糖苷水解酶GH97家族成員PspAG97A的催化機制分析
發(fā)布時間:2024-07-06 01:18
糖苷水解酶GH97家族是一個特殊的家族,同時擁有反轉和保留兩種催化類型成員,其兩種催化類型如何分化目前還不清楚。對GH97家族成員PspAG97A的催化機制進行分析,通過高效液相色譜法檢測水解產物異頭物的構型,根據在不同酶反應時間所檢測到的α-葡萄糖與β-葡萄糖的比例變化,證明PspAG97A執(zhí)行反轉催化機制。通過結構分析與定點突變等方法嘗試對PspAG97A的催化類型進行改造,將PspAG97A與同一家族成員BtGH97b(保留型)活性中心進行疊加比較,仿照保留類型的催化裝置對相關位點G407、E377及E456進行單點突變和聯(lián)合突變。結果顯示突變酶活力相比野生型顯著下降,并分析了相關位點的作用。研究加深了對PspAG97A催化機制的認識,為GH97家族兩種催化類型進化關系的研究奠定基礎。
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【部分圖文】:
本文編號:4001839
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圖1PspAG97A結構示意圖
使用Pymol軟件對PspAG97A與GH97家族中執(zhí)行保留類型催化機制的α-半乳糖苷水解酶BtGH97b進行結構比對分析,仿照保留類型的催化裝置,將PspAG97A催化中心的Gly407突變?yōu)閷贐tGH97b中的Asp415,使其作為親核體。而Glu480作為廣義酸堿,先后....
圖2重組酶與突變酶的SDS-PAGE檢測分析
α-葡萄糖苷酶PspAG97A以外切的方式水解底物非還原末端,斷開α-1,4-糖苷鍵釋放出一分子葡萄糖。通過HPLC方法檢測了PspAG97A降解pNPαG降解產物的異頭碳形式。如圖3所示,在反應初始階段,酶催化底物pNPαG水解產生β-D-葡萄糖。隨著酶反應時間的增加,α型:....
圖3PspAG97A水解產物異頭碳構型分析
圖2重組酶與突變酶的SDS-PAGE檢測分析2.4PspAG97A與突變酶的酶活力分析
圖4PspAG97A與催化類型轉變相關突變體的酶活力大小
以pNPαG作為底物,重組酶PspAG97A作為對照,測定突變酶水解底物的活力大小,并運用統(tǒng)計軟件SPSS17.0對數據進行多重比較分析。從圖4可以看出,突變酶的比活力與重組酶相比降低了100倍以上,差異顯著(P<0.05)。而突變酶之間相比,差異不顯著(P>0.05)。這說明....
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