發(fā)布時(shí)間：2017-12-22 05:26

  本文關(guān)鍵詞：轉(zhuǎn)反義ACO基因甜瓜品系果實(shí)發(fā)育過程的轉(zhuǎn)錄組分析　出處：《內(nèi)蒙古大學(xué)》2017年碩士論文　論文類型：學(xué)位論文

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【摘要】：甜瓜是一種在世界廣泛種植的經(jīng)濟(jì)作物,研究甜瓜果實(shí)發(fā)育過程的生物學(xué)機(jī)制與相關(guān)基因,對(duì)于人們加強(qiáng)對(duì)甜瓜以及其他作物果實(shí)發(fā)育的理解具有重要意義,進(jìn)一步為果實(shí)的貯藏保鮮、品質(zhì)改良等提供了思路與理論依據(jù)。本研究利用轉(zhuǎn)錄組測序與生物信息學(xué)技術(shù),針對(duì)果實(shí)發(fā)育前后的兩個(gè)時(shí)期,對(duì)轉(zhuǎn)反義ACO基因的M9品系河套蜜瓜(Cucumis melo L.cv Hetao)與原種河套蜜瓜進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組測序和較全面的比較,以找出轉(zhuǎn)反義ACO基因與乙烯對(duì)甜瓜果實(shí)發(fā)育的影響。本研究對(duì)甜瓜乙烯合成轉(zhuǎn)錄調(diào)控與信號(hào)通路中的5個(gè)關(guān)鍵基因家族CmCTR、CmEIN2、CmHB、CmETR、CmRIN進(jìn)行了全基因組范圍的生物信息學(xué)鑒定,分別鑒定出了 20、6、17、3、21個(gè)家族成員。分析其與CmEIN3/EILs共6個(gè)基因家族在M9與原種河套蜜瓜轉(zhuǎn)錄組中的表達(dá)情況,結(jié)果顯示多數(shù)基因家族在此過程中的表達(dá)情況復(fù)雜,CmEIN3/EILs家族在兩個(gè)品系的樣本中整體受到上調(diào),CmETR則相反。本研究統(tǒng)計(jì)了 M9與原種河套蜜瓜轉(zhuǎn)錄組的GO富集情況,繪制了相應(yīng)的GO有向無循環(huán)圖,使用AmiG01.8對(duì)以上GO富集信息進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)M9品系在有機(jī)酸及羧酸代謝、細(xì)胞器及組分的組織與合成代謝、光合系統(tǒng)、與其他有機(jī)體的互作、脫羧反應(yīng)的氧化還原酶活性、核苷酸三磷酸酶活性方面的GO富集比例明顯大于原種,而原種在蛋白質(zhì)位置信息相關(guān)GO的富集比例和絕對(duì)數(shù)量都明顯大于M9品系。最后基于轉(zhuǎn)錄組Log2Foldchange值,利用R語言等工具篩選基因,進(jìn)一步選取了9個(gè)基因,為后續(xù)的研究提供了資料與依據(jù)。
【學(xué)位授予單位】：內(nèi)蒙古大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2017
【分類號(hào)】：S652

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：1318607