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文蛤弧菌抗性相關(guān)基因表達性狀的分析及其遺傳力估計

發(fā)布時間:2024-06-04 00:42
  文蛤(Meretrix petechialis)是我國重要的經(jīng)濟養(yǎng)殖貝類之一。近年來,養(yǎng)殖過程中時有弧菌病和規(guī)模性死亡的發(fā)生,給文蛤養(yǎng)殖業(yè)帶來了沉重的打擊。這固然與養(yǎng)殖環(huán)境惡化、養(yǎng)殖密度增加等因素有關(guān),但抗性優(yōu)良品種的缺乏也是造成上述問題的重要原因。因此,通過遺傳選育的方式培育抗病、抗逆的文蛤新品系具有重要的經(jīng)濟價值。然而,由于抗病性的遺傳機制非常復(fù)雜,受環(huán)境影響較大以及抗性性狀難以準確測量等原因,使得貝類抗性選育工作的進程十分緩慢。在抗性選育中,遺傳參數(shù)的準確估計是制定有效選育策略的前提和基礎(chǔ),而與弧菌抗性顯著相關(guān)的分子標(biāo)記的應(yīng)用,可以加速抗性品系的培育進程。本研究通過建立的具有抗性差異的全同胞家系材料,基于文蛤的轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù),對文蛤的弧菌抗性和免疫基因的表達性狀進行了關(guān)聯(lián)分析,并估計了基因表達性狀的遺傳參數(shù),研究結(jié)果將有助于指導(dǎo)文蛤的弧菌抗性選育工作。本研究的主要結(jié)果如下:1、本研究采用RNA-seq技術(shù)檢測了文蛤感染弧菌后的肝胰腺中的基因表達變化。Illumina測序共獲得了199,318,966條clean reads,進一步拼接得到214,577條轉(zhuǎn)錄本,其中,N50長度為...

【文章頁數(shù)】:124 頁

【學(xué)位級別】:博士

【部分圖文】:

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圖1.2補體系統(tǒng)級聯(lián)激活途徑(Stephanetal.,2012)

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圖1.3參與長牡蠣抗逆免疫應(yīng)答途徑的主要基因(Zhangetal.,2016b)

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圖2.2Unigenes的KOG分類Fig2.2ClassificationoftheunigenesannotatedinKOG.

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本文編號:3988621

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