)致其編碼的氨基酸發(fā)生變化。而氨基酸的改變可能會(huì)引起蛋白質(zhì)高級(jí)結(jié)構(gòu)改變,并最終影響蛋白質(zhì)功能。利用SIFT(Sorting Intolerant From Tolerant)和Polyphen-2(Phenotyping Version2)基于蛋白序列同源性算法的預(yù)測(cè)原理,來(lái)共同評(píng)價(jià)SNP(人類可遺傳的變異中最常見(jiàn)的一種)對(duì)蛋白結(jié)構(gòu)、功能的影響。2.4.1 Polyphen-2軟件采用了Na ve Bayes的機(jī)器學(xué)習(xí)算法來(lái)評(píng)估SNP導(dǎo)致的氨基酸改變對(duì)蛋白質(zhì)折疊、互作、構(gòu)象穩(wěn)定性的影響。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]20027例新生兒遺傳代謝病串聯(lián)質(zhì)譜篩查的初步報(bào)告[J]. 楊宇奇,蔣曙紅,韓小亞,江麗華,虞斌,朱偉. 重慶醫(yī)學(xué). 2018(02)
[2]1例高甲硫氨酸血癥基因突變分析[J]. 楊宇奇,王淮燕,江麗華,張瑜平,虞斌,朱偉,秦志強(qiáng). 中國(guó)當(dāng)代兒科雜志. 2017(09)
[3]遺傳變異分類標(biāo)準(zhǔn)與指南[J]. 王秋菊,沈亦平,鄔玲仟,陳少科,陳子江,方向東,傅松濱,龔瑤琴,黃國(guó)英,黃國(guó)寧,黃荷鳳,黃山,郝曉柯,冀小平,李紅,梁波,廖燦,喬杰,蘇海翔,魏軍,王磊,王樹(shù)玉,王曉紅,邢清和,徐湘民,袁慧軍,楊正林,周從容,周文浩,曾勇,張學(xué)軍,黃濤生,鄭茜,秦勝營(yíng),于世輝,關(guān)靜,王洪陽(yáng),王大勇,趙立東,王慧君,孔令印,宣黎明,冒燕,祝軼君,徐君玲,王劍青,王莉,趙婷,秦一丁,夏瀅穎,樊麗霞,趙丁丁,邱浩,賀林. 中國(guó)科學(xué):生命科學(xué). 2017(06)
[4]一例單純性高甲硫氨酸血癥患兒的MAT1A基因突變分析[J]. 孫云,馬定遠(yuǎn),王彥云,楊冰,蔣濤. 中華醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)雜志. 2017 (01)
[5]五種生物信息學(xué)軟件對(duì)于錯(cuò)義突變預(yù)測(cè)性能的評(píng)估[J]. 陳倩婷,戴聰伶,張前軍,杜娟,李汶. 中華醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)雜志. 2016 (05)
[6]11204例新生兒串聯(lián)質(zhì)譜篩查結(jié)果分析[J]. 鄭文吉,王飛,余頎,陳志央,莊丹燕. 中國(guó)優(yōu)生與遺傳雜志. 2016(02)
[7]高通量測(cè)序數(shù)據(jù)分析和臨床診斷流程的解讀[J]. 黎籽秀,劉博,徐凌麗,楊琳,王慧君,周文浩. 中國(guó)循證兒科雜志. 2015(01)
[8]全外顯子組測(cè)序:兒童疾病診斷新思路[J]. 馬丁艾遙,馬丁艾路,王慧君,周文浩. 中國(guó)循證兒科雜志. 2015(01)
[9]希特林蛋白缺乏癥的研究進(jìn)展[J]. 堵向楠,丁巖,王向波. 疑難病雜志. 2014(09)
[10]Citrin缺陷導(dǎo)致的新生兒肝內(nèi)膽汁淤積癥內(nèi)分泌代謝特征分析[J]. 張文,劉麗,盛慧英,彭敏芝,趙小媛,吳冬燕. 中國(guó)實(shí)用兒科雜志. 2013(01)
本文編號(hào):2897869
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