BTA1調(diào)控水稻分蘗角度的分子機制研究
發(fā)布時間:2021-02-11 09:59
分蘗角度是影響水稻株型的重要因素。定位和克隆調(diào)控水稻分蘗角度的基因,開展調(diào)控水稻分蘗角度形成的分子機制的研究,對水稻株型改良、開展水稻超高產(chǎn)理想株型育種具有重要的理論和實踐意義。水稻分蘗角度的形成是一個非常復(fù)雜的過程。除了遺傳因素外,多種自然環(huán)境條件(包括光照、重力)、激素水平等因素均參與水稻分蘗角度的調(diào)控。已有的研究表明,水稻的負向重力性反應(yīng)和分蘗著生的細胞學(xué)形態(tài)變化是導(dǎo)致水稻分蘗角度變化的原因。目前已經(jīng)克隆了一些調(diào)控水稻分蘗角度的基因。但是,深入的分子機制尚不清楚。本研究以EMS化學(xué)誘變篩選獲得的分蘗角度變大、呈散生狀生長的突變體(bigger tiller angle 1-1,bta1-1)為試材,利用圖位克隆、DNA重組技術(shù)、農(nóng)桿菌介導(dǎo)的水稻成熟胚遺傳轉(zhuǎn)化技術(shù)、熒光定量RT-PCR技術(shù)、煙草瞬時轉(zhuǎn)化、RNA高通量轉(zhuǎn)錄組測序和分析等技術(shù),觀察了bta1-1突變體的分蘗角度和負向重力性反應(yīng)的變化;定位并克隆了BTA1基因;對該基因進行了表達模式分析和差異表達分析;分析了bta1-1突變體和野生型(WT)之間差異表達的基因;分析了差異表達基因的富集通路,從全基因組水平分析了BTA1調(diào)...
【文章來源】:沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)遼寧省
【文章頁數(shù)】:102 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
水稻株型構(gòu)成分子機理模式圖(梁彥等,2016)
水稻分蘗數(shù)量是一個非常復(fù)雜的農(nóng)藝性狀,受遺傳、環(huán)境、栽培措施等因素影響(Wang andLi,2011)。近年來,有關(guān)水稻分蘗數(shù)量性狀的主效調(diào)控基因的研究取得了一定進展,已經(jīng)克隆了一些促進水稻分蘗和抑制水稻分蘗的基因(圖1-2)。MONOCULM1(MOC1)是正向調(diào)控水稻分蘗數(shù)的基因(Li et al.,2003)。由于分蘗芽形成的缺陷導(dǎo)致moc1突變體表現(xiàn)出一個單分蘗表型的突變體。研究表明,MOC1編碼一個定位在核內(nèi)的GRAS家族蛋白,在營養(yǎng)生長和生殖生長階段控制葉腋分生組織形成。MOC1在葉腋分生組織和腋芽的形成中發(fā)揮重要作用,還促進腋芽的伸長生長(Li et al.,2003)。此外,monoculm 2(moc2)是一個分蘗數(shù)量減少的突變體,表現(xiàn)為單蘗、矮化、葉色淡綠,同時穗和穗粒數(shù)有顯著降低。研究發(fā)現(xiàn),MOC2基因編碼胞質(zhì)果糖-1,6-二磷酸酶(FBP1),是蔗糖合成途徑中一個非常重要的酶,其活性缺失導(dǎo)致蔗糖供應(yīng)不足,單重突變體分蘗芽生長受到抑制(Koumoto et al.,2013)。MONOCULM 3(MOC3)基因編碼一個WOX蛋白質(zhì)家族成員,是轉(zhuǎn)錄抑制子。研究表明,MOC3通過促進OSH1的表達,維持分生組織區(qū)的正常生長,并且促進腋芽分生組織的形成,是腋芽形成所必需的,MOC3可能作用于MOC1和LAX的下游或者通過一個獨立的途徑影響腋芽形成(Lu et al.,2015;Tanaka et al.,2015)。關(guān)于水稻分蘗數(shù)的負向調(diào)控因子的研究也取得了很大進展。日本學(xué)者Takeda等基于玉米TB1基因的高相似性,采用同源克隆的方法分離鑒定出TEOSINTE BRANCHED 1(OsTB1)基因(Takeda et al.,2003)。對基因功能的研究發(fā)現(xiàn),OsTB1基因抑制腋芽的活性。OsTB1超表達使水稻植株分蘗數(shù)量減少,說明TB1超表達會抑制側(cè)芽的生長,但側(cè)芽的分化不受影響。利用篩選獲得的多分蘗矮桿突變體high-tillering dwarf 1(htd1),定位分離出HTD1基因(Zou et al.,2005;Zou et al.,2006)。經(jīng)過序列比對和蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)域分析,HTD1基因在物種間高度保守,在多種植物中都有同源基因。HTD1是通過抑制水稻分蘗芽的萌發(fā)從而調(diào)控水稻分蘗數(shù)。此外,通過對d系列的矮稈多蘗突變體的研究發(fā)現(xiàn),DWARF10(D10)、DWARF17(D17)、DWARF27(D27)均在獨腳金內(nèi)酯的合成途徑中發(fā)揮作用。D10基因編碼一個類胡蘿卜素裂解雙加氧酶OsCCD8,是獨腳金內(nèi)酯生物合成中的關(guān)鍵酶。D10的轉(zhuǎn)錄是抑制分蘗通路的關(guān)鍵步驟,其功能的缺失導(dǎo)致突變體株高變矮,分蘗增多(Arite et al.,2007)。D17處于獨腳金內(nèi)酯合成基因OsMAX1的上游,并且編碼一個類胡蘿卜素裂解雙加氧酶OsCCD7,是擬南芥MAX3的同源蛋白,參與負向調(diào)控水稻側(cè)芽生長(Zou et al.,2006)。D27突變之后生長素極性運輸增強,根部分泌液中檢測不到獨腳金內(nèi)酯從而導(dǎo)致其突變體喪失抑制分蘗芽向外生長能力,因此表現(xiàn)出分蘗數(shù)增加的表型(Lin et al.,2009)。DWARF3(D3)、DWARF14(D14)、DWARF53(D53)作用于獨腳金內(nèi)酯的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路(Ishikawa et al.,2005;Arite et al.,2009;Zhou et al.,2013;Jiang et al.,2013;Wang et al.,2018)。D53編碼一個在結(jié)構(gòu)上與I類Clp ATP酶類似的蛋白,是SCFD3泛素化復(fù)合體的底物,與α/β水解酶D14、F-box蛋白D3形成蛋白復(fù)合體,是獨角金內(nèi)酯信號途徑的抑制因子,在依賴D14和D3的條件下,SL通過蛋白酶體途徑誘導(dǎo)D53降解,抑制其活性,促進側(cè)芽生長。D家族基因通過調(diào)控獨腳金內(nèi)酯的合成或運輸來間接調(diào)控水稻分蘗數(shù)量,說明獨腳金內(nèi)酯在水稻分蘗發(fā)生和數(shù)量上起著重要的作用(圖1-3)。
關(guān)于水稻分蘗數(shù)的負向調(diào)控因子的研究也取得了很大進展。日本學(xué)者Takeda等基于玉米TB1基因的高相似性,采用同源克隆的方法分離鑒定出TEOSINTE BRANCHED 1(OsTB1)基因(Takeda et al.,2003)。對基因功能的研究發(fā)現(xiàn),OsTB1基因抑制腋芽的活性。OsTB1超表達使水稻植株分蘗數(shù)量減少,說明TB1超表達會抑制側(cè)芽的生長,但側(cè)芽的分化不受影響。利用篩選獲得的多分蘗矮桿突變體high-tillering dwarf 1(htd1),定位分離出HTD1基因(Zou et al.,2005;Zou et al.,2006)。經(jīng)過序列比對和蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)域分析,HTD1基因在物種間高度保守,在多種植物中都有同源基因。HTD1是通過抑制水稻分蘗芽的萌發(fā)從而調(diào)控水稻分蘗數(shù)。此外,通過對d系列的矮稈多蘗突變體的研究發(fā)現(xiàn),DWARF10(D10)、DWARF17(D17)、DWARF27(D27)均在獨腳金內(nèi)酯的合成途徑中發(fā)揮作用。D10基因編碼一個類胡蘿卜素裂解雙加氧酶OsCCD8,是獨腳金內(nèi)酯生物合成中的關(guān)鍵酶。D10的轉(zhuǎn)錄是抑制分蘗通路的關(guān)鍵步驟,其功能的缺失導(dǎo)致突變體株高變矮,分蘗增多(Arite et al.,2007)。D17處于獨腳金內(nèi)酯合成基因OsMAX1的上游,并且編碼一個類胡蘿卜素裂解雙加氧酶OsCCD7,是擬南芥MAX3的同源蛋白,參與負向調(diào)控水稻側(cè)芽生長(Zou et al.,2006)。D27突變之后生長素極性運輸增強,根部分泌液中檢測不到獨腳金內(nèi)酯從而導(dǎo)致其突變體喪失抑制分蘗芽向外生長能力,因此表現(xiàn)出分蘗數(shù)增加的表型(Lin et al.,2009)。DWARF3(D3)、DWARF14(D14)、DWARF53(D53)作用于獨腳金內(nèi)酯的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路(Ishikawa et al.,2005;Arite et al.,2009;Zhou et al.,2013;Jiang et al.,2013;Wang et al.,2018)。D53編碼一個在結(jié)構(gòu)上與I類Clp ATP酶類似的蛋白,是SCFD3泛素化復(fù)合體的底物,與α/β水解酶D14、F-box蛋白D3形成蛋白復(fù)合體,是獨角金內(nèi)酯信號途徑的抑制因子,在依賴D14和D3的條件下,SL通過蛋白酶體途徑誘導(dǎo)D53降解,抑制其活性,促進側(cè)芽生長。D家族基因通過調(diào)控獨腳金內(nèi)酯的合成或運輸來間接調(diào)控水稻分蘗數(shù)量,說明獨腳金內(nèi)酯在水稻分蘗發(fā)生和數(shù)量上起著重要的作用(圖1-3)。1.1.4 水稻穗型調(diào)控的分子機制
【參考文獻】:
期刊論文
[1]水稻株型功能基因及其在育種上的應(yīng)用[J]. 梁彥,王永紅. 生命科學(xué). 2016(10)
[2]轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)在玉米中的應(yīng)用研究進展[J]. 許波,張偉強,馮曉曦,王成業(yè),張海申,許海濤,王友華,張今瀚. 玉米科學(xué). 2014(01)
[3]水稻株型相關(guān)基因的定位與克隆研究進展[J]. 林澤川,曹立勇. 中國稻米. 2014(01)
[4]長鏈非編碼RNA的作用機制及其研究方法[J]. 夏天,肖丙秀,郭俊明. 遺傳. 2013(03)
[5]中國作物分子設(shè)計育種[J]. 王建康,李慧慧,張學(xué)才,尹長斌,黎裕,馬有志,李新海,邱麗娟,萬建民. 作物學(xué)報. 2011(02)
[6]水稻卷窄葉突變相關(guān)基因OsCSLD4的RNAi研究及表達分析[J]. 朱麗,胡江,顏美仙,高振宇,劉堅,錢前,郭龍彪. 核農(nóng)學(xué)報. 2010(05)
[7]植物葉發(fā)育的分子機理[J]. 嚴松,嚴長杰,顧銘洪. 遺傳. 2008(09)
[8]LAZY1 controls rice shoot gravitropism through regulating polar auxin transport[J]. Peijin Li1;Yonghong Wang1;Qian Qian2;Zhiming Fu1;Mei Wang1;Dali Zeng1,2;Baohua Li1;Xiujie Wang1;Jiayang Li11 State Key Laboratory of Plant Genomics and National Center for Plant Gene Research, Institute of Genetics and Developmental Biology, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100101, China2 State Key Laboratory of Rice Biology, China National Rice Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Hangzhou 310006, China. Cell Research. 2007(05)
[9]Heterotrimeric G protein α subunit is involved in rice brassinosteroid response[J]. Lei Wang~(1,2) Yun-Yuan Xu~1 Qi-Bin Ma~(1,2) Dan Li~(1,2) Zhi-Hong Xu~(1,3) Kang Chong~(1,3) 1 Key Laboratory of Photosynthesis and Environmental Molecular Physiology,Institute of Botany,Chinese Academy of Sciences,Nanxincun 20,Xiangshan,Beijing 100093,China,2 Graduate School of the Chinese Academv of Sciences,100046 Beijing,China;3 National Plant Gene Research Center (Beijing),Beijing 100093,China. Cell Research. 2006(12)
[10]生長素調(diào)控植物株型形成的研究進展[J]. 王冰,李家洋,王永紅. 植物學(xué)通報. 2006(05)
本文編號:3028929
【文章來源】:沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)遼寧省
【文章頁數(shù)】:102 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
水稻株型構(gòu)成分子機理模式圖(梁彥等,2016)
水稻分蘗數(shù)量是一個非常復(fù)雜的農(nóng)藝性狀,受遺傳、環(huán)境、栽培措施等因素影響(Wang andLi,2011)。近年來,有關(guān)水稻分蘗數(shù)量性狀的主效調(diào)控基因的研究取得了一定進展,已經(jīng)克隆了一些促進水稻分蘗和抑制水稻分蘗的基因(圖1-2)。MONOCULM1(MOC1)是正向調(diào)控水稻分蘗數(shù)的基因(Li et al.,2003)。由于分蘗芽形成的缺陷導(dǎo)致moc1突變體表現(xiàn)出一個單分蘗表型的突變體。研究表明,MOC1編碼一個定位在核內(nèi)的GRAS家族蛋白,在營養(yǎng)生長和生殖生長階段控制葉腋分生組織形成。MOC1在葉腋分生組織和腋芽的形成中發(fā)揮重要作用,還促進腋芽的伸長生長(Li et al.,2003)。此外,monoculm 2(moc2)是一個分蘗數(shù)量減少的突變體,表現(xiàn)為單蘗、矮化、葉色淡綠,同時穗和穗粒數(shù)有顯著降低。研究發(fā)現(xiàn),MOC2基因編碼胞質(zhì)果糖-1,6-二磷酸酶(FBP1),是蔗糖合成途徑中一個非常重要的酶,其活性缺失導(dǎo)致蔗糖供應(yīng)不足,單重突變體分蘗芽生長受到抑制(Koumoto et al.,2013)。MONOCULM 3(MOC3)基因編碼一個WOX蛋白質(zhì)家族成員,是轉(zhuǎn)錄抑制子。研究表明,MOC3通過促進OSH1的表達,維持分生組織區(qū)的正常生長,并且促進腋芽分生組織的形成,是腋芽形成所必需的,MOC3可能作用于MOC1和LAX的下游或者通過一個獨立的途徑影響腋芽形成(Lu et al.,2015;Tanaka et al.,2015)。關(guān)于水稻分蘗數(shù)的負向調(diào)控因子的研究也取得了很大進展。日本學(xué)者Takeda等基于玉米TB1基因的高相似性,采用同源克隆的方法分離鑒定出TEOSINTE BRANCHED 1(OsTB1)基因(Takeda et al.,2003)。對基因功能的研究發(fā)現(xiàn),OsTB1基因抑制腋芽的活性。OsTB1超表達使水稻植株分蘗數(shù)量減少,說明TB1超表達會抑制側(cè)芽的生長,但側(cè)芽的分化不受影響。利用篩選獲得的多分蘗矮桿突變體high-tillering dwarf 1(htd1),定位分離出HTD1基因(Zou et al.,2005;Zou et al.,2006)。經(jīng)過序列比對和蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)域分析,HTD1基因在物種間高度保守,在多種植物中都有同源基因。HTD1是通過抑制水稻分蘗芽的萌發(fā)從而調(diào)控水稻分蘗數(shù)。此外,通過對d系列的矮稈多蘗突變體的研究發(fā)現(xiàn),DWARF10(D10)、DWARF17(D17)、DWARF27(D27)均在獨腳金內(nèi)酯的合成途徑中發(fā)揮作用。D10基因編碼一個類胡蘿卜素裂解雙加氧酶OsCCD8,是獨腳金內(nèi)酯生物合成中的關(guān)鍵酶。D10的轉(zhuǎn)錄是抑制分蘗通路的關(guān)鍵步驟,其功能的缺失導(dǎo)致突變體株高變矮,分蘗增多(Arite et al.,2007)。D17處于獨腳金內(nèi)酯合成基因OsMAX1的上游,并且編碼一個類胡蘿卜素裂解雙加氧酶OsCCD7,是擬南芥MAX3的同源蛋白,參與負向調(diào)控水稻側(cè)芽生長(Zou et al.,2006)。D27突變之后生長素極性運輸增強,根部分泌液中檢測不到獨腳金內(nèi)酯從而導(dǎo)致其突變體喪失抑制分蘗芽向外生長能力,因此表現(xiàn)出分蘗數(shù)增加的表型(Lin et al.,2009)。DWARF3(D3)、DWARF14(D14)、DWARF53(D53)作用于獨腳金內(nèi)酯的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路(Ishikawa et al.,2005;Arite et al.,2009;Zhou et al.,2013;Jiang et al.,2013;Wang et al.,2018)。D53編碼一個在結(jié)構(gòu)上與I類Clp ATP酶類似的蛋白,是SCFD3泛素化復(fù)合體的底物,與α/β水解酶D14、F-box蛋白D3形成蛋白復(fù)合體,是獨角金內(nèi)酯信號途徑的抑制因子,在依賴D14和D3的條件下,SL通過蛋白酶體途徑誘導(dǎo)D53降解,抑制其活性,促進側(cè)芽生長。D家族基因通過調(diào)控獨腳金內(nèi)酯的合成或運輸來間接調(diào)控水稻分蘗數(shù)量,說明獨腳金內(nèi)酯在水稻分蘗發(fā)生和數(shù)量上起著重要的作用(圖1-3)。
關(guān)于水稻分蘗數(shù)的負向調(diào)控因子的研究也取得了很大進展。日本學(xué)者Takeda等基于玉米TB1基因的高相似性,采用同源克隆的方法分離鑒定出TEOSINTE BRANCHED 1(OsTB1)基因(Takeda et al.,2003)。對基因功能的研究發(fā)現(xiàn),OsTB1基因抑制腋芽的活性。OsTB1超表達使水稻植株分蘗數(shù)量減少,說明TB1超表達會抑制側(cè)芽的生長,但側(cè)芽的分化不受影響。利用篩選獲得的多分蘗矮桿突變體high-tillering dwarf 1(htd1),定位分離出HTD1基因(Zou et al.,2005;Zou et al.,2006)。經(jīng)過序列比對和蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)域分析,HTD1基因在物種間高度保守,在多種植物中都有同源基因。HTD1是通過抑制水稻分蘗芽的萌發(fā)從而調(diào)控水稻分蘗數(shù)。此外,通過對d系列的矮稈多蘗突變體的研究發(fā)現(xiàn),DWARF10(D10)、DWARF17(D17)、DWARF27(D27)均在獨腳金內(nèi)酯的合成途徑中發(fā)揮作用。D10基因編碼一個類胡蘿卜素裂解雙加氧酶OsCCD8,是獨腳金內(nèi)酯生物合成中的關(guān)鍵酶。D10的轉(zhuǎn)錄是抑制分蘗通路的關(guān)鍵步驟,其功能的缺失導(dǎo)致突變體株高變矮,分蘗增多(Arite et al.,2007)。D17處于獨腳金內(nèi)酯合成基因OsMAX1的上游,并且編碼一個類胡蘿卜素裂解雙加氧酶OsCCD7,是擬南芥MAX3的同源蛋白,參與負向調(diào)控水稻側(cè)芽生長(Zou et al.,2006)。D27突變之后生長素極性運輸增強,根部分泌液中檢測不到獨腳金內(nèi)酯從而導(dǎo)致其突變體喪失抑制分蘗芽向外生長能力,因此表現(xiàn)出分蘗數(shù)增加的表型(Lin et al.,2009)。DWARF3(D3)、DWARF14(D14)、DWARF53(D53)作用于獨腳金內(nèi)酯的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路(Ishikawa et al.,2005;Arite et al.,2009;Zhou et al.,2013;Jiang et al.,2013;Wang et al.,2018)。D53編碼一個在結(jié)構(gòu)上與I類Clp ATP酶類似的蛋白,是SCFD3泛素化復(fù)合體的底物,與α/β水解酶D14、F-box蛋白D3形成蛋白復(fù)合體,是獨角金內(nèi)酯信號途徑的抑制因子,在依賴D14和D3的條件下,SL通過蛋白酶體途徑誘導(dǎo)D53降解,抑制其活性,促進側(cè)芽生長。D家族基因通過調(diào)控獨腳金內(nèi)酯的合成或運輸來間接調(diào)控水稻分蘗數(shù)量,說明獨腳金內(nèi)酯在水稻分蘗發(fā)生和數(shù)量上起著重要的作用(圖1-3)。1.1.4 水稻穗型調(diào)控的分子機制
【參考文獻】:
期刊論文
[1]水稻株型功能基因及其在育種上的應(yīng)用[J]. 梁彥,王永紅. 生命科學(xué). 2016(10)
[2]轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)在玉米中的應(yīng)用研究進展[J]. 許波,張偉強,馮曉曦,王成業(yè),張海申,許海濤,王友華,張今瀚. 玉米科學(xué). 2014(01)
[3]水稻株型相關(guān)基因的定位與克隆研究進展[J]. 林澤川,曹立勇. 中國稻米. 2014(01)
[4]長鏈非編碼RNA的作用機制及其研究方法[J]. 夏天,肖丙秀,郭俊明. 遺傳. 2013(03)
[5]中國作物分子設(shè)計育種[J]. 王建康,李慧慧,張學(xué)才,尹長斌,黎裕,馬有志,李新海,邱麗娟,萬建民. 作物學(xué)報. 2011(02)
[6]水稻卷窄葉突變相關(guān)基因OsCSLD4的RNAi研究及表達分析[J]. 朱麗,胡江,顏美仙,高振宇,劉堅,錢前,郭龍彪. 核農(nóng)學(xué)報. 2010(05)
[7]植物葉發(fā)育的分子機理[J]. 嚴松,嚴長杰,顧銘洪. 遺傳. 2008(09)
[8]LAZY1 controls rice shoot gravitropism through regulating polar auxin transport[J]. Peijin Li1;Yonghong Wang1;Qian Qian2;Zhiming Fu1;Mei Wang1;Dali Zeng1,2;Baohua Li1;Xiujie Wang1;Jiayang Li11 State Key Laboratory of Plant Genomics and National Center for Plant Gene Research, Institute of Genetics and Developmental Biology, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100101, China2 State Key Laboratory of Rice Biology, China National Rice Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Hangzhou 310006, China. Cell Research. 2007(05)
[9]Heterotrimeric G protein α subunit is involved in rice brassinosteroid response[J]. Lei Wang~(1,2) Yun-Yuan Xu~1 Qi-Bin Ma~(1,2) Dan Li~(1,2) Zhi-Hong Xu~(1,3) Kang Chong~(1,3) 1 Key Laboratory of Photosynthesis and Environmental Molecular Physiology,Institute of Botany,Chinese Academy of Sciences,Nanxincun 20,Xiangshan,Beijing 100093,China,2 Graduate School of the Chinese Academv of Sciences,100046 Beijing,China;3 National Plant Gene Research Center (Beijing),Beijing 100093,China. Cell Research. 2006(12)
[10]生長素調(diào)控植物株型形成的研究進展[J]. 王冰,李家洋,王永紅. 植物學(xué)通報. 2006(05)
本文編號:3028929
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