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牦牛ACACA基因遺傳特征及其對(duì)乳、肉品質(zhì)的影響

發(fā)布時(shí)間:2020-12-05 21:16
  乙酰輔酶A羧化酶α(acetyl-CoA carboxylases alpha,ACACA)是脂肪酸從頭合成的關(guān)鍵限速酶,在脂肪酸生物合成中起重要調(diào)控作用。本研究采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR和重亞硫酸鹽測(cè)序方法,檢測(cè)0.5和4.5歲天祝白牦牛(Bos grunniens)ACACA基因組織表達(dá)及PI啟動(dòng)子區(qū)CpG島在皮下脂肪組織中的甲基化水平,研究該基因組織表達(dá)規(guī)律及皮下脂肪組織中的表觀遺傳機(jī)制;采用PCR-SSCP方法檢測(cè)甘南牦牛、天祝白牦牛、青海牦牛、西藏牦牛和野血牦牛ACACA基因PI、PIA啟動(dòng)子區(qū)和intron5-intron6區(qū)突變位點(diǎn),分析基因突變對(duì)甘南牦牛乳、肉品質(zhì)性狀和乳中脂肪酸含量的影響。結(jié)果表明:1.ACACA基因在天祝白牦牛13個(gè)組織中表達(dá)量存在組織和年齡差異,0.5歲牦牛肝臟、腦、背最長(zhǎng)肌和腎臟中高度表達(dá)且肝臟中表達(dá)量顯著高于其他組織(P<0.05),4.5歲牦牛皮下脂肪和肝臟中表達(dá)量極顯著高于其他組織(P<0.01);0.5歲牦牛腎臟中表達(dá)量極顯著高于4.5歲牦牛(P<0.01),而在皮下脂肪、肝臟和睪丸中表達(dá)量顯著或極顯著低于4.5歲牦牛(P&... 

【文章來(lái)源】:甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)甘肅省

【文章頁(yè)數(shù)】:59 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

牦牛ACACA基因遺傳特征及其對(duì)乳、肉品質(zhì)的影響


普通牛ACACA基因結(jié)構(gòu)圖

分布圖,啟動(dòng)子,基因,分布圖


牦牛ACACA基因遺傳特征及其對(duì)乳、肉品質(zhì)的影響9圖1-2普通牛ACACA基因PI啟動(dòng)子區(qū)CpG島分布圖Figure1-2DistributionofCpGislandinPIpromoterregionofACACAgeneincattle3.2ACACA基因功能乙酰輔酶A羧化酶(acetyl-coenzymeAcarboxylase,ACC)屬于分子間羧化轉(zhuǎn)移家族成員,包含α和β兩種同工酶,將乙酰輔酶A(acetyl-CoA)羧化為丙二酸單酰輔酶A(malonyl-CoA),在脂肪酸代謝過(guò)程中起著重要作用[92]。乙酰輔酶A羧化酶α由乙酰輔酶A羧化酶α基因(acetyl-CoAcarboxylasealpha,ACACA)編碼,參與脂肪酸合成的第一步反應(yīng),催化乙酰輔酶A生成丙二酸單酰輔酶A,后者是長(zhǎng)鏈脂肪酸碳鏈延長(zhǎng)的C2供體,參與三酰甘油和磷脂的合成,從而生成長(zhǎng)鏈脂肪酸并形成細(xì)胞膜[93],ACACA是長(zhǎng)鏈脂肪酸生物合成過(guò)程中的重要限速酶[94]。ACACA基因缺失小鼠在胚胎期發(fā)生死亡,表明ACACA對(duì)胚胎的早期發(fā)育至關(guān)重要[82]。ACACA基因雖然在動(dòng)物體細(xì)胞中均有表達(dá),但脂肪酸生成活躍組織(如肝臟、脂肪和乳腺組織)中高表達(dá)[95]。乙酰輔酶A羧化為丙二酸單酰輔酶A有兩步反應(yīng):第一步:ATP+HCO3ˉ+BCCPBCCP.CO2ˉ+ADP+Pi第二步:BCCP.CO2ˉ+acetyl-CoABCCP+malonyl-CoA其中,BCCP為生物素羧化酶,BC為生物素羧化酶,CT為羧基轉(zhuǎn)移酶。3.3ACACA基因突變與乳、肉品質(zhì)及乳脂肪酸組成相關(guān)性研究ACACA基因突變影響畜禽乳、肉品質(zhì)性狀及乳中脂肪酸組成。嶗山奶山羊ACACA基因PIII啟動(dòng)子區(qū)突變影響乳蛋白率、乳糖率、乳密度、300d產(chǎn)奶量[96]。荷斯坦奶牛和綿羊ACACA基因突變影響乳中脂肪酸組成[97,98]。韓牛ACACA基因g.2274G>A突變與眼肌面積顯著相關(guān)[99]。西班牙Churr綿羊ACACA基因15個(gè)SNPs顯著影響乳中脂肪酸的組成,4個(gè)SNPs顯著影響乳蛋白率和乳脂率[100]。豬ACACA基因S

側(cè)翼序列,牦牛,側(cè)翼序列,基因


牦牛ACACA基因遺傳特征及其對(duì)乳、肉品質(zhì)的影響192.1.1牦牛ACACA基因核心啟動(dòng)子區(qū)預(yù)測(cè)牦牛ACACA基因g.-1000~+1000區(qū)域預(yù)測(cè)結(jié)果表明有6處可能的核心區(qū)(表3-1),其中核心區(qū)1和2、2和3、4和5分別有重疊,第3和第4核心區(qū)的評(píng)分最高,說(shuō)明這兩個(gè)重疊區(qū)域最有可能成為該基因的核心啟動(dòng)子區(qū)。表3-1牦牛ACACA基因核心啟動(dòng)子區(qū)預(yù)測(cè)Table3-1PredictionofcorepromoterregionofyakACACAgene核心區(qū)Coreregion起始位點(diǎn)Startsite終止位點(diǎn)Endsite分值Score啟動(dòng)子序列(5"→3")PromoterSequence1-625-5750.83CGAGGCGGGGACCCAGCGGACCGTTCAGGGGGCGGGGCGCGGCCCCAGG2-596-5460.87GGGCGGGGCGCGGCCCCAGGGCTCAGTCCCGGCCCGCGGCGCCCTCCCCC3-574-5240.93GCCCGCGGCGCCCTCCCCCACCGCGCGGCGTGGCCCGTGCCTCACGCCCG4-338-2880.90TGCGGGCGGCGCAGGCGCGAGCGGGCCGCGCGCCCGCCGCCTCCGCCCAG5-314-2640.84GCCGCGCGCCCGCCGCCTCCGCCCAGTCCCCGCCCCGGCCGTCGAAGCCC6-240-1900.84TGGCTCGGCCCCCGTCCGGGGCTCTCGCCGCGCGCCCGCCGCCGGCCTCT2.1.2牦牛ACACA基因CpG島區(qū)預(yù)測(cè)牦牛ACACA基因g.-1000bp~+1000bp區(qū)域CpG島預(yù)測(cè)結(jié)果表明,該區(qū)域存在2個(gè)CpG島(圖3-4),第1個(gè)CpG島位于g.-795~-193區(qū)域,全長(zhǎng)603bp;第2個(gè)CpG島位于g.-183~+117區(qū)域,全長(zhǎng)300bp。且第3和第4核心區(qū)重疊區(qū)正好位于第1個(gè)CpG島區(qū)內(nèi)。因此設(shè)計(jì)兩對(duì)特異性引物BSP-1和BSP-2擴(kuò)增g.-795~-193區(qū)域。圖3-4牦牛ACACA基因5"側(cè)翼序列CpG島預(yù)測(cè)Figure3-4PredictionofCpGislandin5"flankingsequenceofyakACACAgene2.2牦牛ACACA基因PCR產(chǎn)物瓊脂糖電泳檢測(cè)牦牛ACACA基因啟動(dòng)子區(qū)引物BSP-1和BSP-2的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物1.5%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)結(jié)果見(jiàn)圖3-5。目的條帶清晰,可用于克隆檢測(cè)。

【參考文獻(xiàn)】:
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本文編號(hào):2900106

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