咸淡水過渡區(qū)中地下水微生物群落結(jié)構(gòu)與多樣性特征研究
【學(xué)位單位】:中國地質(zhì)大學(xué)(北京)
【學(xué)位級別】:博士
【學(xué)位年份】:2020
【中圖分類】:Q938
【部分圖文】:
為了更直觀顯示出七組實驗樣品微生物在屬類水平上的差異與趨勢,以熱圖的形式表示豐度值,如圖6-3。其中假單胞菌屬(Pseudomonas),食酸菌屬(Acidovorax),假黃單胞菌屬(Pseudoxanthomonas),鞘脂單胞菌屬(Sphingomonas),枝動桿菌屬(Mycoplana),微小桿菌屬(Exiguobacterium),苯基桿菌屬(Phenylobacterium)和鞘脂菌屬(Sphingobium)存在于全尺度SC(%)范圍(0~100%)內(nèi);噬氫菌屬(Hydrogenophaga)僅存在于SC(%)范圍為0~10%內(nèi);鼠孢菌屬(Sporomusa)僅存在于淡水環(huán)境中;沉積物桿狀菌屬(Sediminibacterium)和溶桿菌屬(Lysobacter)存在于SC(%)低于25%的環(huán)境內(nèi);Maricaulis屬,鼠尾菌屬(Muricauda)和Winogradskyella菌屬存在于SC(%)高于25%的環(huán)境內(nèi);Diaphorobacter菌屬,固氮根瘤菌屬(Azorhizobium)和不粘柄菌屬(Asticcacaulis)存在于SC(%)低于50%的環(huán)境內(nèi);弧菌屬(Vibrio),Nautella菌屬和Balneola菌屬存在于SC(%)高于50%的環(huán)境內(nèi)。
在功能分類1水平上,發(fā)現(xiàn)的主要功能基因簇有七大類,包括:細(xì)胞轉(zhuǎn)化(Cellular Processes),環(huán)境信息處理(Environmental Information Processing),遺傳信息處理(Genetic Information Processing),人類疾病(Human Diseases),新陳代謝(Metabolism),有機(jī)系統(tǒng)(Organismal Systems),未分類(Unclassified)。在功能基因分類2水平上,占據(jù)較大的比重的功能基因簇有:膜轉(zhuǎn)運(yùn)(Membrane Transport),氨基酸代謝作用(Amino Acid Metabolism),碳水化合物代謝作用(Carbohydrate Metabolism),復(fù)制和修復(fù)(Replication and Repair),能量代謝作用(Energy Metabolism),細(xì)胞運(yùn)動(Cell Motility)等(圖6-6)。通過實驗數(shù)據(jù)與野外實測數(shù)據(jù)進(jìn)行對比可以發(fā)現(xiàn),兩者在功能分類2水平上的主要功能基因簇基本相同,這也側(cè)向證明了室內(nèi)實驗數(shù)據(jù)的可靠性。對微生物群落功能基因分類水平2上的41種基因簇與SC(%)進(jìn)行皮爾遜相關(guān)性分析,結(jié)果顯示在表6-6中。在微生物群落功能方面,與SC(%)呈現(xiàn)顯著相關(guān)(p<0.01)的基因簇有兩個,分別是癌癥(Cancers)和信號傳導(dǎo)(Signal Transduction),前者是正相關(guān),后者為負(fù)相關(guān);有六種基因簇與SC(%)呈現(xiàn)正相關(guān)(p<0.05),包括氨基酸代謝(Amino Acid Metabolism)、心血管疾病(Cardiovascular Diseases)、細(xì)胞通訊(Cell Communication)、輔酶因子與維生素代謝作用(Metabolism of Cofactors and Vitamins)、神經(jīng)系統(tǒng)(Nervous System)和神經(jīng)退行性疾病(Neurodegenerative Diseases);兩種基因簇與SC(%)呈現(xiàn)負(fù)相關(guān)(p<0.05),分別是細(xì)胞運(yùn)動(Cell Motility)和細(xì)胞過程與信號作用(Cellular Processes and Signaling)。
結(jié)合16S rDNA測序數(shù)據(jù),利用PICRUSt對實驗二樣品微生物的功能進(jìn)行預(yù)測,并比較各組功能特性差異。在功能分類1水平上,同樣發(fā)現(xiàn)的主要功能基因簇有七大類,與實驗一結(jié)果一致。在功能分類2水平上,占據(jù)較大的比重的功能基因簇有:膜轉(zhuǎn)運(yùn)(Membrane Transport),氨基酸代謝作用(Amino Acid Metabolism),碳水化合物代謝作用(Carbohydrate Metabolism),能量代謝作用(Energy Metabolism),復(fù)制和修復(fù)(Replication and Repair)等(圖6-10)。強(qiáng)驅(qū)替組和弱驅(qū)替組與控制組之間的微生物群落功能基因差異如圖6-11所示。根據(jù)結(jié)果可以得出弱咸淡水驅(qū)替作用對微生物群落功能特性的影響不大,P4與P5兩組實驗樣品都顯示相同的結(jié)果,而強(qiáng)咸淡水驅(qū)替作用對其功能特性有一定影響。在P4實驗組中,強(qiáng)驅(qū)替作用顯著改變了微生物功能分布特性,使得P4.3與P4.1和P4.2存在差異;在P5實驗組中,強(qiáng)驅(qū)替作用對微生物功能分布特性的改變不顯著,使得P5.3與P5.1和P5.2差異不明顯;且P4.3的功能分布特性與P5.3類似,說明強(qiáng)驅(qū)替作用對微生物群落功能特性有影響,SC(%)含量越低,其影響越大。換句話說,環(huán)境微生物受到擾動越強(qiáng)烈,其功能特性變化越顯著。
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本文編號:2891691
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